RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PAK4O96013 591 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SPIN4Q56A73 249 aa16.09■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OXR1Q8N573 874 aa16.09■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MEIOBQ8N635 442 aa16.09■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP16.09■□□□□ 0.17
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP16.09■□□□□ 0.17
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ABATP80404 500 aa16.09■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LMAN2Q12907 356 aa16.09■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NPAS3Q8IXF0 933 aa16.09■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OR4E2Q8NGC2 313 aa16.09■□□□□ 0.17
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ING4Q9UNL4 249 aa16.09■□□□□ 0.17
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF382Q96SR6 550 aa16.09■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DCSTAMPQ9H295 470 aa16.09■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa16.09■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PEX16Q9Y5Y5 336 aa16.09■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 A0A075B6Q4 140 aa16.09■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 H7BY64 318 aa16.09■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 B3GALT2O43825 422 aa16.09■□□□□ 0.17
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RB1P06400 928 aa16.09■□□□□ 0.17
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SH3BP2P78314 561 aa16.09■□□□□ 0.17
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FOXM1Q08050 763 aa16.09■□□□□ 0.17
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PRAP1Q96NZ9 151 aa16.09■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CCDC85CA6NKD9 419 aa16.08■□□□□ 0.17
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 KCNAB2Q13303 367 aa16.08■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OR4D1Q15615 310 aa16.08■□□□□ 0.17
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CITED4Q96RK1 184 aa16.08■□□□□ 0.17
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FABP12A6NFH5 140 aa16.08■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TSPAN9O75954 239 aa16.08■□□□□ 0.16
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGFALSP35858 605 aa16.08■□□□□ 0.16
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SAGE2PA6NJ88 616 aa16.08■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 FPR1P21462 350 aa16.08■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 DDX6P26196 483 aaKnown RBP eCLIP16.08■□□□□ 0.169e-9■■■■■ 49.4
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ACADVLP49748 655 aa16.08■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 NOXRED1Q6NXP6 359 aa16.08■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 HMGN2P46Q86SG4 172 aa16.08■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TMC8Q8IU68 726 aa16.08■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 XKR8Q9H6D3 395 aa16.08■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SNX7Q9UNH6 387 aa16.08■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 A8MUA0 341 aa16.07■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PFKMP08237 780 aa16.07■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CSF2RAP15509 400 aa16.07■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PCSK2P16519 638 aa16.07■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF30P17039 623 aa16.07■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RPS6KA3P51812 740 aa16.07■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GALNT10Q86SR1 603 aa16.07■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 AQP11Q8NBQ7 271 aa16.07■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C3orf58Q8NDZ4 430 aa16.07■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GRHL3Q8TE85 626 aa16.07■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 POF1BQ8WVV4 589 aa16.07■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP16.07■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IRF7Q92985 503 aa16.07■□□□□ 0.16
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MYH7BA7E2Y1 1941 aa16.07■□□□□ 0.16
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