RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000477529.1

SRRT-210, Transcript of serrate, RNA effector molecule, humanhuman

TSL 2

Gene SRRT, Length 540 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRT-210ENST00000477529 WDR47O94967 919 aa13.4□□□□□ -0.26
SRRT-210ENST00000477529 ALBP02768 609 aa13.4□□□□□ -0.26
SRRT-210ENST00000477529 C2P06681 752 aa13.4□□□□□ -0.26
SRRT-210ENST00000477529 UMODP07911 640 aa13.4□□□□□ -0.26
SRRT-210ENST00000477529 ABHD2P08910 425 aa13.4□□□□□ -0.26
SRRT-210ENST00000477529 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
SRRT-210ENST00000477529 FAM153BP0C7A2 387 aa13.4□□□□□ -0.26
SRRT-210ENST00000477529 MYBL2P10244 700 aa13.4□□□□□ -0.26
SRRT-210ENST00000477529 CRABP2P29373 138 aa13.4□□□□□ -0.26
SRRT-210ENST00000477529 SERPINB8P50452 374 aa13.4□□□□□ -0.26
SRRT-210ENST00000477529 CCR8P51685 355 aa13.4□□□□□ -0.26
SRRT-210ENST00000477529 KCNAB2Q13303 367 aa13.4□□□□□ -0.26
SRRT-210ENST00000477529 NKG7Q16617 165 aa13.4□□□□□ -0.26
SRRT-210ENST00000477529 FAM153CQ494X1 144 aa13.4□□□□□ -0.26
SRRT-210ENST00000477529 TEX35Q5T0J7 233 aa13.4□□□□□ -0.26
SRRT-210ENST00000477529 GARNL3Q5VVW2 1013 aa13.4□□□□□ -0.26
SRRT-210ENST00000477529 PRMT9Q6P2P2 845 aa13.4□□□□□ -0.26
SRRT-210ENST00000477529 OVCH1Q7RTY7 1134 aa13.4□□□□□ -0.26
SRRT-210ENST00000477529 CCDC91Q7Z6B0 441 aa13.4□□□□□ -0.26
SRRT-210ENST00000477529 MRGPREQ86SM8 312 aa13.4□□□□□ -0.26
SRRT-210ENST00000477529 TMPRSS11BQ86T26 416 aa13.4□□□□□ -0.26
SRRT-210ENST00000477529 ISCA2Q86U28 154 aa13.4□□□□□ -0.26
SRRT-210ENST00000477529 GPSM1Q86YR5 675 aa13.4□□□□□ -0.26
SRRT-210ENST00000477529 APLFQ8IW19 511 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
SRRT-210ENST00000477529 ZNF843Q8N446 348 aa13.4□□□□□ -0.26
SRRT-210ENST00000477529 AMER3Q8N944 861 aa13.4□□□□□ -0.26
SRRT-210ENST00000477529 ZNF740Q8NDX6 193 aa13.4□□□□□ -0.26
SRRT-210ENST00000477529 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP13.4□□□□□ -0.26
SRRT-210ENST00000477529 DCAKDQ8WVC6 231 aa13.4□□□□□ -0.26
SRRT-210ENST00000477529 KCTD4Q8WVF5 259 aa13.4□□□□□ -0.26
SRRT-210ENST00000477529 THAP4Q8WY91 577 aa13.4□□□□□ -0.26
SRRT-210ENST00000477529 EXT2Q93063 718 aa13.4□□□□□ -0.26
SRRT-210ENST00000477529 ISL2Q96A47 359 aa13.4□□□□□ -0.26
SRRT-210ENST00000477529 TM4SF19Q96DZ7 209 aa13.4□□□□□ -0.26
SRRT-210ENST00000477529 MVB12AQ96EY5 273 aa13.4□□□□□ -0.26
SRRT-210ENST00000477529 ATOH8Q96SQ7 321 aa13.4□□□□□ -0.26
SRRT-210ENST00000477529 TRIM55Q9BYV6 548 aa13.4□□□□□ -0.26
SRRT-210ENST00000477529 DRC3Q9H069 523 aa13.4□□□□□ -0.26
SRRT-210ENST00000477529 ALG9Q9H6U8 611 aa13.4□□□□□ -0.26
SRRT-210ENST00000477529 TUBD1Q9UJT1 453 aa13.4□□□□□ -0.26
SRRT-210ENST00000477529 TRBC2A0A5B9 178 aa13.39□□□□□ -0.27
SRRT-210ENST00000477529 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
SRRT-210ENST00000477529 FOXS1O43638 330 aa13.39□□□□□ -0.27
SRRT-210ENST00000477529 KERAO60938 352 aa13.39□□□□□ -0.27
SRRT-210ENST00000477529 INHBAP08476 426 aa13.39□□□□□ -0.27
SRRT-210ENST00000477529 CD63P08962 238 aa13.39□□□□□ -0.27
SRRT-210ENST00000477529 PIM1P11309 404 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
SRRT-210ENST00000477529 TFEBP19484 476 aa13.39□□□□□ -0.27
SRRT-210ENST00000477529 FBLP22087 321 aaKnown RBP13.39□□□□□ -0.27
SRRT-210ENST00000477529 OTX2P32243 289 aa13.39□□□□□ -0.27
SRRT-210ENST00000477529 GRK3P35626 688 aa13.39□□□□□ -0.27
SRRT-210ENST00000477529 GGT5P36269 586 aa13.39□□□□□ -0.27
SRRT-210ENST00000477529 SLC26A3P40879 764 aa13.39□□□□□ -0.27
SRRT-210ENST00000477529 GDF5P43026 501 aa13.39□□□□□ -0.27
SRRT-210ENST00000477529 MAGEA12P43365 314 aa13.39□□□□□ -0.27
SRRT-210ENST00000477529 KCNC1P48547 511 aa13.39□□□□□ -0.27
SRRT-210ENST00000477529 REEP5Q00765 189 aa13.39□□□□□ -0.27
SRRT-210ENST00000477529 CHAF1BQ13112 559 aa13.39□□□□□ -0.27
SRRT-210ENST00000477529 ATP1A4Q13733 1029 aa13.39□□□□□ -0.27
SRRT-210ENST00000477529 FBXO48Q5FWF7 155 aa13.39□□□□□ -0.27
SRRT-210ENST00000477529 CDKL4Q5MAI5 379 aa13.39□□□□□ -0.27
SRRT-210ENST00000477529 PRSS41Q7RTY9 318 aa13.39□□□□□ -0.27
SRRT-210ENST00000477529 ASPGQ86U10 573 aa13.39□□□□□ -0.27
SRRT-210ENST00000477529 RAB43Q86YS6 212 aa13.39□□□□□ -0.27
SRRT-210ENST00000477529 TCAIMQ8N3R3 496 aa13.39□□□□□ -0.27
SRRT-210ENST00000477529 MFSD9Q8NBP5 474 aa13.39□□□□□ -0.27
SRRT-210ENST00000477529 NXNL1Q96CM4 212 aa13.39□□□□□ -0.27
SRRT-210ENST00000477529 THAP11Q96EK4 314 aa13.39□□□□□ -0.27
SRRT-210ENST00000477529 MACROD1Q9BQ69 325 aa13.39□□□□□ -0.27
SRRT-210ENST00000477529 EPB41L4BQ9H329 900 aa13.39□□□□□ -0.27
SRRT-210ENST00000477529 PELI2Q9HAT8 420 aa13.39□□□□□ -0.27
SRRT-210ENST00000477529 NMRAL1Q9HBL8 299 aa13.39□□□□□ -0.27
SRRT-210ENST00000477529 ZNF304Q9HCX3 659 aa13.39□□□□□ -0.27
SRRT-210ENST00000477529 WWOXQ9NZC7 414 aa13.39□□□□□ -0.27
SRRT-210ENST00000477529 NUDT4Q9NZJ9 180 aa13.39□□□□□ -0.27
SRRT-210ENST00000477529 RNF112Q9ULX5 631 aa13.39□□□□□ -0.27
SRRT-210ENST00000477529 ACOT9Q9Y305 439 aa13.39□□□□□ -0.27
SRRT-210ENST00000477529 DYRK1BQ9Y463 629 aa13.39□□□□□ -0.27
SRRT-210ENST00000477529 ASB1Q9Y576 335 aa13.39□□□□□ -0.27
SRRT-210ENST00000477529 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa13.38□□□□□ -0.27
SRRT-210ENST00000477529 A0A087X1B8 175 aa13.38□□□□□ -0.27
SRRT-210ENST00000477529 A0A096LPK6 155 aa13.38□□□□□ -0.27
SRRT-210ENST00000477529 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa13.38□□□□□ -0.27
SRRT-210ENST00000477529 ARGFXA6NJG6 315 aa13.38□□□□□ -0.27
SRRT-210ENST00000477529 VSTM2BA6NLU5 285 aa13.38□□□□□ -0.27
SRRT-210ENST00000477529 POC1B-GALNT4F8VUJ3 575 aa13.38□□□□□ -0.27
SRRT-210ENST00000477529 RIPK2O43353 540 aa13.38□□□□□ -0.27
SRRT-210ENST00000477529 OR1F1O43749 312 aa13.38□□□□□ -0.27
SRRT-210ENST00000477529 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP13.38□□□□□ -0.27
SRRT-210ENST00000477529 RFPL1O75677 317 aa13.38□□□□□ -0.27
SRRT-210ENST00000477529 IPO13O94829 963 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
SRRT-210ENST00000477529 SLC35G6P0C7Q6 338 aa13.38□□□□□ -0.27
SRRT-210ENST00000477529 GCAP28676 217 aa13.38□□□□□ -0.27
SRRT-210ENST00000477529 HSPA7P48741 367 aa13.38□□□□□ -0.27
SRRT-210ENST00000477529 DSG2Q14126 1118 aa13.38□□□□□ -0.27
SRRT-210ENST00000477529 FAM53BQ14153 422 aa13.38□□□□□ -0.27
SRRT-210ENST00000477529 SULT1C3Q6IMI6 304 aa13.38□□□□□ -0.27
SRRT-210ENST00000477529 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
SRRT-210ENST00000477529 NXPE4Q6UWF7 544 aa13.38□□□□□ -0.27
SRRT-210ENST00000477529 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.5 ms