RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000450865.2

VNN3-210, Transcript of vanin 3, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene VNN3, Length 596 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3-210ENST00000450865 ATP6V1E2Q96A05 226 aa6.56□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 ESAMQ96AP7 390 aa6.56□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 TLCD1Q96CP7 247 aa6.56□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 CCDC126Q96EE4 140 aa6.56□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 CCDC74BQ96LY2 380 aa6.56□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 DEPDC7Q96QD5 511 aa6.56□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 CD180Q99467 661 aa6.56□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 SH3GL2Q99962 352 aa6.56□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 HAUS8Q9BT25 410 aa6.56□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 MENTQ9BUN1 341 aa6.56□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 STRADBQ9C0K7 418 aa6.56□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 NRSN2Q9GZP1 204 aa6.56□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 PCBD2Q9H0N5 130 aa6.56□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 MED4Q9NPJ6 270 aa6.56□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 DNAJC11Q9NVH1 559 aa6.56□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 IRAK4Q9NWZ3 460 aa6.56□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 OGFRQ9NZT2 677 aa6.56□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 AKAP7Q9P0M2 348 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 TMEM9Q9P0T7 183 aa6.56□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 COPG2Q9UBF2 871 aa6.56□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 EMCNQ9ULC0 261 aa6.56□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 CLCA2Q9UQC9 943 aa6.56□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 SLC22A14Q9Y267 594 aa6.56□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 PLLPQ9Y342 182 aa6.56□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP6.56□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP6.56□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 WDR91A4D1P6 747 aa6.55□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 E7EQ34 232 aa6.55□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 K7EPI3 171 aa6.55□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP6.55□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 ATP8B1O43520 1251 aa6.55□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 DLX3O60479 287 aa6.55□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 ICMTO60725 284 aa6.55□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 CSO75390 466 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 KATNA1O75449 491 aa6.55□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 SUPT7LO94864 414 aa6.55□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 THRAP10827 490 aa6.55□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 CDH1P12830 882 aa6.55□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 MTHFD2P13995 350 aa6.55□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 PVRP15151 417 aa6.55□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 GNAZP19086 355 aa6.55□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 NR1D1P20393 614 aa6.55□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 PRDX3P30048 256 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP6.55□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 GRK3P35626 688 aa6.55□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 SLC6A12P48065 614 aa6.55□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 KCNC1P48547 511 aa6.55□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 SERPINB4P48594 390 aa6.55□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 AGTR2P50052 363 aa6.55□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 CCNG1P51959 295 aa6.55□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 INHBCP55103 352 aa6.55□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 CLDN6P56747 220 aa6.55□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 HERVK_113P63132 956 aa6.55□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 PPP2R2AP63151 447 aa6.55□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 NFKB2Q00653 900 aa6.55□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 GTF2H2Q13888 395 aa6.55□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 PCLAFQ15004 111 aa6.55□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 POU4F3Q15319 338 aa6.55□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 SLC5A12Q1EHB4 618 aa6.55□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 DEFB110Q30KQ9 67 aa6.55□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa6.55□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 TMTC4Q5T4D3 741 aa6.55□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 LIPMQ5VYY2 423 aa6.55□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa6.55□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 TMEM71Q6P5X7 295 aa6.55□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 LCTLQ6UWM7 567 aa6.55□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 PRSS42Q7Z5A4 293 aa6.55□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa6.55□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa6.55□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 ZAR1Q86SH2 424 aa6.55□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 SLCO6A1Q86UG4 719 aa6.55□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 FAM129CQ86XR2 697 aa6.55□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 TBC1D19Q8N5T2 526 aa6.55□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 TEX9Q8N6V9 391 aa6.55□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 C19orf47Q8N9M1 422 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 RCBTB1Q8NDN9 531 aa6.55□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 OR2L3Q8NG85 312 aa6.55□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 OR2A1Q8NGT9 310 aa6.55□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 OR56A3Q8NH54 315 aa6.55□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 SLC5A11Q8WWX8 675 aa6.55□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 TMEM74Q96NL1 305 aa6.55□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 TMEM237Q96Q45 408 aa6.55□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 OR2A14Q96R47 310 aa6.55□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 MAP3K3Q99759 626 aa6.55□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 MECRQ9BV79 373 aa6.55□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 SGPP1Q9BX95 441 aa6.55□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 ERVK-6Q9BXR3 956 aa6.55□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 CD244Q9BZW8 370 aa6.55□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 RAB33BQ9H082 229 aa6.55□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 SEMA6CQ9H3T2 930 aa6.55□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 ACTR8Q9H981 624 aa6.55□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 FANCEQ9HB96 536 aa6.55□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 KLHL20Q9Y2M5 609 aa6.55□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 KCNE2Q9Y6J6 123 aa6.55□□□□□ -1.36
VNN3-210ENST00000450865 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.3 ms