RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439892.5

PCBP1-AS1-231, PCBP1 antisense RNA 1, human

TSL 4

Gene PCBP1-AS1, Length 578 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	CDH11	P55287	796 aa		5.34	□□□□□ -1.55
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	PITX1	P78337	314 aa	Predicted RBP	5.34	□□□□□ -1.55
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	SLC34A1	Q06495	639 aa		5.34	□□□□□ -1.55
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	CCDC142	Q17RM4	750 aa		5.34	□□□□□ -1.55
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	ITPRIPL2	Q3MIP1	535 aa		5.34	□□□□□ -1.55
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	SIRPB2	Q5JXA9	342 aa		5.34	□□□□□ -1.55
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	FAM46C	Q5VWP2	391 aa		5.34	□□□□□ -1.55
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	ZNF772	Q68DY9	489 aa	Predicted RBP	5.34	□□□□□ -1.55
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	CTR9	Q6PD62	1173 aa		5.34	□□□□□ -1.55
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	PODNL1	Q6PEZ8	512 aa		5.34	□□□□□ -1.55
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	TUBA1A	Q71U36	451 aa		5.34	□□□□□ -1.55
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	PLD3	Q8IV08	490 aa		5.34	□□□□□ -1.55
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	CROCCP3	Q8IVE0	287 aa		5.34	□□□□□ -1.55
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	CNTN4	Q8IWV2	1026 aa		5.34	□□□□□ -1.55
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	CTAGE4	Q8IX94	777 aa		5.34	□□□□□ -1.55
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	ZNF441	Q8N8Z8	693 aa		5.34	□□□□□ -1.55
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	ZNF473	Q8WTR7	871 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	SCRN2	Q96FV2	425 aa		5.34	□□□□□ -1.55
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	C17orf77	Q96MU5	243 aa		5.34	□□□□□ -1.55
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	RUNDC3B	Q96NL0	473 aa		5.34	□□□□□ -1.55
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	RUFY1	Q96T51	708 aa		5.34	□□□□□ -1.55
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	NAP1L3	Q99457	506 aa	Predicted RBP	5.34	□□□□□ -1.55
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	PKP4	Q99569	1192 aa		5.34	□□□□□ -1.55
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	TUBA1C	Q9BQE3	449 aa		5.34	□□□□□ -1.55
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	UBQLN3	Q9H347	655 aa		5.34	□□□□□ -1.55
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	RNF121	Q9H920	327 aa		5.34	□□□□□ -1.55
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	CHD2	O14647	1828 aa	Known RBP	5.34	□□□□□ -1.55
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		5.34	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	NEXMIF	Q5QGS0	1516 aa		5.33	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	PTPRU	Q92729	1446 aa		5.33	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	YTHDC2	Q9H6S0	1430 aa	Known RBP	5.33	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	NPHP3	Q7Z494	1330 aa		5.33	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892		A0A0B4J203	849 aa		5.33	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	KRT87P	A6NCN2	255 aa		5.33	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	NPIPA3	F8WFD2	350 aa		5.33	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	B3GALNT1	O75752	331 aa		5.33	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	BMP15	O95972	392 aa		5.33	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	IGHV4-39	P01824	125 aa		5.33	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	SERPING1	P05155	500 aa		5.33	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	SP9	P0CG40	484 aa		5.33	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	FER	P16591	822 aa		5.33	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	5.33	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	BPIFB3	P59826	476 aa		5.33	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	HERV-K104	P61576	105 aa		5.33	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	RASGEF1B	Q0VAM2	473 aa		5.33	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	PHLDA2	Q53GA4	152 aa		5.33	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	TOR1AIP1	Q5JTV8	583 aa		5.33	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	SLC35D3	Q5M8T2	416 aa		5.33	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	FAM166A	Q6J272	317 aa		5.33	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	BTNL8	Q6UX41	500 aa		5.33	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		5.33	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	DNAJC22	Q8N4W6	341 aa		5.33	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	OR2T12	Q8NG77	320 aa		5.33	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		5.33	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	PHLDA1	Q8WV24	401 aa	Predicted RBP	5.33	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	PIGB	Q92521	554 aa		5.33	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	5.33	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	NEUROG1	Q92886	237 aa		5.33	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	ZNF778	Q96MU6	729 aa		5.33	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	TSSK2	Q96PF2	358 aa		5.33	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	TMEM237	Q96Q45	408 aa		5.33	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	PANX3	Q96QZ0	392 aa		5.33	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	FAM49A	Q9H0Q0	323 aa	Predicted RBP	5.33	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	C1orf21	Q9H246	121 aa		5.33	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	5.33	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	GPR173	Q9NS66	373 aa		5.33	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		5.33	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	SLC12A6	Q9UHW9	1150 aa		5.33	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	ALK	Q9UM73	1620 aa		5.33	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	5.32	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	ABCC11	Q96J66	1382 aa		5.32	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	5.32	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892		O00370	1275 aa		5.32	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	HSF2BP	O75031	334 aa		5.32	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	BCAS2	O75934	225 aa	Predicted RBP	5.32	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	CCDC192	P0DO97	292 aa		5.32	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	FGF5	P12034	268 aa		5.32	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	CPA3	P15088	417 aa		5.32	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	SSTR1	P30872	391 aa		5.32	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	MAZ	P56270	477 aa	Known RBP	5.32	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	GFPT1	Q06210	699 aa	Predicted RBP	5.32	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	LGALS3BP	Q08380	585 aa		5.32	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	TRAP1	Q12931	704 aa	Known RBP	5.32	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	C20orf194	Q5TEA3	1177 aa		5.32	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	PRSS42	Q7Z5A4	293 aa		5.32	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	GPR141	Q7Z602	305 aa		5.32	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	AQP12A	Q8IXF9	295 aa		5.32	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	APCDD1	Q8J025	514 aa		5.32	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		5.32	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	HSD17B8	Q92506	261 aa		5.32	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	IGSF21	Q96ID5	467 aa		5.32	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	ZNF48	Q96MX3	618 aa	Predicted RBP	5.32	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	RIMS4	Q9H426	269 aa	Predicted RBP	5.32	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	TLE6	Q9H808	572 aa		5.32	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	C10orf88	Q9H8K7	445 aa		5.32	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	FAM118A	Q9NWS6	357 aa		5.32	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	STUB1	Q9UNE7	303 aa		5.32	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		5.31	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		5.31	□□□□□ -1.56
PCBP1-AS1-231	ENST00000439892	PLEKHH1	Q9ULM0	1364 aa		5.31	□□□□□ -1.56

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.3 ms