RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425989.5

HDLBP-211, Transcript of high density lipoprotein binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene HDLBP, Length 530 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDLBP-211ENST00000425989 PROKR1Q8TCW9 393 aa9.23□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 MCUR1Q96AQ8 359 aa9.23□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 RGMAQ96B86 450 aa9.23□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 TESCQ96BS2 214 aa9.23□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 MTERF3Q96E29 417 aa9.23□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 PRAP1Q96NZ9 151 aa9.23□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 ELF4Q99607 663 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 ROGDIQ9GZN7 287 aa9.23□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 CHRNA10Q9GZZ6 450 aa9.23□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 PRM3Q9NNZ6 103 aa9.23□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 CCDC167Q9P0B6 97 aa9.23□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 PLAGL1Q9UM63 463 aa9.23□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP9.23□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 CACNA1EQ15878 2313 aa9.22□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa9.22□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa9.22□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 CCDC154A6NI56 674 aa9.22□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 MAGEB17A8MXT2 336 aa9.22□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 HRO43593 1189 aa9.22□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 OR1F1O43749 312 aa9.22□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 EML2O95834 649 aa9.22□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 SYPP08247 313 aa9.22□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 ALPPL2P10696 532 aa9.22□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 PNLIPP16233 465 aa9.22□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 AVPR2P30518 371 aa9.22□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 PGM1P36871 562 aa9.22□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 RAP1GDS1P52306 607 aa9.22□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 DIO3P55073 304 aa9.22□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 RPS13P62277 151 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 RPL38P63173 70 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 HMGCS1Q01581 520 aa9.22□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 DMWDQ09019 674 aa9.22□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 C1orf61Q13536 156 aa9.22□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 RCAN2Q14206 197 aa9.22□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 GPR18Q14330 331 aa9.22□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF423Q2M1K9 1284 aa9.22□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF425Q6IV72 752 aa9.22□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 NIPAL1Q6NVV3 410 aa9.22□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 PAOXQ6QHF9 649 aa9.22□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 TSSK4Q6SA08 328 aa9.22□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 RINLQ6ZS11 566 aa9.22□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 ARPINQ7Z6K5 226 aa9.22□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 FUNDC1Q8IVP5 155 aa9.22□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 PGAM4Q8N0Y7 254 aa9.22□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 ARL14Q8N4G2 192 aa9.22□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 MINDY1Q8N5J2 469 aa9.22□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 DPP10Q8N608 796 aa9.22□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 MFSD9Q8NBP5 474 aa9.22□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 ZBTB44Q8NCP5 570 aa9.22□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF548Q8NEK5 533 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 GPR156Q8NFN8 814 aa9.22□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 SLC37A2Q8TED4 501 aa9.22□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 SPDL1Q96EA4 605 aa9.22□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 OR2A14Q96R47 310 aa9.22□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 CD180Q99467 661 aa9.22□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 MTERF1Q99551 399 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 SLC38A3Q99624 504 aa9.22□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 SH3GL1Q99961 368 aa9.22□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 DPH7Q9BTV6 452 aa9.22□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 ACAT2Q9BWD1 397 aa9.22□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 XKR8Q9H6D3 395 aa9.22□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 RMND5AQ9H871 391 aa9.22□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 DMRT3Q9NQL9 472 aa9.22□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 EVA1BQ9NVM1 165 aa9.22□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 HRASLS2Q9NWW9 162 aa9.22□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 ACTR10Q9NZ32 417 aa9.22□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 EPHA6Q9UF33 1036 aa9.22□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 CIDEBQ9UHD4 219 aa9.22□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 MCM8Q9UJA3 840 aa9.22□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 CROTQ9UKG9 612 aa9.22□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 SLC6A14Q9UN76 642 aa9.22□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa9.22□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 TNRC6BQ9UPQ9 1833 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 CROCCQ5TZA2 2017 aa9.21□□□□□ -0.93
HDLBP-211ENST00000425989 A0A088AWK7 358 aa9.21□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 A0A1B0GVT2 93 aa9.21□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 KRT87PA6NCN2 255 aa9.21□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 OR6C74A6NCV1 312 aa9.21□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 OR5K3A6NET4 321 aa9.21□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 RHPN2P1A8MT19 583 aa9.21□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 BTN3A3O00478 584 aa9.21□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 AIM2O14862 343 aa9.21□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 ANKRD28O15084 1053 aa9.21□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 SRPX2O60687 465 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 EEDO75530 441 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 UBXN7O94888 489 aa9.21□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 GLB1P16278 677 aa9.21□□□□□ -0.94
HDLBP-211ENST00000425989 ZNF10P21506 573 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.7 ms