RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425660.5

ACTB-204, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 1,845 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-204ENST00000425660 PRAP1Q96NZ9 151 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 SARGQ9BW04 601 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 EBPLQ9BY08 206 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 GSDMCQ9BYG8 508 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 NANOGQ9H9S0 305 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 S100A14Q9HCY8 104 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 MAPRE3Q9UPY8 281 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 NDUFS2O75306 463 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 SEMA3DO95025 777 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 KCNH1O95259 989 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 TGFB1P01137 390 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 PEBP1P30086 187 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 PXNP49023 591 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 BLKP51451 505 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 SLC34A1Q06495 639 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 FXNQ16595 210 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 COMMD6Q7Z4G1 85 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 CAMKMTQ7Z624 323 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 IQCHQ86VS3 1027 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 MFSD2AQ8NA29 543 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 OR2L3Q8NG85 312 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 OR8J3Q8NGG0 315 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 OR8J2Q8NGG1 315 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 DNAJB14Q8TBM8 379 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 SLC26A7Q8TE54 656 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 CXorf40BQ96DE9 158 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 OR52E6Q96RD3 313 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 CGREF1Q99674 301 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 IER2Q9BTL4 223 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 SERHLQ9NQF3 203 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 USP34Q70CQ2 3546 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 MUC3AQ02505 3323 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTB-204ENST00000425660 TRBV5-3A0A0A0MS03 114 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTB-204ENST00000425660 A0A1W2PR77 199 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTB-204ENST00000425660 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
ACTB-204ENST00000425660 S100A3P33764 101 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTB-204ENST00000425660 ERFP50548 548 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTB-204ENST00000425660 EEFSECP57772 596 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
ACTB-204ENST00000425660 UGT8Q16880 541 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTB-204ENST00000425660 RABL3Q5HYI8 236 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTB-204ENST00000425660 LRIF1Q5T3J3 769 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTB-204ENST00000425660 MAMSTRQ6ZN01 415 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTB-204ENST00000425660 LCN9Q8WX39 176 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTB-204ENST00000425660 SNX19Q92543 992 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTB-204ENST00000425660 NECAB3Q96P71 396 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
ACTB-204ENST00000425660 OR51B5Q9H339 312 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTB-204ENST00000425660 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
ACTB-204ENST00000425660 POT1Q9NUX5 634 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTB-204ENST00000425660 TAAR2Q9P1P5 351 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTB-204ENST00000425660 STOML1Q9UBI4 398 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTB-204ENST00000425660 SIT1Q9Y3P8 196 aa14.58□□□□□ -0.08
ACTB-204ENST00000425660 ANKDD1BA6NHY2 528 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-204ENST00000425660 K7ESF4 209 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-204ENST00000425660 PCDH7O60245 1069 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-204ENST00000425660 ERN1O75460 977 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
ACTB-204ENST00000425660 CHRM5P08912 532 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
ACTB-204ENST00000425660 HRH2P25021 359 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-204ENST00000425660 GSTM2P28161 218 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-204ENST00000425660 KIR3DL1P43629 444 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-204ENST00000425660 ZNF763Q0D2J5 394 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-204ENST00000425660 BNIP2Q12982 314 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-204ENST00000425660 RBBP5Q15291 538 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
ACTB-204ENST00000425660 TCEA2Q15560 299 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-204ENST00000425660 DEPDC1Q5TB30 811 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-204ENST00000425660 GPR180Q86V85 440 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-204ENST00000425660 ADGRF3Q8IZF5 1079 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-204ENST00000425660 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
ACTB-204ENST00000425660 GPR156Q8NFN8 814 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-204ENST00000425660 TTLQ8NG68 377 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-204ENST00000425660 PYDC1Q8WXC3 89 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-204ENST00000425660 ANKRD27Q96NW4 1050 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-204ENST00000425660 MS4A8Q9BY19 250 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-204ENST00000425660 PCDHAC1Q9H158 963 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-204ENST00000425660 KCNH6Q9H252 994 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-204ENST00000425660 ALG2Q9H553 416 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-204ENST00000425660 RMND5AQ9H871 391 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-204ENST00000425660 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
ACTB-204ENST00000425660 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-204ENST00000425660 TMEM184CQ9NVA4 438 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-204ENST00000425660 SPHK1Q9NYA1 384 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-204ENST00000425660 VAPAQ9P0L0 249 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-204ENST00000425660 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-204ENST00000425660 A0A0G2JNG1 304 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-204ENST00000425660 TRBC2A0A5B9 178 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-204ENST00000425660 OR5K4A6NMS3 321 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-204ENST00000425660 H3BNX3 289 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-204ENST00000425660 KIR2DS3K7RE56 304 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-204ENST00000425660 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
ACTB-204ENST00000425660 DNAJA2O60884 412 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-204ENST00000425660 SCN2BO60939 215 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-204ENST00000425660 SH3BGRLO75368 114 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-204ENST00000425660 CCNDBP1O95273 360 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-204ENST00000425660 ANPEPP15144 967 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-204ENST00000425660 HOXB9P17482 250 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
ACTB-204ENST00000425660 PTPN6P29350 595 aa14.57□□□□□ -0.08
ACTB-204ENST00000425660 CXCL12P48061 93 aa14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms