RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398073.6

CTDSP2-201, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 4,795 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-201ENST00000398073 SEC14L4Q9UDX3 406 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 C8AP07357 584 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 CMPK1P30085 196 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 AP3S2P59780 193 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 CD47Q08722 323 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 RCAN2Q14206 197 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 TXNDC8Q6A555 127 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 AMZ2Q86W34 360 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 COMMD2Q86X83 199 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 KLHL36Q8N4N3 616 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC15A4Q8N697 577 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 GPR150Q8NGU9 434 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 SNX33Q8WV41 574 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 OVCA2Q8WZ82 227 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 KAT2AQ92830 837 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 TMEM203Q969S6 136 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 BRINP2Q9C0B6 783 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 LHPPQ9H008 270 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 NEUROD4Q9HD90 331 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 SLITRK5O94991 958 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 CTSEP14091 401 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 HTR6P50406 440 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 ERVPABLB-1P60509 514 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF763Q0D2J5 394 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 NPRL3Q12980 569 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF181Q2M3W8 571 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 LIPJQ5W064 366 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 DTWD1Q8N5C7 304 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 ACVR1CQ8NER5 493 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 ABHD11Q8NFV4 315 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 OSER1Q9NX31 292 aa15.88■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 NFATC1O95644 943 aa15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 PDYNP01213 254 aa15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 KCNA5P22460 613 aa15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 VIPR1P32241 457 aa15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 PCDH1Q08174 1060 aa15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 ALPPP05187 535 aa15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC11A1P49279 550 aa15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 RBBP4Q09028 425 aa15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 WSCD2Q2TBF2 565 aa15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 OR10H4Q8NGA5 316 aa15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 OR10G6Q8NH81 332 aa15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 SH3RF2Q8TEC5 729 aa15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC30A3Q99726 388 aa15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 DOHHQ9BU89 302 aa15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 MBD2Q9UBB5 411 aa15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 CDRT1O95170 752 aa15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 DGKGP49619 791 aa15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 TAS2R50P59544 299 aa15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 RPS13P62277 151 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 SLC9A5Q14940 896 aa15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 C10orf62Q5T681 223 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF367Q7RTV3 350 aa15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 SERINC5Q86VE9 423 aa15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 ZNF280BQ86YH2 543 aa15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 FAM110BQ8TC76 370 aa15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 TMEM80Q96HE8 168 aa15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 MYOCQ99972 504 aa15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 WDR83Q9BRX9 315 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 ARNT2Q9HBZ2 717 aa15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 STON1Q9Y6Q2 735 aa15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 ITGB4P16144 1822 aa15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 REM1O75628 298 aa15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 C6orf47O95873 294 aa15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 HMGCLP35914 325 aa15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 CCR8P51685 355 aa15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 IST1P53990 364 aa15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 FOXA1P55317 472 aa15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 IDNKQ5T6J7 187 aa15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 SUN5Q8TC36 379 aa15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 PDCD10Q9BUL8 212 aa15.87■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 COL18A1P39060 1754 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 MAGEB3O15480 346 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 JUNP05412 331 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 RETP07949 1114 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 OXTRP30559 389 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 NCBP2P52298 156 aaKnown RBP eCLIP15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 ARPC4P59998 168 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 PRKCZQ05513 592 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 PLPP4Q5VZY2 271 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 REEP3Q6NUK4 255 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 Q6ZVU0 165 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 TSPYL5Q86VY4 417 aaPredicted RBP15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 TICAM1Q8IUC6 712 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 TTLQ8NG68 377 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 OR4C6Q8NH72 309 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 SPATA9Q9BWV2 254 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 MGAT4BQ9UQ53 548 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 CHURC1-FNTBB4DL54 471 aa15.86■□□□□ 0.13
CTDSP2-201ENST00000398073 BDKRB1P46663 353 aa15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms