RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000397396.5

TSPAN4-202, Transcript of tetraspanin 4, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TSPAN4, Length 1,332 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN4-202ENST00000397396 MUC6Q6W4X9 2439 aa22.58■■□□□ 1.21
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TSPAN4-202ENST00000397396 CLEC3AO75596 197 aa22.58■■□□□ 1.21
TSPAN4-202ENST00000397396 RASSF9O75901 435 aa22.58■■□□□ 1.21
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TSPAN4-202ENST00000397396 ILKQ13418 452 aa22.58■■□□□ 1.21
TSPAN4-202ENST00000397396 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP22.58■■□□□ 1.21
TSPAN4-202ENST00000397396 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa22.58■■□□□ 1.21
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TSPAN4-202ENST00000397396 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP22.58■■□□□ 1.211e-6■■■■■ 92.8
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TSPAN4-202ENST00000397396 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
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TSPAN4-202ENST00000397396 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa22.58■■□□□ 1.21
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TSPAN4-202ENST00000397396 LSSP48449 732 aa22.57■■□□□ 1.2
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TSPAN4-202ENST00000397396 CACHD1Q5VU97 1274 aa22.57■■□□□ 1.2
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TSPAN4-202ENST00000397396 CBFA2T3O75081 653 aa22.57■■□□□ 1.2
TSPAN4-202ENST00000397396 ANKRD34CP0C6C1 535 aa22.57■■□□□ 1.2
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TSPAN4-202ENST00000397396 STPG1Q5TH74 334 aa22.57■■□□□ 1.2
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TSPAN4-202ENST00000397396 KLHL20Q9Y2M5 609 aa22.57■■□□□ 1.2
TSPAN4-202ENST00000397396 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa22.56■■□□□ 1.2
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TSPAN4-202ENST00000397396 PVRP15151 417 aa22.56■■□□□ 1.2
TSPAN4-202ENST00000397396 LBPP18428 481 aa22.56■■□□□ 1.2
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TSPAN4-202ENST00000397396 CHSY3Q70JA7 882 aa22.56■■□□□ 1.2
TSPAN4-202ENST00000397396 ANKRD53Q8N9V6 530 aa22.56■■□□□ 1.2
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TSPAN4-202ENST00000397396 GOLGA8OA6NCC3 632 aa22.55■■□□□ 1.2
TSPAN4-202ENST00000397396 MAGEB17A8MXT2 336 aa22.55■■□□□ 1.2
TSPAN4-202ENST00000397396 GOLGA8NF8WBI6 632 aa22.55■■□□□ 1.2
TSPAN4-202ENST00000397396 TXNDC9O14530 226 aa22.55■■□□□ 1.2
TSPAN4-202ENST00000397396 DCTN3O75935 186 aa22.55■■□□□ 1.2
TSPAN4-202ENST00000397396 SEMA3DO95025 777 aa22.55■■□□□ 1.2
TSPAN4-202ENST00000397396 ACADVLP49748 655 aa22.55■■□□□ 1.2
TSPAN4-202ENST00000397396 HSD11B2P80365 405 aa22.55■■□□□ 1.2
TSPAN4-202ENST00000397396 E2F1Q01094 437 aa22.55■■□□□ 1.2
TSPAN4-202ENST00000397396 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP22.55■■□□□ 1.2
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