RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000391203.1

RNA5SP299-201, Transcript of RNA, 5S ribosomal pseudogene 299, humanhuman

BASIC

Gene RNA5SP299, Length 116 nt, Biotype rRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNA5SP299-201ENST00000391203 ERVK-8P63133 956 aa0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 RACK1P63244 317 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 PAFAH1B2P68402 229 aa0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 NOP14P78316 857 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 PSPHP78330 225 aa0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 PITX1P78337 314 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 RPP38P78345 283 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 ELF3P78545 371 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 PHEXP78562 749 aa0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 ABATP80404 500 aa0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 TMPRSS15P98073 1019 aa0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 CYCSP99999 105 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 MPP1Q00013 466 aa0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 HOXC5Q00444 222 aa0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 CDKL1Q00532 357 aa0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 HSF1Q00613 529 aa0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 SORDQ00796 357 aa0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 PDE1BQ01064 536 aa0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 IL9RQ01113 521 aa0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 TSPY1Q01534 308 aa0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 SPIBQ01892 262 aa0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 OGDHQ02218 1023 aa0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 NHLH2Q02577 135 aa0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 PLOD1Q02809 727 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 NUCB1Q02818 461 aa0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 CREMQ03060 361 aa0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 HSF2Q03933 536 aa0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 UBXN1Q04323 297 aa0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 GBE1Q04446 702 aa0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 ACVR1Q04771 509 aa0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 GAD2Q05329 585 aa0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 ZBTB16Q05516 673 aa0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 LRRC63Q05C16 580 aa0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 DEUP1Q05D60 604 aa0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 FAM160A1Q05DH4 1040 aa0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 BTKQ06187 659 aa0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 TNFRSF9Q07011 255 aa0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 PPP3CAQ08209 521 aa0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 IL10RBQ08334 325 aa0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 PPIDQ08752 370 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 GOLGA8FQ08AF8 430 aa0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 C2orf54Q08AI8 447 aa0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 ZNF543Q08ER8 600 aa0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 KCNA1Q09470 495 aa0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 CCDC15Q0P6D6 951 aa0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 LRRC74AQ0VAA2 488 aa0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 MGAT2Q10469 447 aa0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 AP1B1Q10567 949 aa0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 TEFQ10587 303 aa0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 ST3GAL4Q11206 333 aa0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 MAP4K2Q12851 820 aa0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 BFSP1Q12934 665 aa0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 RALGDSQ12967 914 aa0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 BNIP1Q12981 228 aa0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 STRN3Q13033 797 aa0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 GAGE2BQ13066 116 aa0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 IKQ13123 557 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 PRKAA1Q13131 559 aa0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 BAMBIQ13145 260 aa0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 CBX3Q13185 183 aa0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 KLRD1Q13241 179 aa0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 MTA1Q13330 715 aa0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 PPP2R5CQ13362 524 aa0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 PDCLQ13371 301 aa0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 MAB21L1Q13394 359 aa0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 MTM1Q13496 603 aa0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 TRPC3Q13507 836 aa0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 GPR50Q13585 617 aa0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 PWP1Q13610 501 aa0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 CUL1Q13616 776 aa0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 CUL3Q13618 768 aa0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 SLC12A1Q13621 1099 aa0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 CDH18Q13634 790 aa0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 RAPSNQ13702 412 aa0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 RUNX3Q13761 415 aa0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 ITGA9Q13797 1035 aa0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 PKP1Q13835 747 aa0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 COTL1Q14019 142 aa0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP0.13□□□□□ -2.39
RNA5SP299-201ENST00000391203 RAB33AQ14088 237 aa0.13□□□□□ -2.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11 ms