RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC26A7Q8TE54 656 aa3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 EXOC4Q96A65 974 aa3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 C2orf48Q96LS8 159 aa3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM218AQ96MZ4 157 aa3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF300Q96RE9 604 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 USP28Q96RU2 1077 aa3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 MCRIP2Q9BUT9 160 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 CDK19Q9BWU1 502 aa3.3□□□□□ -1.88
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RABGGTB-202ENST00000370826 RNF121Q9H920 327 aa3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 IL36AQ9UHA7 158 aa3.3□□□□□ -1.88
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RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM150CB9EJG8 249 aa3.29□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 PRSS46E5RG02 174 aa3.29□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 H7C423 109 aa3.29□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP3.29□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 C9P02748 559 aa3.29□□□□□ -1.88
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RABGGTB-202ENST00000370826 PRKACGP22612 351 aa3.29□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 OR1D5P58170 312 aa3.29□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 DCDC1P59894 354 aa3.29□□□□□ -1.88
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RABGGTB-202ENST00000370826 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 MPP7Q5T2T1 576 aa3.29□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa3.29□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa3.29□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF613Q6PF04 617 aa3.29□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 TRIM65Q6PJ69 517 aa3.29□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 PET117Q6UWS5 81 aa3.29□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa3.29□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 PIGWQ7Z7B1 504 aa3.29□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 PRSS35Q8N3Z0 413 aa3.29□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 OR4C15Q8NGM1 316 aa3.29□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 NCOA7Q8NI08 942 aa3.29□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 ZNF519Q8TB69 540 aa3.29□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa3.29□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM162AQ96A26 154 aa3.29□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 ERO1AQ96HE7 468 aa3.29□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 SPATA17Q96L03 361 aa3.29□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 SPHK2Q9NRA0 654 aa3.29□□□□□ -1.88
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RABGGTB-202ENST00000370826 HACD3Q9P035 362 aa3.29□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 KLK4Q9Y5K2 254 aa3.29□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 POMT1Q9Y6A1 747 aa3.29□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 PRSS21Q9Y6M0 314 aa3.29□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 CSNK1G3Q9Y6M4 447 aa3.29□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 RNF215Q9Y6U7 377 aa3.29□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa3.29□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa3.28□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 MPTX1A8MV57 137 aa3.28□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 DCXO43602 365 aa3.28□□□□□ -1.88
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RABGGTB-202ENST00000370826 SSTR1P30872 391 aa3.28□□□□□ -1.88
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RABGGTB-202ENST00000370826 NECTIN1Q15223 517 aa3.28□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 FAAP20Q6NZ36 180 aa3.28□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 PRUNE1Q86TP1 453 aa3.28□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 CATSPERDQ86XM0 798 aa3.28□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa3.28□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 TCEANCQ8N8B7 351 aa3.28□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 MAPK1IP1LQ8NDC0 245 aa3.28□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 NUP37Q8NFH4 326 aa3.28□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 OR5T2Q8NGG2 359 aa3.28□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 TRAF3IP1Q8TDR0 691 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 CORO2AQ92828 525 aa3.28□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 RIT1Q92963 219 aa3.28□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 NXPE2Q96DL1 559 aa3.28□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 AK8Q96MA6 479 aa3.28□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 NSMCE3Q96MG7 304 aa3.28□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 CITED2Q99967 270 aaPredicted RBP3.28□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 HOXD1Q9GZZ0 328 aa3.28□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 C10orf88Q9H8K7 445 aa3.28□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 MINDY3Q9H8M7 445 aa3.28□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 FBXL4Q9UKA2 621 aa3.28□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 PILRBQ9UKJ0 227 aa3.28□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP3.28□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 SELENOKQ9Y6D0 94 aa3.28□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 TRAV18A0A075B6X5 111 aa3.27□□□□□ -1.89
RABGGTB-202ENST00000370826 A0A1B0GU03 582 aa3.27□□□□□ -1.89
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RABGGTB-202ENST00000370826 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
RABGGTB-202ENST00000370826 H3BMM5 538 aa3.27□□□□□ -1.89
RABGGTB-202ENST00000370826 SELENOFO60613 162 aa3.27□□□□□ -1.89
RABGGTB-202ENST00000370826 CYTIPO60759 359 aa3.27□□□□□ -1.89
RABGGTB-202ENST00000370826 SAP30O75446 220 aa3.27□□□□□ -1.89
RABGGTB-202ENST00000370826 CEACAM4O75871 244 aa3.27□□□□□ -1.89
RABGGTB-202ENST00000370826 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP3.27□□□□□ -1.89
RABGGTB-202ENST00000370826 MOCS2O96007 188 aaPredicted RBP3.27□□□□□ -1.89
RABGGTB-202ENST00000370826 GLULP15104 373 aa3.27□□□□□ -1.89
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