RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362825.1

RNU6-1128P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1128, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1128P, Length 109 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 BARHL1Q9BZE3 327 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SLC13A1Q9BZW2 595 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ADNPQ9H2P0 1102 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TUBA4BQ9H853 241 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 EXOC1Q9NV70 894 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 OSER1Q9NX31 292 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZSCAN32Q9NX65 697 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SLC17A4Q9Y2C5 497 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 EFR3BQ9Y2G0 817 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HEATR5AQ86XA9 2040 aa-3.83□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LRP5O75197 1615 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ELP1O95163 1332 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C2orf81A6NN90 581 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LEUTXA8MZ59 168 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 M0QZ58 72 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PRMT3O60678 531 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GPX1P07203 203 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CAPN3P20807 821 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PCYT1AP49585 367 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF157P51786 506 aaPredicted RBP-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NDST2P52849 883 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SLC12A3P55017 1021 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 EFNB1P98172 346 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 BSPH1Q075Z2 132 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SLC9A5Q14940 896 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PTPAQ15257 358 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MMDQ15546 238 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NFKBIBQ15653 356 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PPP1R3AQ16821 1122 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TMEM183BQ1AE95 376 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF718Q3SXZ3 478 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LINC00303Q3SY05 128 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TMEM255AQ5JRV8 349 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FKBP15Q5T1M5 1219 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HECTD3Q5T447 861 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PAQR3Q6TCH7 311 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NECAB2Q7Z6G3 386 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TMEM183AQ8IXX5 376 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TTC30BQ8N4P2 665 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DNAJC22Q8N4W6 341 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HORMAD2Q8N7B1 307 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LRRC75AQ8NAA5 344 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 OR4A5Q8NH83 315 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TSPEARQ8WU66 669 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DGCR8Q8WYQ5 773 aaKnown RBP eCLIP-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SUSD6Q92537 303 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 AURKBQ96GD4 344 aaPredicted RBP-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 APIPQ96GX9 242 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PHACTR3Q96KR7 559 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HARBI1Q96MB7 349 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NEK1Q96PY6 1258 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SLC26A8Q96RN1 970 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SLC6A7Q99884 636 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 C1orf43Q9BWL3 253 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HCAR1Q9BXC0 346 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RSPH6AQ9H0K4 717 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PRO3102Q9H379 93 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DUSP21Q9H596 190 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FNDC4Q9H6D8 234 aaPredicted RBP-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 BRD9Q9H8M2 597 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 AKIRIN1Q9H9L7 192 aaPredicted RBP-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CHODLQ9H9P2 273 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TVP23BQ9NYZ1 205 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TXNDC16Q9P2K2 825 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ACOT9Q9Y305 439 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GRIP1Q9Y3R0 1128 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TBX22Q9Y458 520 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TRIM17Q9Y577 477 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 INSL6Q9Y581 213 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CASP8AP2Q9UKL3 1982 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa-3.84□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 UNC13BO14795 1591 aa-3.85□□□□□ -3.02
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TNS3Q68CZ2 1445 aa-3.85□□□□□ -3.03
RNU6-1128P-201ENST00000362825 IGHV3-20A0A0C4DH32 117 aa-3.85□□□□□ -3.03
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GMNCA6NCL1 334 aa-3.85□□□□□ -3.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.7 ms