RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361198.9

LDB1-201, Transcript of LIM domain binding 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LDB1, Length 2,285 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDB1-201ENST00000361198 PDGFRLQ15198 375 aa21.81■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 ANKRD26P1Q6NSI1 321 aa21.81■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 VITQ6UXI7 678 aa21.81■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 SLCO4C1Q6ZQN7 724 aa21.81■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 GPR149Q86SP6 731 aa21.81■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 TMPRSS11BQ86T26 416 aa21.81■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 HUS1BQ8NHY5 278 aa21.81■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 TANKQ92844 425 aa21.81■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 SAMD11Q96NU1 681 aa21.81■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 AMBRA1Q9C0C7 1298 aa21.81■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 SMURF2Q9HAU4 748 aa21.81■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 PRSS16Q9NQE7 514 aa21.81■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 DCAF13Q9NV06 445 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 THG1LQ9NWX6 298 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 UTS2RQ9UKP6 389 aa21.81■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 POP7O75817 140 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 IL1RNP18510 177 aa21.8■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 GSTM2P28161 218 aa21.8■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 NFE2L1Q14494 772 aa21.8■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 ZNF551Q7Z340 670 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa21.8■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 PLA2G15Q8NCC3 412 aa21.8■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 CDC26Q8NHZ8 85 aa21.8■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 MAGIXQ9H6Y5 334 aa21.8■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 BRF2Q9HAW0 419 aa21.8■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 TBCCD1Q9NVR7 557 aa21.8■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 GDE1Q9NZC3 331 aa21.8■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 ERVK-11Q9UQG0 969 aa21.8■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 SH2B3Q9UQQ2 575 aa21.8■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 SZT2Q5T011 3432 aa21.8■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 SCN2BO60939 215 aa21.8■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 CREG1O75629 220 aa21.8■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 PRKD3O94806 890 aa21.8■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 HSD3B1P14060 373 aa21.8■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 CCNA2P20248 432 aa21.8■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 HSD3B2P26439 372 aa21.8■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 WNT3P56703 355 aa21.8■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 GTF2H3Q13889 308 aa21.8■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 E2F2Q14209 437 aa21.8■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 STARD3Q14849 445 aa21.8■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 PON2Q15165 354 aa21.8■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 DPY19L1Q2PZI1 675 aa21.8■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 CATSPEREQ5SY80 951 aa21.8■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 GTF2IRD2BQ6EKJ0 949 aa21.8■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa21.8■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 GTF2IRD2Q86UP8 949 aa21.8■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 NETO1Q8TDF5 533 aa21.8■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 SNX19Q92543 992 aa21.8■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 POP5Q969H6 163 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 BORCS5Q969J3 196 aa21.8■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 NCLNQ969V3 563 aa21.8■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 NRBF2Q96F24 287 aa21.8■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 LINC00615Q96LM1 132 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 GPN2Q9H9Y4 310 aaPredicted RBP21.8■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 PRKAB1Q9Y478 270 aa21.8■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 DENND4AQ7Z401 1863 aa21.8■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 PRMT3O60678 531 aa21.79■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 NOL3O60936 208 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 COX7A2P14406 83 aa21.79■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 NPPBP16860 134 aa21.79■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 HOXB6P17509 224 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 GJA4P35212 333 aa21.79■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 PBX2P40425 430 aa21.79■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 RAE1P78406 368 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 CNTN1Q12860 1018 aa21.79■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 C6orf141Q5SZD1 244 aa21.79■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 DOK6Q6PKX4 331 aa21.79■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 SPARTQ8N0X7 666 aa21.79■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 CHDHQ8NE62 594 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 CXorf40AQ8TE69 158 aa21.79■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 NELL1Q92832 810 aa21.79■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 ZNF514Q96K75 400 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 TRPV4Q9HBA0 871 aa21.79■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 FAIMQ9NVQ4 179 aa21.79■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 OBP2AQ9NY56 170 aa21.79■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 BTBD3Q9Y2F9 522 aa21.79■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa21.79■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 DOCK8Q8NF50 2099 aa21.78■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 GABARAPL2P60520 117 aa21.78■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 C11orf96Q7Z7L8 435 aa21.78■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 RAB2BQ8WUD1 216 aa21.78■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 MAGED4Q96JG8 741 aa21.78■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 PANX1Q96RD7 426 aa21.78■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 PRM3Q9NNZ6 103 aa21.78■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 GPR34Q9UPC5 381 aa21.78■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 TRPM6Q9BX84 2022 aa21.78■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 C17orf113A0A1B0GUU1 675 aa21.78■■□□□ 1.08
LDB1-201ENST00000361198 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms