RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000357436.4

SH3BP1-201, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP1, Length 2,852 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-201ENST00000357436 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 ABHD11Q8NFV4 315 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 OR7A2PQ8NGA2 310 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 ATG10Q9H0Y0 220 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 ENPP5Q9UJA9 477 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 BAG5Q9UL15 447 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 ERVK-11Q9UQG0 969 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 SNX5Q9Y5X3 404 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 COL6A3P12111 3177 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 PABPN1LA6NDY0 278 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 CFAP99D6REC4 459 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 PTGES3LE9PB15 166 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 CLIC1O00299 241 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 KCNK5O95279 499 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 ADH5P11766 374 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 GPX2P18283 190 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 IGFBP5P24593 272 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 OR2T5Q6IEZ7 315 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 OR2T29Q8NH02 315 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 EBPLQ9BY08 206 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 TM9SF3Q9HD45 589 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 FPGTO14772 594 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 PRMT3O60678 531 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 SEMG1P04279 462 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 ENGP17813 658 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 RELAQ04206 551 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 VMACQ2NL98 169 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 NEK10Q6ZWH5 1172 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 GPR155Q7Z3F1 870 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 TRIM73Q86UV7 250 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 NPAS3Q8IXF0 933 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 ZZZ3Q8IYH5 903 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 CNIH3Q8TBE1 160 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 PANX1Q96RD7 426 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 DGCR6LQ9BY27 220 aa18.13■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 SGTAO43765 313 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 CD22P20273 847 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 DAPP51397 102 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 GP2P55259 537 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 ABRQ12979 859 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 CTF1Q16619 201 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 LIPJQ5W064 366 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF347Q96SE7 839 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 HEPHQ9BQS7 1158 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 NUMA1Q14980 2115 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 LAMA1P25391 3075 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 KPNA5O15131 536 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 UGT2B11O75310 529 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 INMTO95050 263 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 FTH1P02794 183 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 BCAP31P51572 246 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF33BQ06732 778 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 CSTF3Q12996 717 aaKnown RBP18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 KDM4DQ6B0I6 523 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 GALNT5Q7Z7M9 940 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 SYT12Q8IV01 421 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 CEP44Q9C0F1 390 aa18.12■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 UGDHO60701 494 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 TIMP2P16035 220 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 KDELR2P33947 212 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 LAPTM4AQ15012 233 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 IGFN1Q86VF2 1251 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 PTOV1Q86YD1 416 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 OR8J2Q8NGG1 315 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 WDR20Q8TBZ3 569 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 TBC1D14Q9P2M4 693 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 FADS2P1A8MWK0 482 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 XPNPEP2O43895 674 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 XPAP23025 273 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 IL5RAQ01344 420 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 RGS21Q2M5E4 152 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 ZBTB8BQ8NAP8 495 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 VPS29Q9UBQ0 182 aa18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP18.11■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 K7ESM1 405 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 NDUFS2O75306 463 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 ANGPTL1O95841 491 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 CLK3P49761 638 aaKnown RBP18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 C21orf58P58505 322 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 IRF8Q02556 426 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 ITGADQ13349 1161 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 ATP1A4Q13733 1029 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 GTF2H3Q13889 308 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 ERICH5Q6P6B1 374 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 ZNF621Q6ZSS3 439 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 SETD9Q8NE22 299 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 FAR1Q8WVX9 515 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 ELMO1Q92556 727 aa18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
SH3BP1-201ENST00000357436 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms