RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 OR52B2Q96RD2 323 aa26.3■■□□□ 1.8
CTDNEP1-201ENST00000318988 MAP3K3Q99759 626 aa26.3■■□□□ 1.8
CTDNEP1-201ENST00000318988 SYNDIG1Q9H7V2 258 aa26.3■■□□□ 1.8
CTDNEP1-201ENST00000318988 BRF2Q9HAW0 419 aa26.3■■□□□ 1.8
CTDNEP1-201ENST00000318988 NMRK1Q9NWW6 199 aa26.3■■□□□ 1.8
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CTDNEP1-201ENST00000318988 GFERP55789 205 aa26.29■■□□□ 1.8
CTDNEP1-201ENST00000318988 ATP6AP1LQ52LC2 224 aa26.29■■□□□ 1.8
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CTDNEP1-201ENST00000318988 AHRP35869 848 aa26.28■■□□□ 1.8
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CTDNEP1-201ENST00000318988 CYP4F3Q08477 520 aa26.28■■□□□ 1.8
CTDNEP1-201ENST00000318988 GALNTL6Q49A17 601 aa26.28■■□□□ 1.8
CTDNEP1-201ENST00000318988 CACHD1Q5VU97 1274 aa26.28■■□□□ 1.8
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CTDNEP1-201ENST00000318988 THAP11Q96EK4 314 aa26.28■■□□□ 1.8
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ACPTQ9BZG2 426 aa26.28■■□□□ 1.8
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CTDNEP1-201ENST00000318988 RNF175Q8N4F7 328 aa26.27■■□□□ 1.8
CTDNEP1-201ENST00000318988 ANKRD53Q8N9V6 530 aa26.27■■□□□ 1.8
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CTDNEP1-201ENST00000318988 OR2T11Q8NH01 316 aa26.27■■□□□ 1.8
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TCTN2Q96GX1 697 aa26.27■■□□□ 1.8
CTDNEP1-201ENST00000318988 SERPINI1Q99574 410 aa26.27■■□□□ 1.8
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZFYVE21Q9BQ24 234 aa26.27■■□□□ 1.8
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CTDNEP1-201ENST00000318988 C9P02748 559 aa26.26■■□□□ 1.79
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SNAP47Q5SQN1 464 aa26.26■■□□□ 1.79
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CTDNEP1-201ENST00000318988 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa26.26■■□□□ 1.79
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CTDNEP1-201ENST00000318988 A0A0J9YVX5 310 aa26.25■■□□□ 1.79
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CTDNEP1-201ENST00000318988 SEC22BO75396 215 aa26.25■■□□□ 1.79
CTDNEP1-201ENST00000318988 CLEC3AO75596 197 aa26.25■■□□□ 1.79
CTDNEP1-201ENST00000318988 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
CTDNEP1-201ENST00000318988 TGFB1P01137 390 aa26.25■■□□□ 1.79
CTDNEP1-201ENST00000318988 NCF2P19878 526 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
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