RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 HPCAL1P37235 193 aa27.05■■□□□ 1.92
UBP1-201ENST00000283628 HNF4AP41235 474 aa27.05■■□□□ 1.92
UBP1-201ENST00000283628 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
UBP1-201ENST00000283628 FADDQ13158 208 aa27.05■■□□□ 1.92
UBP1-201ENST00000283628 IQCCQ4KMZ1 466 aa27.05■■□□□ 1.92
UBP1-201ENST00000283628 SERPINA13PQ6UXR4 307 aa27.05■■□□□ 1.92
UBP1-201ENST00000283628 CAMKMTQ7Z624 323 aa27.05■■□□□ 1.92
UBP1-201ENST00000283628 BTLAQ7Z6A9 289 aa27.05■■□□□ 1.92
UBP1-201ENST00000283628 TRIM74Q86UV6 250 aa27.05■■□□□ 1.92
UBP1-201ENST00000283628 TRIM73Q86UV7 250 aa27.05■■□□□ 1.92
UBP1-201ENST00000283628 ZFP90Q8TF47 636 aa27.05■■□□□ 1.92
UBP1-201ENST00000283628 ATL1Q8WXF7 558 aa27.05■■□□□ 1.92
UBP1-201ENST00000283628 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
UBP1-201ENST00000283628 C7orf34Q96L11 122 aa27.05■■□□□ 1.92
UBP1-201ENST00000283628 SIGLEC11Q96RL6 698 aa27.05■■□□□ 1.92
UBP1-201ENST00000283628 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
UBP1-201ENST00000283628 GABARAPL3Q9BY60 117 aa27.05■■□□□ 1.92
UBP1-201ENST00000283628 CHST8Q9H2A9 424 aa27.05■■□□□ 1.92
UBP1-201ENST00000283628 ADPRHL2Q9NX46 363 aa27.05■■□□□ 1.92
UBP1-201ENST00000283628 DENND4CQ5VZ89 1909 aa27.05■■□□□ 1.92
UBP1-201ENST00000283628 SLCO2B1O94956 709 aa27.04■■□□□ 1.92
UBP1-201ENST00000283628 LAMP1P11279 417 aa27.04■■□□□ 1.92
UBP1-201ENST00000283628 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
UBP1-201ENST00000283628 GRHL2Q6ISB3 625 aa27.04■■□□□ 1.92
UBP1-201ENST00000283628 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
UBP1-201ENST00000283628 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
UBP1-201ENST00000283628 VPS37AQ8NEZ2 397 aa27.04■■□□□ 1.92
UBP1-201ENST00000283628 SLC25A13Q9UJS0 675 aa27.04■■□□□ 1.92
UBP1-201ENST00000283628 CLDN24A6NM45 220 aa27.04■■□□□ 1.92
UBP1-201ENST00000283628 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP27.04■■□□□ 1.92
UBP1-201ENST00000283628 CLTBP09497 229 aa27.04■■□□□ 1.92
UBP1-201ENST00000283628 ZNF30P17039 623 aa27.04■■□□□ 1.92
UBP1-201ENST00000283628 VBP1P61758 197 aa27.04■■□□□ 1.92
UBP1-201ENST00000283628 RPP38P78345 283 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
UBP1-201ENST00000283628 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
UBP1-201ENST00000283628 ANXA8L1Q5VT79 327 aa27.04■■□□□ 1.92
UBP1-201ENST00000283628 DPY19L3Q6ZPD9 716 aa27.04■■□□□ 1.92
UBP1-201ENST00000283628 MFSD4AQ8N468 514 aa27.04■■□□□ 1.92
UBP1-201ENST00000283628 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa27.04■■□□□ 1.92
UBP1-201ENST00000283628 TAMM41Q96BW9 452 aa27.04■■□□□ 1.92
UBP1-201ENST00000283628 HRASLS5Q96KN8 279 aa27.04■■□□□ 1.92
UBP1-201ENST00000283628 BBS2Q9BXC9 721 aa27.04■■□□□ 1.92
UBP1-201ENST00000283628 ANKHQ9HCJ1 492 aa27.04■■□□□ 1.92
UBP1-201ENST00000283628 PCDH12Q9NPG4 1184 aa27.04■■□□□ 1.92
UBP1-201ENST00000283628 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP27.04■■□□□ 1.92
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UBP1-201ENST00000283628 PADI2Q9Y2J8 665 aa27.04■■□□□ 1.92
UBP1-201ENST00000283628 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa27.04■■□□□ 1.92
UBP1-201ENST00000283628 TOR1BO14657 336 aa27.03■■□□□ 1.92
UBP1-201ENST00000283628 EPHA2P29317 976 aa27.03■■□□□ 1.92
UBP1-201ENST00000283628 PCDH1Q08174 1060 aa27.03■■□□□ 1.92
UBP1-201ENST00000283628 LRRC74AQ0VAA2 488 aa27.03■■□□□ 1.92
UBP1-201ENST00000283628 DGCR6Q14129 220 aa27.03■■□□□ 1.92
UBP1-201ENST00000283628 DOC2AQ14183 400 aa27.03■■□□□ 1.92
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UBP1-201ENST00000283628 OR2A25A4D2G3 310 aa27.02■■□□□ 1.92
UBP1-201ENST00000283628 KRT87PA6NCN2 255 aa27.02■■□□□ 1.92
UBP1-201ENST00000283628 GRM6O15303 877 aa27.02■■□□□ 1.92
UBP1-201ENST00000283628 SUV39H1O43463 412 aa27.02■■□□□ 1.92
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UBP1-201ENST00000283628 KCNJ10P78508 379 aa27.02■■□□□ 1.92
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UBP1-201ENST00000283628 CPTPQ5TA50 214 aa27.02■■□□□ 1.92
UBP1-201ENST00000283628 UBE2UQ5VVX9 321 aa27.02■■□□□ 1.92
UBP1-201ENST00000283628 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
UBP1-201ENST00000283628 TPD52L3Q96J77 140 aa27.02■■□□□ 1.92
UBP1-201ENST00000283628 ATAD3AQ9NVI7 634 aa27.02■■□□□ 1.92
UBP1-201ENST00000283628 YY2O15391 372 aa27.02■■□□□ 1.92
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UBP1-201ENST00000283628 HLA-FP30511 346 aa27.02■■□□□ 1.92
UBP1-201ENST00000283628 DCDC1P59894 354 aa27.02■■□□□ 1.92
UBP1-201ENST00000283628 DEFB103AP81534 67 aa27.02■■□□□ 1.92
UBP1-201ENST00000283628 HIST2H2ACQ16777 129 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
UBP1-201ENST00000283628 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
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UBP1-201ENST00000283628 RHNO1Q9BSD3 238 aa27.02■■□□□ 1.92
UBP1-201ENST00000283628 SIRT5Q9NXA8 310 aa27.02■■□□□ 1.92
UBP1-201ENST00000283628 E7EQ34 232 aa27.01■■□□□ 1.91
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UBP1-201ENST00000283628 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa27.01■■□□□ 1.91
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UBP1-201ENST00000283628 DDX39BQ13838 428 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
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UBP1-201ENST00000283628 INAQ16352 499 aa27.01■■□□□ 1.91
UBP1-201ENST00000283628 NPAS3Q8IXF0 933 aa27.01■■□□□ 1.91
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