RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 MANFP55145 182 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 GPR153Q6NV75 609 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 HTR3DQ70Z44 454 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 ARMC8Q8IUR7 673 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 APCDD1Q8J025 514 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 SLC15A4Q8N697 577 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 SH3RF2Q8TEC5 729 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 NR4A3Q92570 626 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 HPS1Q92902 700 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 PYCR2Q96C36 320 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 MTERF3Q96E29 417 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 FNDC11Q9BVV2 318 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 SEMA3GQ9NS98 782 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 MOSPD1Q9UJG1 213 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 INTS6Q9UL03 887 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 ENTPD4Q9Y227 616 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 TSPAN12O95859 305 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 SDC1P18827 310 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 KELP23276 732 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 AQP1P29972 269 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 CD97P48960 835 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 RPP38P78345 283 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 CAP1Q01518 475 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 PDZK1Q5T2W1 519 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 MZT2AQ6P582 158 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 PRR23CQ6ZRP0 262 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 DCDC5Q6ZRR9 648 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 ZSCAN32Q9NX65 697 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 UGT2B17O75795 530 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 MT-ND2P03891 347 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 SPATA31D3P0C874 917 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 NR4A1P22736 598 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 PSMA3P25788 255 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 AOAHP28039 575 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 DSTNP60981 165 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 HEPACAMQ14CZ8 416 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 MED22Q15528 200 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 DEPDC1Q5TB30 811 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 SPATA31D4Q6ZUB0 917 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 CBLL1Q75N03 491 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 ZNF566Q969W8 418 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 OTUB2Q96DC9 234 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa8.56□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 TRIM64CA6NLI5 447 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 MATN1P21941 496 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 PRPH2P23942 346 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 CDK6Q00534 326 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP8.55□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 TMEM44Q2T9K0 475 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 FAM46CQ5VWP2 391 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 ZBTB46Q86UZ6 589 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 ZSWIM9Q86XI8 627 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 CHPT1Q8WUD6 406 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 RAD51AP1Q96B01 352 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 TMCO6Q96DC7 493 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 ZNF419Q96HQ0 510 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 ABHD8Q96I13 439 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 KCNC2Q96PR1 638 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP8.55□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 SH3D21A4FU49 640 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 PDPK1O15530 556 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 FGBP02675 491 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 C8AP07357 584 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 UQCRC2P22695 453 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 CD40LGP29965 261 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 KREMEN2Q8NCW0 462 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 C19orf18Q8NEA5 215 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 PJA1Q8NG27 643 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 ASB11Q8WXH4 323 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 APIPQ96GX9 242 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 SH3YL1Q96HL8 342 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 DOK1Q99704 481 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 INPP5KQ9BT40 448 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 PRDM8Q9NQV8 689 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 ELOVL2Q9NXB9 296 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 OGDHLQ9ULD0 1010 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 FUOMA2VDF0 154 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 RNASET2O00584 256 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 XPNPEP2O43895 674 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 NR2F1P10589 423 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 SRCP12931 536 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 SLC7A9P82251 487 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 RAPSNQ13702 412 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 IKBIPQ70UQ0 350 aa8.55□□□□□ -1.04
HERC3-201ENST00000264345 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
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