RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259365.8

TMOD1-201, Transcript of tropomodulin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMOD1, Length 3,343 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD1-201ENST00000259365 UGT8Q16880 541 aa12.95□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 INO80DQ53TQ3 878 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF697Q5TEC3 545 aa12.95□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 OLIG3Q7RTU3 272 aa12.95□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 SVOPQ8N4V2 548 aa12.95□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 VPS35Q96QK1 796 aa12.95□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 CNPPD1Q9BV87 410 aa12.95□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 RIOK2Q9BVS4 552 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 C1QTNF3Q9BXJ4 246 aa12.95□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 NUAK2Q9H093 628 aa12.95□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 GABRR3A8MPY1 467 aa12.95□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 RFXAPO00287 272 aa12.95□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 C6orf47O95873 294 aa12.95□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 SELPP16109 830 aa12.95□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 FPR1P21462 350 aa12.95□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 LHCGRP22888 699 aa12.95□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 SLC19A1P41440 591 aa12.95□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 RPS13P62277 151 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 ST3GAL4Q11206 333 aa12.95□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 ELAVL2Q12926 359 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 MAD2L1BPQ15013 274 aaPredicted RBP12.95□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 RFX4Q33E94 735 aa12.95□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 LEXMQ3ZCV2 418 aa12.95□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 ARMCX4Q5H9R4 360 aa12.95□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 OTOP2Q7RTS6 562 aa12.95□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa12.95□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 OR2AP1Q8NGE2 309 aa12.95□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 ZNF461Q8TAF7 563 aa12.95□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 CD99L2Q8TCZ2 262 aa12.95□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 PLD4Q96BZ4 506 aa12.95□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 HTATIP2Q9BUP3 242 aa12.95□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 DSN1Q9H410 356 aa12.95□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 IL1RAPQ9NPH3 570 aa12.95□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 IL37Q9NZH6 218 aa12.95□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa12.95□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 TDRD15B5MCY1 1934 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 H3BM21 787 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 KPNA3O00505 521 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 SLC22A1O15245 554 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 AOC2O75106 756 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 ETHE1O95571 254 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 SLC10A3P09131 477 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 GSTT2P0CG29 244 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 GSTT2BP0CG30 244 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 PDHA2P29803 388 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 PRKAG1P54619 331 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 AP1S1P61966 158 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 ACOX1Q15067 660 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 ADCK2Q7Z695 626 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 GPR65Q8IYL9 337 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 MMP21Q8N119 569 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 OR10G2Q8NGC3 310 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 RAB8BQ92930 207 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 SUV39H2Q9H5I1 410 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 ZDHHC3Q9NYG2 299 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 RNF6Q9Y252 685 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 ITM2BQ9Y287 266 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 PMF1-BGLAPU3KQ54 211 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 DOCK6Q96HP0 2047 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 A0A1W2PQY0 241 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 ANKDD1BA6NHY2 528 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 PLK4O00444 970 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 SLC16A8O95907 504 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 HPRP00739 348 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 PRPS2P11908 318 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 ITIH1P19827 911 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 AOAHP28039 575 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 SNRPD1P62314 119 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 C2orf80Q0P641 193 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 TCTN1Q2MV58 587 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 TMEM53Q6P2H8 277 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 NPAS4Q8IUM7 802 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 CFAP206Q8IYR0 622 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 LGI4Q8N135 537 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 BEX2Q9BXY8 128 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 TM9SF3Q9HD45 589 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 MS4A12Q9NXJ0 267 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 GPC6Q9Y625 555 aaPredicted RBP12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 LOC285556D6RIA3 1793 aa12.94□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 RTCAO00442 366 aaKnown RBP12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 GFRA2O00451 464 aa12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 TSPAN6O43657 245 aa12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 RETP07949 1114 aa12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 JUNBP17275 347 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 AMD1P17707 334 aa12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 PCMT1P22061 227 aa12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 TGM4P49221 684 aa12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 NKX3-2P78367 333 aa12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 B4GALNT1Q00973 533 aa12.93□□□□□ -0.34
TMOD1-201ENST00000259365 PTSQ03393 145 aa12.93□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.5 ms