RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000218364.4

HTATSF1-201, Transcript of HIV-1 Tat specific factor 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HTATSF1, Length 2,775 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1-201ENST00000218364 DSCR3O14972 297 aa21.39■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 SUV39H1O43463 412 aa21.39■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 OR56A5P0C7T3 313 aa21.39■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 OR1D2P34982 312 aa21.39■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 LIMK1P53667 647 aa21.39■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF45Q02386 682 aa21.39■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 PRKCDQ05655 676 aa21.39■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 CHIT1Q13231 466 aa21.39■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 RNF175Q8N4F7 328 aa21.39■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 KCNC2Q96PR1 638 aa21.39■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 CDADC1Q9BWV3 514 aa21.39■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 FZD4Q9ULV1 537 aa21.39■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa21.39■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 TBX1O43435 398 aa21.38■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 RPL17P18621 184 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 RRM2P31350 389 aa21.38■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 ACLYP53396 1101 aa21.38■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 DOHHQ9BU89 302 aa21.38■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 SPASTQ9UBP0 616 aa21.38■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 BTNL2Q9UIR0 455 aa21.38■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 GREM1O60565 184 aa21.38■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 UGDHO60701 494 aa21.38■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 PTTG1O95997 202 aa21.38■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 NUDT7P0C024 238 aa21.38■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 LAMP1P11279 417 aa21.38■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP21.38■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 HSPA14Q0VDF9 509 aa21.38■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 FBXO43Q4G163 708 aa21.38■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa21.38■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 LIPJQ5W064 366 aa21.38■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 P2RY13Q9BPV8 354 aa21.38■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 VPS29Q9UBQ0 182 aa21.38■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 CORO2BQ9UQ03 480 aa21.38■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 BTBD3Q9Y2F9 522 aa21.38■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa21.38■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa21.38■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa21.38■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 C1orf226A1L170 272 aa21.37■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 KCNK2O95069 426 aa21.37■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 PPIBP23284 216 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 GSSP48637 474 aa21.37■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 HKDC1Q2TB90 917 aa21.37■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 TPRG1LQ5T0D9 272 aa21.37■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 POC5Q8NA72 575 aa21.37■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 WDR20Q8TBZ3 569 aa21.37■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 HTRA1Q92743 480 aa21.37■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 DUSP26Q9BV47 211 aa21.37■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 TESMINQ9Y4I5 508 aa21.37■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF821O75541 412 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 ITPKAP23677 461 aa21.37■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 PCGF2P35227 344 aa21.37■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 AP1S2P56377 157 aa21.37■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 PFN3P60673 137 aa21.37■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 ATAD3BQ5T9A4 648 aa21.37■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 TPRG1Q6ZUI0 275 aa21.37■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 VRK3Q8IV63 474 aa21.37■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 CCDC103Q8IW40 242 aa21.37■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 KBTBD8Q8NFY9 601 aa21.37■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 VOPP1Q96AW1 172 aa21.37■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 TRMT2BQ96GJ1 504 aaKnown RBP21.37■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 FEVQ99581 238 aa21.37■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 RUBCNLQ9H714 662 aa21.37■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 CYP2A7P20853 494 aa21.36■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 GRK5P34947 590 aa21.36■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 HTRA3P83110 453 aa21.36■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 PLD1Q13393 1074 aa21.36■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 AKAP14Q86UN6 197 aa21.36■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF675Q8TD23 568 aa21.36■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 CHAC2Q8WUX2 184 aa21.36■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 SH3KBP1Q96B97 665 aa21.36■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 C6orf62Q9GZU0 229 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 TMEM184CQ9NVA4 438 aa21.36■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 BACE2Q9Y5Z0 518 aa21.36■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 UPK3BL1B0FP48 263 aa21.36■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 UPK3BL2E5RIL1 263 aa21.36■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 SCAMP2O15127 329 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 GCM2O75603 506 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 IGSF6O95976 241 aa21.36■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 ALDH1A1P00352 501 aa21.36■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 DBTP11182 482 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 GABRB1P18505 474 aa21.36■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 CD22P20273 847 aa21.36■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 SERPINA4P29622 427 aa21.36■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 RGNQ15493 299 aa21.36■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP21.36■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa21.36■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 POU2F3Q9UKI9 436 aa21.36■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa21.36■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa21.36■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 TNFRSF11BO00300 401 aa21.36■■□□□ 1.01
HTATSF1-201ENST00000218364 ADAMDEC1O15204 470 aa21.36■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.7 ms