RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000046207.8

Sf3b6-201, Transcript of Splicing factor 3B subunit 6, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Sf3b6, Length 1,180 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 5530400C23RikQ9D3I0 173 aa14.6□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Slxl1Q9D515 155 aa14.6□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Kcnmb4Q9JIN6 210 aa14.6□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Gabrg1Q9R0Y8 465 aa14.6□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Vmn2r25W4VSP2 855 aa14.6□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Gm1758F6VZZ1 202 aa14.59□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Pdha2P35487 391 aa14.59□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Vps26aP40336 327 aa14.59□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Ruvbl1P60122 456 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Has2P70312 552 aa14.59□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Mmp11Q02853 492 aa14.59□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Pfdn6Q03958 127 aa14.59□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Pid1Q3UBG2 217 aa14.59□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 P4ha2Q60716 537 aa14.59□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Olfr140Q60878 302 aa14.59□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Olfr798Q7TRH8 311 aa14.59□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Prdm4Q80V63 803 aa14.59□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 SergefQ80YD6 464 aa14.59□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Fzd10Q8BKG4 582 aa14.59□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Rnf122Q8BP31 155 aa14.59□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Zfp62Q8C827 914 aa14.59□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Tgif2lx2Q8K5B9 231 aa14.59□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Evi2bQ8VD58 444 aa14.59□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Olfr357Q8VFP4 308 aa14.59□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Olfr1378Q8VGH0 315 aa14.59□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Klhdc8aQ91XA8 350 aa14.59□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Gjc3Q921C1 269 aa14.59□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Mgat2Q921V5 442 aa14.59□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Cby3Q9CVN6 235 aa14.59□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Gm26657Q9CVR1 127 aa14.59□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Tssk3Q9D2E1 268 aa14.59□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Lrrc51Q9DAK8 192 aa14.59□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 AcoxlQ9DBS4 632 aa14.59□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 RgccQ9DBX1 137 aa14.59□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Tdp2Q9JJX7 370 aa14.59□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 DptQ9QZZ6 201 aa14.59□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Ice1E9Q286 2241 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Asxl3Q8C4A5 2259 aa14.59□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Dopey1Q8BL99 2399 aa14.59□□□□□ -0.07
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Bpifb9bA2AJD1 591 aa14.58□□□□□ -0.08
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Ccdc13D3YV10 709 aa14.58□□□□□ -0.08
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 4931429L15RikE9PVU2 379 aa14.58□□□□□ -0.08
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Adamts14E9PX39 1209 aa14.58□□□□□ -0.08
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Tnfrsf11bO08712 401 aa14.58□□□□□ -0.08
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 ChkaO54804 453 aa14.58□□□□□ -0.08
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Adrb2P18762 418 aa14.58□□□□□ -0.08
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Emp1P47801 160 aa14.58□□□□□ -0.08
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Gm4952Q5FW57 296 aa14.58□□□□□ -0.08
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Znf260Q62513 407 aa14.58□□□□□ -0.08
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Kif18bQ6PFD6 834 aa14.58□□□□□ -0.08
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Eif2s1Q6ZWX6 315 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Fam107aQ78TU8 144 aa14.58□□□□□ -0.08
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Bpifb9aQ80XI7 591 aa14.58□□□□□ -0.08
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Orai2Q8BH10 250 aa14.58□□□□□ -0.08
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Ccdc186Q8C9S4 917 aa14.58□□□□□ -0.08
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Slc25a45Q8CFJ7 288 aa14.58□□□□□ -0.08
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Olfr1090Q8VGA6 313 aa14.58□□□□□ -0.08
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Ndufa10Q99LC3 355 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 IqchQ9D2K4 1071 aa14.58□□□□□ -0.08
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Slc38a3Q9DCP2 505 aa14.58□□□□□ -0.08
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 CdylQ9WTK2 593 aa14.58□□□□□ -0.08
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Wscd2D4PHA7 571 aa14.57□□□□□ -0.08
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Sgo2bJ3QMK1 1167 aa14.57□□□□□ -0.08
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Matn2O08746 956 aa14.57□□□□□ -0.08
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Myo1aO88329 1043 aa14.57□□□□□ -0.08
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Epha3P29319 983 aa14.57□□□□□ -0.08
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Tial1P70318 392 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Frg1P97376 258 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Serpina3mQ03734 418 aa14.57□□□□□ -0.08
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 4930430A15RikQ05AC5 485 aa14.57□□□□□ -0.08
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 H2-M3Q31093 336 aa14.57□□□□□ -0.08
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 SbplQ3TUY3 232 aa14.57□□□□□ -0.08
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Gm14226Q3TZL0 686 aa14.57□□□□□ -0.08
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Q3UST5 385 aa14.57□□□□□ -0.08
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Stox2Q499E5 926 aa14.57□□□□□ -0.08
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Ndufaf2Q59J78 168 aa14.57□□□□□ -0.08
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Tle1Q62440 770 aa14.57□□□□□ -0.08
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Scd4Q6T707 353 aa14.57□□□□□ -0.08
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 OacylQ8BML2 685 aa14.57□□□□□ -0.08
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Pcdhb7Q8CDY9 829 aa14.57□□□□□ -0.08
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 WwoxQ91WL8 414 aa14.57□□□□□ -0.08
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Fkbp6Q91XW8 327 aa14.57□□□□□ -0.08
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 TympQ99N42 471 aa14.57□□□□□ -0.08
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 P2ry12Q9CPV9 347 aa14.57□□□□□ -0.08
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Brix1Q9DCA5 353 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Twsg1Q9EP52 222 aa14.57□□□□□ -0.08
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Gpr88Q9EPB7 384 aa14.57□□□□□ -0.08
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Ecel1Q9JMI0 775 aa14.57□□□□□ -0.08
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Ap4b1Q9WV76 738 aa14.57□□□□□ -0.08
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Fam171a2A2A699 822 aa14.56□□□□□ -0.08
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Ttll9A2APC3 461 aa14.56□□□□□ -0.08
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Otud4B2RRE7 1107 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Vmn1r177E9PXM3 309 aa14.56□□□□□ -0.08
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Vmn1r167G3UW71 315 aa14.56□□□□□ -0.08
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Cdh4P39038 913 aa14.56□□□□□ -0.08
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Slc5a12Q49B93 619 aa14.56□□□□□ -0.08
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Slc39a12Q5FWH7 689 aa14.56□□□□□ -0.08
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Tnfaip3Q60769 775 aa14.56□□□□□ -0.08
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Rbl2Q64700 1135 aa14.56□□□□□ -0.08
Sf3b6-201ENSMUST00000046207 Ino80dQ66JY2 873 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 31.2 ms