RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025522.10

Pdgfrb-201, Transcript of Platelet-derived growth factor receptor beta, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pdgfrb, Length 5,407 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Prdm4Q80V63 803 aa10.65□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cdkn3Q810P3 211 aa10.65□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Timm29Q8BGX2 266 aa10.65□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tmem150bQ8R218 238 aa10.65□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Aspscr1Q8VBT9 550 aa10.65□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr1278Q8VF39 313 aa10.65□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr599Q8VG01 315 aa10.65□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Mri1Q9CQT1 369 aa10.65□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Mrps28Q9CY16 186 aa10.65□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 MtpapQ9D0D3 585 aaKnown RBP10.65□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Senp8Q9D2Z4 221 aa10.65□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Spock2Q9ER58 423 aa10.65□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 IvdQ9JHI5 424 aa10.65□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Olfr1480A0A140LIR8 359 aa10.64□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Fpr-s1O08790 351 aa10.64□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Pmm1O35621 262 aa10.64□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Sap18O55128 153 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Bmp2P21274 394 aa10.64□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gja1P23242 382 aa10.64□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Fam171bQ14CH0 825 aa10.64□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Insm1Q63ZV0 521 aa10.64□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Otud6aQ6IE21 290 aa10.64□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 MregQ6NVG5 214 aa10.64□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 MroQ7TNB4 248 aa10.64□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Trim69Q80X56 500 aa10.64□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Kcng4Q80XM3 506 aa10.64□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Trmt12Q8BG71 446 aa10.64□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 E330021D16RikQ8BW45 371 aa10.64□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Slc5a11Q8K0E3 673 aa10.64□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 GaleQ8R059 347 aa10.64□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tas1r1Q99PG6 842 aa10.64□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Clec3aQ9EPW4 196 aa10.64□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 St6galnac4Q9R2B6 360 aa10.64□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Lipo4D3Z608 396 aa10.64□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Vmn2r34E9PVI0 852 aa10.64□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Vmn2r41E9Q5C7 852 aa10.64□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Vmn2r40F6W043 852 aa10.64□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Vmn2r37F8VQD3 802 aa10.64□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Vmn2r36K7N741 852 aa10.64□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 CtsdP18242 410 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Hnf1bP27889 558 aa10.64□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Rps3aP97351 264 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tmem173Q3TBT3 378 aa10.64□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cdh12Q5RJH3 794 aa10.64□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Mocs1Q5RKZ7 636 aa10.64□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tead4Q62296 427 aa10.64□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 P4ha3Q6W3F0 542 aa10.64□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tm7sf2Q71KT5 418 aa10.64□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Pex26Q8BGI5 305 aa10.64□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Sult5a1Q91X36 291 aa10.64□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Acy3Q91XE4 318 aa10.64□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Adgre4Q91ZE5 689 aa10.64□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 PrkxQ922R0 355 aa10.64□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Zcchc12Q9CZA5 402 aa10.64□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ift27Q9D0P8 186 aa10.64□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Rnf138rt1Q9D9M9 248 aa10.64□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Vmn2r17E9PYF5 849 aa10.64□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 LatO54957 242 aa10.64□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tspan6O70401 245 aa10.64□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 CtskP55097 329 aa10.64□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Kir3dl1P83555 432 aa10.64□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 LchnQ3UHG7 455 aa10.64□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Syndig1lQ3USQ7 237 aa10.64□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gm29609Q3UU56 907 aa10.64□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ctc1Q5SUQ9 1212 aa10.64□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 HrQ61645 1182 aa10.64□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gpr17Q6NS65 339 aa10.64□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gtf3c2Q8BL74 907 aa10.64□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 ClmpQ8R373 373 aa10.64□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Sapcd1Q9CY86 146 aa10.64□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Mdm1Q9D067 708 aa10.64□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 4930503E14RikQ9D583 177 aa10.64□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Med27Q9DB40 311 aa10.64□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cntn6Q9JMB8 1028 aa10.64□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Col2a1P28481 1487 aa10.64□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Rab11fip2G3XA57 512 aa10.64□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Vmn2r75G5E8Z7 853 aa10.64□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cmklr1P97468 371 aa10.64□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gata5P97489 404 aa10.64□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Nfatc2Q60591 927 aa10.64□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Med22Q62276 200 aa10.64□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Gpr139Q80UC8 345 aa10.64□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Pqlc1Q80XM9 271 aa10.64□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Znf451Q8C0P7 1056 aa10.64□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tgif2Q8C0Y1 237 aa10.64□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Adamts2Q8C9W3 1213 aa10.64□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Calhm4Q8CE93 315 aa10.64□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Camkk1Q8VBY2 505 aa10.64□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Slc35c2Q8VCX2 364 aa10.64□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 SelenomQ8VHC3 145 aa10.64□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Oas3Q8VI93 1138 aaKnown RBP10.64□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Tmem43Q9DBS1 400 aa10.64□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Cacna1sQ02789 1880 aa10.64□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Rpl7a-ps3A0A140T8L1 270 aa10.63□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Xkr6E9Q6C8 638 aa10.63□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Zfp949E9Q732 603 aa10.63□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 LdlrP35951 862 aa10.63□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Pim3P58750 326 aa10.63□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Ranbp9P69566 653 aa10.63□□□□□ -0.71
Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 Sh3gl2Q62420 352 aa10.63□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 24.2 ms