RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000629983.2

CAPNS1-217, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 799 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-217ENST00000629983 TACC2O95359 2948 aa25.87■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 DCHS2Q6V1P9 2916 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 ARHGEF33A8MVX0 844 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 P2RX6O15547 441 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 DIAPH2O60879 1101 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 EZRP15311 586 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP25.86■■□□□ 1.738e-7■■■■□ 23
CAPNS1-217ENST00000629983 KLF1Q13351 362 aaPredicted RBP25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 MEP1AQ16819 746 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 EEF1AKMT2Q5JPI9 291 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 ICE2Q659A1 982 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 PEX26Q7Z412 305 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 PLD3Q8IV08 490 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 TMEM178AQ8NBL3 297 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 RNF214Q8ND24 703 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 MDS2Q8NDY4 140 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 OR9A4Q8NGU2 314 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 AGAP11Q8TF27 550 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 CYTH2Q99418 400 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 MCCC2Q9HCC0 563 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 RAB6BQ9NRW1 208 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 NEU2Q9Y3R4 380 aa25.86■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 GRID2IPA4D2P6 1211 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 FANCGO15287 622 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNHIT1O43257 154 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 FMO4P31512 558 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 CD96P40200 585 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 CSNK1G2P78368 415 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 CTSL3PQ5NE16 218 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 SPINK14Q6IE38 97 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 C3P1Q6ZMU1 363 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 CRLF3Q8IUI8 442 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 MPP5Q8N3R9 675 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 CA5BP1Q8WTZ4 195 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM114A2Q9NRY5 505 aa25.85■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 ZFHX3Q15911 3703 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF839A8K0R7 811 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 HAT1O14929 419 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 APRTP07741 180 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 ERGP11308 486 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 STIP1P31948 543 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 HSF1Q00613 529 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 FAM53BQ14153 422 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 PCID2Q5JVF3 399 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF425Q6IV72 752 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 GHDCQ8N2G8 530 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 ARHGEF39Q8N4T4 335 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 LRRC57Q8N9N7 239 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 PPFIBP2Q8ND30 876 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 MCOLN3Q8TDD5 553 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 SDCCAG3Q96C92 435 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 FRMD6Q96NE9 622 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 HCN3Q9P1Z3 774 aa25.84■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 SOWAHDA6NJG2 315 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 ASNA1O43681 348 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 NIPSNAP2O75323 286 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 MATN4O95460 622 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 TSPAN12O95859 305 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 CATP04040 527 aaKnown RBP25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 CHRM3P20309 590 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 PNLIPRP1P54315 467 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 CRADDP78560 199 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 THEMIS2Q5TEJ8 643 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 SCMH1Q96GD3 660 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 PKP4Q99569 1192 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 PPT2Q9UMR5 302 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 EPN1Q9Y6I3 576 aaPredicted RBP25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 PCNX1Q96RV3 2341 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 MTORP42345 2549 aa25.83■■□□□ 1.73
CAPNS1-217ENST00000629983 ASPDHA6ND91 283 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 GABRR3A8MPY1 467 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 MYO1CO00159 1063 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 ATP5DP30049 168 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 XCR1P46094 333 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 ARHGAP19Q14CB8 494 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 EXT1Q16394 746 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 ANKRD37Q7Z713 158 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 PRUNE1Q86TP1 453 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 EID3Q8N140 333 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 HORMAD2Q8N7B1 307 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 COQ3Q9NZJ6 369 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 ZNF148Q9UQR1 794 aa25.82■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 OR2W5A6NFC9 320 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 BTNL10A8MVZ5 291 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 H0YIG0 161 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 SMAPO00193 183 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 PRRG2O14669 202 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 SYF2O95926 243 aaKnown RBP25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 FTCDO95954 541 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 CYC1P08574 325 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 HSD17B2P37059 387 aa25.81■■□□□ 1.72
CAPNS1-217ENST00000629983 AGTR2P50052 363 aa25.81■■□□□ 1.72
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