RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000625672.2

NRXN1-222, Transcript of neurexin 1, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene NRXN1, Length 8,113 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NRXN1-222	ENST00000625672	RBCK1	Q9BYM8	510 aa		13.51	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	VPS29	Q9UBQ0	182 aa		13.51	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	KCNK6	Q9Y257	313 aa		13.51	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	CCRL2	O00421	344 aa		13.51	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	CST3	P01034	146 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	FAM86B1	Q8N7N1	296 aa		13.51	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	CA14	Q9ULX7	337 aa		13.51	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	RBMX2	Q9Y388	322 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	UGT1A9	O60656	530 aa		13.51	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	C8orf89	P0DMQ9	161 aa		13.51	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	UGT1A6	P19224	532 aa		13.51	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	UGT1A4	P22310	534 aa		13.51	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	LMO2	P25791	158 aa		13.51	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	STOM	P27105	288 aa		13.51	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	BRAT1	Q6PJG6	821 aa		13.51	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	THAP6	Q8TBB0	222 aa		13.51	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	UGT1A7	Q9HAW7	530 aa		13.51	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	UGT1A10	Q9HAW8	530 aa		13.51	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	UGT1A8	Q9HAW9	530 aa		13.51	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	TNFRSF10D	Q9UBN6	386 aa		13.51	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	WNT6	Q9Y6F9	365 aa		13.51	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	ARVCF	O00192	962 aa		13.51	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	MPPED1	O15442	326 aa		13.51	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	TUBG1	P23258	451 aa		13.51	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	ELOC	Q15369	112 aa		13.51	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	FUK	Q8N0W3	1084 aa		13.51	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	GLB1L3	Q8NCI6	653 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	S100A14	Q9HCY8	104 aa		13.51	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	FZD3	Q9NPG1	666 aa		13.51	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	TSPAN4	O14817	238 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	ATP1B2	P14415	290 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	RPS24	P62847	133 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	FAM76B	Q5HYJ3	339 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	SCGB1C1	Q8TD33	95 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	HNRNPAB	Q99729	332 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	TREM1	Q9NP99	234 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	HEMK1	Q9Y5R4	338 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	RCBTB2	O95199	551 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	HOXB9	P17482	250 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	KLF1	Q13351	362 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	ARL9	Q6T311	187 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	ZNF283	Q8N7M2	679 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	SLC7A11	Q9UPY5	501 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	FASLG	P48023	281 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	PREP	P48147	710 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	USP43	Q70EL4	1123 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	PGAM4	Q8N0Y7	254 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	SLC13A3	Q8WWT9	602 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	EBF3	Q9H4W6	596 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	GKN1	Q9NS71	199 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	ARL8B	Q9NVJ2	186 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	FZD4	Q9ULV1	537 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	PEX16	Q9Y5Y5	336 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	TRIM64C	A6NLI5	447 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	BTNL10	A8MVZ5	291 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672		J3QRK9	145 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	TP53I11	O14683	189 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	GPI	P06744	558 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	TNFRSF8	P28908	595 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	SLC26A5	P58743	744 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	EFR3A	Q14156	821 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	SGCA	Q16586	387 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	UNQ6126/PRO20091	Q6UXV3	157 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	CERS5	Q8N5B7	392 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	SEZ6L	Q9BYH1	1024 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	DKK3	Q9UBP4	350 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	AOC2	O75106	756 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	CDC123	O75794	336 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	RAB36	O95755	333 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	KCTD9	Q7L273	389 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	SLC32A1	Q9H598	525 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	NOP16	Q9Y3C1	178 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	CCDC163	A0A0D9SF12	145 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	BRINP1	O60477	761 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	MMP8	P22894	467 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	CBLB	Q13191	982 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	TATDN1	Q6P1N9	297 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	PDE7B	Q9NP56	450 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	CLDN25	C9JDP6	229 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	FMO3	P31513	532 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	LIMK2	P53671	638 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	GRK1	Q15835	563 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	TMCO2	Q7Z6W1	182 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	CBR4	Q8N4T8	237 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		13.5	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	TTC24	A2A3L6	582 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	TBX18	O95935	607 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	CH25H	O95992	272 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	ASB18	Q6ZVZ8	466 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	DNAJC19	Q96DA6	116 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	RBP7	Q96R05	134 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	C4BPA	P04003	597 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	HTR1A	P08908	422 aa		13.49	□□□□□ -0.25
NRXN1-222	ENST00000625672	NLGN4X	Q8N0W4	816 aa		13.49	□□□□□ -0.25

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