RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000623495.1

LETMD1-238, Transcript of LETM1 domain containing 1, human

Gene LETMD1, Length 2,948 nt, Biotype TEC.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LETMD1-238	ENST00000623495	CD27	P26842	260 aa		7.02	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	HTR1B	P28222	390 aa		7.02	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	MMP12	P39900	470 aa		7.02	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	NAB1	Q13506	487 aa		7.02	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	TCEAL1	Q15170	157 aa		7.02	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	TEAD4	Q15561	434 aa		7.02	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	AMZ1	Q400G9	498 aa		7.02	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	ATP13A5	Q4VNC0	1218 aa		7.02	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	METTL11B	Q5VVY1	283 aa		7.02	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	ESRP1	Q6NXG1	681 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	HDDC2	Q7Z4H3	204 aa		7.02	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC22A16	Q86VW1	577 aa		7.02	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	WDR5B	Q86VZ2	330 aa		7.02	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	CTAGE3P	Q8IX95	158 aa		7.02	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	KIAA1958	Q8N8K9	716 aa		7.02	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	SUMF1	Q8NBK3	374 aa		7.02	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	HIPK4	Q8NE63	616 aa		7.02	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	PNPT1	Q8TCS8	783 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	NRBF2	Q96F24	287 aa		7.02	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	MCMBP	Q9BTE3	642 aa		7.02	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM168	Q9H0V1	697 aa		7.02	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	FANCF	Q9NPI8	374 aa		7.02	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	SYBU	Q9NX95	663 aa		7.02	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	BFAR	Q9NZS9	450 aa		7.02	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	TRHDE	Q9UKU6	1024 aa		7.02	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	PRPF19	Q9UMS4	504 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF175	Q9Y473	711 aa		7.02	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	UGT2A1	Q9Y4X1	527 aa		7.02	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	DMXL2	Q8TDJ6	3036 aa		7.02	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	BCLAF3	A2AJT9	711 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM149A	A5PLN7	773 aa		7.02	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	CENPX	A8MT69	81 aa		7.02	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	TLR4	O00206	839 aa		7.02	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	CACNB4	O00305	520 aa	Predicted RBP	7.02	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	SLITRK5	O94991	958 aa		7.02	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	IFNA16	P05015	189 aa		7.02	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	RET	P07949	1114 aa		7.02	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	CD46	P15529	392 aa		7.02	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	IVD	P26440	423 aa		7.02	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	PIK3R1	P27986	724 aa		7.02	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	ALDH4A1	P30038	563 aa		7.02	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	VIPR1	P32241	457 aa		7.02	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	IGFALS	P35858	605 aa		7.02	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	ACTR1B	P42025	376 aa		7.02	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	ARSD	P51689	593 aa		7.02	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	ACTR1A	P61163	376 aa		7.02	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	DAB2	P98082	770 aa		7.02	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	BOP1	Q14137	746 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	FASTKD3	Q14CZ7	662 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	NAPEPLD	Q6IQ20	393 aa		7.02	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	GALNT12	Q8IXK2	581 aa		7.02	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	C2orf73	Q8N5S3	287 aa	Predicted RBP	7.02	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	PSD4	Q8NDX1	1056 aa		7.02	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	LRRC20	Q8TCA0	184 aa		7.02	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	TCP10L	Q8TDR4	215 aa		7.02	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	CMTM5	Q96DZ9	223 aa		7.02	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	BMF	Q96LC9	184 aa		7.02	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	FCRL5	Q96RD9	977 aa		7.02	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	FGF22	Q9HCT0	170 aa		7.02	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	APOBEC3B	Q9UH17	382 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	CDV3	Q9UKY7	258 aa	Known RBP	7.02	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	TMEM5	Q9Y2B1	443 aa		7.02	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	BTBD3	Q9Y2F9	522 aa		7.02	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	TOR1A	O14656	332 aa		7.01	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	TSPAN6	O43657	245 aa		7.01	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	ADAM11	O75078	769 aa		7.01	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	KRT37	O76014	449 aa		7.01	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	MFN2	O95140	757 aa		7.01	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	TRIM16	O95361	564 aa		7.01	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	IFNA14	P01570	189 aa		7.01	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	C1S	P09871	688 aa		7.01	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	BPI	P17213	487 aa		7.01	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	MC4R	P32245	332 aa		7.01	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	ARRB1	P49407	418 aa	Predicted RBP	7.01	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	HK2	P52789	917 aa		7.01	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	CDH15	P55291	814 aa		7.01	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	CYP4F2	P78329	520 aa		7.01	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	CYP4F3	Q08477	520 aa		7.01	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	PDIA2	Q13087	525 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	PMS2P3	Q13401	168 aa		7.01	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	KRR1	Q13601	381 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	ZFP69	Q49AA0	526 aa		7.01	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	RALGPS1	Q5JS13	557 aa		7.01	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	USP30	Q70CQ3	517 aa		7.01	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	TEX26	Q8N6G2	289 aa		7.01	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	BANP	Q8N9N5	519 aa		7.01	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	LMNTD1	Q8N9Z9	388 aa		7.01	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	CDC26	Q8NHZ8	85 aa		7.01	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	FANK1	Q8TC84	345 aa		7.01	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	ZNF578	Q96N58	590 aa	Predicted RBP	7.01	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	RBM14	Q96PK6	669 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	CITED4	Q96RK1	184 aa		7.01	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	BOC	Q9BWV1	1114 aa		7.01	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	FAM126A	Q9BYI3	521 aa	Predicted RBP	7.01	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		7.01	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	ERVMER34-1	Q9H9K5	563 aa		7.01	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	TRIM39	Q9HCM9	518 aa		7.01	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	RPRD1B	Q9NQG5	326 aa	Known RBP	7.01	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	ZC4H2	Q9NQZ6	224 aa		7.01	□□□□□ -1.29
LETMD1-238	ENST00000623495	KCTD5	Q9NXV2	234 aa		7.01	□□□□□ -1.29

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