RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590049.5

CAPNS1-209, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5

Gene CAPNS1, Length 592 nt, Biotype non stop decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-209ENST00000590049 CBSLP0DN79 551 aa11.13□□□□□ -0.63
CAPNS1-209ENST00000590049 ENO3P13929 434 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
CAPNS1-209ENST00000590049 CBSP35520 551 aa11.13□□□□□ -0.63
CAPNS1-209ENST00000590049 CCNFP41002 786 aa11.13□□□□□ -0.63
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CAPNS1-209ENST00000590049 MID2Q9UJV3 735 aa11.13□□□□□ -0.63
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CAPNS1-209ENST00000590049 CHUKO15111 745 aa11.12□□□□□ -0.63
CAPNS1-209ENST00000590049 TM9SF1O15321 606 aa11.12□□□□□ -0.63
CAPNS1-209ENST00000590049 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
CAPNS1-209ENST00000590049 KLHL2O95198 593 aa11.12□□□□□ -0.63
CAPNS1-209ENST00000590049 ZWINTO95229 277 aa11.12□□□□□ -0.63
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CAPNS1-209ENST00000590049 TLCD2A6NGC4 264 aa11.11□□□□□ -0.63
CAPNS1-209ENST00000590049 H3BQF6 201 aa11.11□□□□□ -0.63
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CAPNS1-209ENST00000590049 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP11.11□□□□□ -0.63
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CAPNS1-209ENST00000590049 ACAP2Q15057 778 aa11.11□□□□□ -0.63
CAPNS1-209ENST00000590049 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP11.11□□□□□ -0.63
CAPNS1-209ENST00000590049 PYCR3Q53H96 274 aa11.11□□□□□ -0.63
CAPNS1-209ENST00000590049 HHATQ5VTY9 493 aa11.11□□□□□ -0.63
CAPNS1-209ENST00000590049 PODNL1Q6PEZ8 512 aa11.11□□□□□ -0.63
CAPNS1-209ENST00000590049 FAM180AQ6UWF9 173 aa11.11□□□□□ -0.63
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