RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588780.5

CAPNS1-205, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,035 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-205ENST00000588780 LILRB4Q8NHJ6 448 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPNS1-205ENST00000588780 MAGEC3Q8TD91 643 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPNS1-205ENST00000588780 RND1Q92730 232 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPNS1-205ENST00000588780 CXXC4Q9H2H0 198 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPNS1-205ENST00000588780 SLC24A3Q9HC58 644 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPNS1-205ENST00000588780 UTP6Q9NYH9 597 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
CAPNS1-205ENST00000588780 AKAP6Q13023 2319 aa20.55■□□□□ 0.88
CAPNS1-205ENST00000588780 A0A0U1RQJ8 604 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-205ENST00000588780 A0A1B0GTH9 108 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-205ENST00000588780 MROH6A6NGR9 719 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-205ENST00000588780 SOWAHDA6NJG2 315 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-205ENST00000588780 TXNDC9O14530 226 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-205ENST00000588780 FOXS1O43638 330 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-205ENST00000588780 PHF2O75151 1096 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-205ENST00000588780 SLC25A12O75746 678 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-205ENST00000588780 GAS8O95995 478 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-205ENST00000588780 AOAHP28039 575 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-205ENST00000588780 MSX1P28360 303 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-205ENST00000588780 CCNFP41002 786 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-205ENST00000588780 PARP6Q2NL67 630 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-205ENST00000588780 ADCK2Q7Z695 626 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-205ENST00000588780 FGD2Q7Z6J4 655 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-205ENST00000588780 CHERPQ8IWX8 916 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-205ENST00000588780 HMGCLL1Q8TB92 370 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-205ENST00000588780 FAM57AQ8TBR7 257 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-205ENST00000588780 NINJ1Q92982 152 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-205ENST00000588780 PLCD4Q9BRC7 762 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-205ENST00000588780 IFNKQ9P0W0 207 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-205ENST00000588780 ANAPC5Q9UJX4 755 aa20.54■□□□□ 0.88
CAPNS1-205ENST00000588780 A0A1W2PPV9 198 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-205ENST00000588780 TOXO94900 526 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-205ENST00000588780 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-205ENST00000588780 PKMP14618 531 aaKnown RBP20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-205ENST00000588780 RNFT1Q5M7Z0 435 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-205ENST00000588780 KCTD11Q693B1 232 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-205ENST00000588780 SUSD1Q6UWL2 747 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-205ENST00000588780 ANKRD37Q7Z713 158 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-205ENST00000588780 LUZP1Q86V48 1076 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-205ENST00000588780 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-205ENST00000588780 CLYBLQ8N0X4 340 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-205ENST00000588780 OR9A4Q8NGU2 314 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-205ENST00000588780 OR4L1Q8NH43 312 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-205ENST00000588780 M1APQ8TC57 530 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-205ENST00000588780 MCOLN3Q8TDD5 553 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-205ENST00000588780 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-205ENST00000588780 CDCP1Q9H5V8 836 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-205ENST00000588780 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-205ENST00000588780 ABCF3Q9NUQ8 709 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-205ENST00000588780 SPATA7Q9P0W8 599 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-205ENST00000588780 PCYOX1Q9UHG3 505 aa20.53■□□□□ 0.88
CAPNS1-205ENST00000588780 NDC80O14777 642 aa20.52■□□□□ 0.88
CAPNS1-205ENST00000588780 NEURL1O76050 574 aa20.52■□□□□ 0.88
CAPNS1-205ENST00000588780 AGTR2P50052 363 aa20.52■□□□□ 0.88
CAPNS1-205ENST00000588780 PRAMEP78395 509 aa20.52■□□□□ 0.88
CAPNS1-205ENST00000588780 OTOAQ7RTW8 1153 aa20.52■□□□□ 0.88
CAPNS1-205ENST00000588780 MARVELD2Q8N4S9 558 aa20.52■□□□□ 0.88
CAPNS1-205ENST00000588780 KRT35Q92764 455 aa20.52■□□□□ 0.88
CAPNS1-205ENST00000588780 TMEM125Q96AQ2 219 aa20.52■□□□□ 0.88
CAPNS1-205ENST00000588780 PANX3Q96QZ0 392 aa20.52■□□□□ 0.88
CAPNS1-205ENST00000588780 CHP1Q99653 195 aa20.52■□□□□ 0.88
CAPNS1-205ENST00000588780 NPAS2Q99743 824 aa20.52■□□□□ 0.88
CAPNS1-205ENST00000588780 OLFM1Q99784 485 aa20.52■□□□□ 0.88
CAPNS1-205ENST00000588780 POLDIP3Q9BY77 421 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
CAPNS1-205ENST00000588780 HCN3Q9P1Z3 774 aa20.52■□□□□ 0.88
CAPNS1-205ENST00000588780 SLC2A6Q9UGQ3 507 aa20.52■□□□□ 0.88
CAPNS1-205ENST00000588780 HCFC1P51610 2035 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-205ENST00000588780 OR2W5A6NFC9 320 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-205ENST00000588780 PSMD3O43242 534 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-205ENST00000588780 NME2P1O60361 137 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-205ENST00000588780 PRMT3O60678 531 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-205ENST00000588780 STATHP02808 62 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-205ENST00000588780 NME2P22392 152 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-205ENST00000588780 DNASE1P24855 282 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-205ENST00000588780 XCR1P46094 333 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-205ENST00000588780 LTBQ06643 244 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-205ENST00000588780 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-205ENST00000588780 Q71RC1 249 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-205ENST00000588780 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-205ENST00000588780 PAQR7Q86WK9 346 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-205ENST00000588780 OR13J1Q8NGT2 312 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-205ENST00000588780 LPAR4Q99677 370 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-205ENST00000588780 SYNPO2LQ9H987 977 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-205ENST00000588780 MMP25Q9NPA2 562 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-205ENST00000588780 EDARQ9UNE0 448 aa20.51■□□□□ 0.87
CAPNS1-205ENST00000588780 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-205ENST00000588780 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-205ENST00000588780 KPNA5O15131 536 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-205ENST00000588780 METTL18O95568 372 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-205ENST00000588780 PTMAP06454 111 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-205ENST00000588780 TPM3P06753 285 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-205ENST00000588780 RFC3P40938 356 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-205ENST00000588780 DGKQP52824 942 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-205ENST00000588780 COPS2P61201 443 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-205ENST00000588780 TFF3Q07654 80 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-205ENST00000588780 PMPCAQ10713 525 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-205ENST00000588780 PTK6Q13882 451 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-205ENST00000588780 FAM53BQ14153 422 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-205ENST00000588780 SEMA3AQ14563 771 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-205ENST00000588780 P3H1Q32P28 736 aa20.5■□□□□ 0.87
CAPNS1-205ENST00000588780 SFT2D3Q587I9 215 aa20.5■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.4 ms