RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580584.1

PMP22-208, Transcript of peripheral myelin protein 22, human

TSL 3

Gene PMP22, Length 428 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PMP22-208	ENST00000580584	MMAB	Q96EY8	250 aa	Predicted RBP	14.76	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	SMAD5	Q99717	465 aa	Known RBP	14.76	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	MACROD1	Q9BQ69	325 aa		14.76	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	YIPF2	Q9BWQ6	316 aa		14.76	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	SGPP1	Q9BX95	441 aa		14.76	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	DRC3	Q9H069	523 aa		14.76	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	PCBD2	Q9H0N5	130 aa		14.76	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	TMEM184C	Q9NVA4	438 aa		14.76	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	TRPC4	Q9UBN4	977 aa		14.76	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	CXorf49	A8MYA2	514 aa	Predicted RBP	14.75	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	CDC7	O00311	574 aa		14.75	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	FOXS1	O43638	330 aa		14.75	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	BCL6	P41182	706 aa		14.75	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	CD97	P48960	835 aa		14.75	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	TAS2R39	P59534	338 aa		14.75	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	RPS15A	P62244	130 aa	Known RBP	14.75	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	CBLB	Q13191	982 aa		14.75	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	MYBPC3	Q14896	1274 aa		14.75	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	TRADD	Q15628	312 aa		14.75	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	SYT16	Q17RD7	645 aa		14.75	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	GARNL3	Q5VVW2	1013 aa		14.75	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	CAPN13	Q6MZZ7	669 aa	Predicted RBP	14.75	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	PRSS41	Q7RTY9	318 aa		14.75	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	LAPTM4B	Q86VI4	370 aa		14.75	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	CEP97	Q8IW35	865 aa		14.75	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	RBMXL3	Q8N7X1	1067 aa	Known RBP	14.75	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	C8orf44	Q96CB5	159 aa		14.75	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	MVB12A	Q96EY5	273 aa		14.75	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	VPS39	Q96JC1	886 aa		14.75	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	OR4K3	Q96R72	315 aa		14.75	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	SEMA3G	Q9NS98	782 aa		14.75	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	C3orf18	Q9UK00	162 aa		14.75	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	CDC14A	Q9UNH5	594 aa		14.75	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	PCDHGB7	Q9Y5F8	929 aa		14.75	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	SETX	Q7Z333	2677 aa	Known RBP	14.75	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	RELN	P78509	3460 aa		14.75	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	IGLV3-12	A0A075B6K2	115 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	TTLL8	A6PVC2	850 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	TXNDC9	O14530	226 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	DPM1	O60762	260 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	SORBS2	O94875	1100 aa	Known RBP	14.74	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	ANXA5	P08758	320 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	NPPB	P16860	134 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	CCND1	P24385	295 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	HRH2	P25021	359 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	ITGA3	P26006	1051 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	SLC26A3	P40879	764 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	PLTP	P55058	493 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	AP1S2	P56377	157 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	MAT1A	Q00266	395 aa	Known RBP	14.74	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	MEF2A	Q02078	507 aa	Predicted RBP	14.74	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	AIMP2	Q13155	320 aa	Known RBP	14.74	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	PPP1R3A	Q16821	1122 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	PRR30	Q53SZ7	412 aa	Predicted RBP	14.74	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	SLC6A19	Q695T7	634 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	JMJD6	Q6NYC1	403 aa	Predicted RBP	14.74	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	LCTL	Q6UWM7	567 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	SHISA5	Q8N114	240 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584		Q8NA96	180 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	OR11G2	Q8NGC1	345 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	OR9A4	Q8NGU2	314 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	OR56A3	Q8NH54	315 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	ANKRD49	Q8WVL7	239 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	MIB2	Q96AX9	1013 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	NACC2	Q96BF6	587 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	FBXL8	Q96CD0	374 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	14.74	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	TSNARE1	Q96NA8	513 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	MCMBP	Q9BTE3	642 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	TRIM54	Q9BYV2	358 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	UNK	Q9C0B0	810 aa	Known RBP	14.74	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	RHOJ	Q9H4E5	214 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	ZNF552	Q9H707	407 aa	Predicted RBP	14.74	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	CAB39L	Q9H9S4	337 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	ATP13A2	Q9NQ11	1180 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	NSMCE4A	Q9NXX6	385 aa		14.74	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	UTP11	Q9Y3A2	253 aa	Known RBP	14.74	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	TNRC6A	Q8NDV7	1962 aa	Known RBP	14.74	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	FLNC	Q14315	2725 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	TCRBV9S1A1T	A0A576	114 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	EIF3H	O15372	352 aa	Known RBP eCLIP	14.73	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	14.73	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	LCMT2	O60294	686 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	ALPP	P05187	535 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	ENO2	P09104	434 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	GPX6	P59796	221 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	FAAH2	Q6GMR7	532 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	ZDHHC24	Q6UX98	284 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	CCDC25	Q86WR0	208 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	NKAP	Q8N5F7	415 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	ZCCHC10	Q8TBK6	192 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	FBXO25	Q8TCJ0	367 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	PDLIM5	Q96HC4	596 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	HAUS8	Q9BT25	410 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	RAB17	Q9H0T7	212 aa		14.73	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	ZBTB20	Q9HC78	741 aa	Predicted RBP	14.73	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	MTO1	Q9Y2Z2	717 aa	Known RBP	14.73	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	KCNE1B	A0A087WTH5	132 aa		14.72	□□□□□ -0.05
PMP22-208	ENST00000580584	ESYT3	A0FGR9	886 aa		14.72	□□□□□ -0.05

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