RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577468.2

PTPRM-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 701 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-204ENST00000577468 MADCAM1Q13477 382 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 TUBB3Q13509 450 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 PEX6Q13608 980 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 SHBQ15464 509 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 MED22Q15528 200 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 FAM189A2Q15884 450 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 ETFDHQ16134 617 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 BMT2Q1RMZ1 405 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 LRRC36Q1X8D7 754 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 AP5B1Q2VPB7 878 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 BTBD16Q32M84 506 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 USP41Q3LFD5 358 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 SLC36A3Q495N2 470 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 TEX44Q53QW1 395 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 CCDC157Q569K6 752 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 Q5PR19 223 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 PDZK1Q5T2W1 519 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 SEL1L2Q5TEA6 688 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 MFSD14CQ5VZR4 134 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 ANKS6Q68DC2 871 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 TMEM71Q6P5X7 295 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 C5orf46Q6UWT4 87 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 PEX26Q7Z412 305 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 KCNK18Q7Z418 384 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 HAUS6Q7Z4H7 955 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 DPPA2Q7Z7J5 298 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 PRUNE1Q86TP1 453 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 HORMAD1Q86X24 394 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 NRROSQ86YC3 692 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 PLD3Q8IV08 490 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 LRRC8AQ8IWT6 810 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 IFT20Q8IY31 132 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 RCOR2Q8IZ40 523 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 CDK20Q8IZL9 346 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 FAM58AQ8N1B3 248 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 GALNT4Q8N4A0 578 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 LRRC17Q8N6Y2 441 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 NECAB1Q8N987 351 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 NHLRC2Q8NBF2 726 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 CCNYQ8ND76 341 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 C17orf47Q8NEP4 570 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 OR7D4Q8NG98 312 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 OR5M1Q8NGP8 315 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 OR2T3Q8NH03 318 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 NFKBIDQ8NI38 313 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 CYP2W1Q8TAV3 490 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 FNDC8Q8TC99 324 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 PNPT1Q8TCS8 783 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 SLC22A17Q8WUG5 538 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 SELENOMQ8WWX9 145 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 RAB1CQ92928 201 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 MRGPRFQ96AM1 343 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 EME1Q96AY2 570 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 REPS1Q96D71 796 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 LRIG1Q96JA1 1093 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 PRRC1Q96M27 445 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 LRFN5Q96NI6 719 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF570Q96NI8 536 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 NECTIN4Q96NY8 510 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF607Q96SK3 696 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 SEC22CQ9BRL7 303 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 FAM213AQ9BRX8 229 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 ZYG11BQ9C0D3 744 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 CDT1Q9H211 546 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 FBXO44Q9H4M3 255 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 MINDY3Q9H8M7 445 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 MARCH7Q9H992 704 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 ARMT1Q9H993 441 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 MLXIPLQ9NP71 852 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 ADAP2Q9NPF8 381 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 TLR8Q9NR97 1041 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 SEMA4GQ9NTN9 838 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 ZCCHC3Q9NUD5 404 aaKnown RBP2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 PANK4Q9NVE7 773 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 GIN1Q9NXP7 522 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 GDE1Q9NZC3 331 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 PDP1Q9P0J1 537 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 CPNE7Q9UBL6 633 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 BCAP29Q9UHQ4 241 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 NAGKQ9UJ70 344 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 HAO1Q9UJM8 370 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 TUBD1Q9UJT1 453 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 MID2Q9UJV3 735 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 SHOC2Q9UQ13 582 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 HPSEQ9Y251 543 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 PLEKHA6Q9Y2H5 1048 aa2.96□□□□□ -1.94
PTPRM-204ENST00000577468 PADI2Q9Y2J8 665 aa2.96□□□□□ -1.94
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms