RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556007.6

TIMM9-208, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane 9, human

TSL 3 BASIC

Gene TIMM9, Length 746 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TIMM9-208	ENST00000556007	P4HA1	P13674	534 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	GAP43	P17677	238 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	CD22	P20273	847 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	EFNA1	P20827	205 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	TIA1	P31483	386 aa	Known RBP eCLIP	3.2	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	CDH11	P55287	796 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	NME5	P56597	212 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	STX1B	P61266	288 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007		Q6ZSR9	355 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	TIGD4	Q8IY51	512 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	PEX5L	Q8IYB4	626 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	CPSF7	Q8N684	471 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	AMER3	Q8N944	861 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	OR2T11	Q8NH01	316 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	OLIG1	Q8TAK6	271 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	C9orf43	Q8TAL5	461 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	SLAMF9	Q96A28	289 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	FAM81B	Q96LP2	452 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	PRAM1	Q96QH2	718 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	MYADM	Q96S97	322 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	SEPHS2	Q99611	448 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	HNRNPAB	Q99729	332 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	FNDC11	Q9BVV2	318 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	TRIM7	Q9C029	511 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	LAT2	Q9GZY6	243 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	WNT5B	Q9H1J7	359 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	MINDY3	Q9H8M7	445 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	P4HTM	Q9NXG6	502 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	NPAP1	Q9NZP6	1156 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	FETUB	Q9UGM5	382 aa		3.2	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	ADAMTS9	Q9P2N4	1935 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007		A0A0A6YYC8	382 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	PRSS51	A0A1B0GVH4	220 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	YDJC	A8MPS7	323 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007		I3L1I5	382 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	ZNF197	O14709	1029 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	BCAS2	O75934	225 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	AKAP3	O75969	853 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	MOCS3	O95396	460 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	OR2T7	P0C7T2	308 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	ACP2	P11117	423 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	ITIH1	P19827	911 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	EEF1B2	P24534	225 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	ACAT1	P24752	427 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	PSMB4	P28070	264 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	SLC6A12	P48065	614 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	ST8SIA6	P61647	398 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	PNRC1	Q12796	327 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	NPRL3	Q12980	569 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	NR1D2	Q14995	579 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	UGCG	Q16739	394 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	KBTBD12	Q3ZCT8	623 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	DCAF10	Q5QP82	559 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	GRTP1	Q5TC63	336 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	CYP4A22	Q5TCH4	519 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	TXNRD3NB	Q6F5E7	133 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	CORO6	Q6QEF8	472 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	RABEPK	Q7Z6M1	372 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	TMPRSS11B	Q86T26	416 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	DZIP1	Q86YF9	867 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	MARVELD2	Q8N4S9	558 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	OR1J1	Q8NGS3	322 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	ST7L	Q8TDW4	575 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	ATL1	Q8WXF7	558 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	BSCL2	Q96G97	398 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	C18orf12	Q96KH6	178 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	SPATA33	Q96N06	139 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	SFXN2	Q96NB2	322 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	IWS1	Q96ST2	819 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	PKP2	Q99959	881 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	SYT15	Q9BQS2	421 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	PITPNM3	Q9BZ71	974 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	ARRDC1-AS1	Q9H2J1	176 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	TNMD	Q9H2S6	317 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	FN3K	Q9H479	309 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	HHATL	Q9HCP6	504 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007		Q9N2K0	584 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	INTS9	Q9NV88	658 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	DNAJC17	Q9NVM6	304 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	DPP3	Q9NY33	737 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	LEF1	Q9UJU2	399 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	APPL1	Q9UKG1	709 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	ABT1	Q9ULW3	272 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	SPIN1	Q9Y657	262 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	ACE	P12821	1306 aa		3.19	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		3.18	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007		A0A1W2PRB8	838 aa		3.18	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	KRT87P	A6NCN2	255 aa		3.18	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007		E9PI62	339 aa		3.18	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	KLF11	O14901	512 aa		3.18	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	TSPAN1	O60635	241 aa		3.18	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	SEC22B	O75396	215 aa		3.18	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	STAM2	O75886	525 aa		3.18	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	SLC16A8	O95907	504 aa		3.18	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	HPD	P32754	393 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
TIMM9-208	ENST00000556007	MAGEA11	P43364	429 aa		3.18	□□□□□ -1.9

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