RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551592.5

SENP1-208, Transcript of SUMO specific peptidase 1, human

TSL 3

Gene SENP1, Length 866 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SENP1-208	ENST00000551592	ILF3	Q12906	894 aa	Known RBP eCLIP	4.63	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	HNRNPA0	Q13151	305 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	HERC3	Q15034	1050 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	SLC35D3	Q5M8T2	416 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	CCNYL2	Q5T2Q4	361 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	PDSS1	Q5T2R2	415 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	CAPRIN2	Q6IMN6	1127 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	MIER3	Q7Z3K6	550 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	LAX1	Q8IWV1	398 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	CDK20	Q8IZL9	346 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	CCDC63	Q8NA47	563 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	SMG7	Q92540	1137 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	SPATA13	Q96N96	652 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	TMEM204	Q9BSN7	226 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	URM1	Q9BTM9	101 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	FSD1	Q9BTV5	496 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	IDI2	Q9BXS1	227 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	OR2B2	Q9GZK3	357 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	CPVL	Q9H3G5	476 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	CUEDC2	Q9H467	287 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	ZDHHC6	Q9H6R6	413 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	FAM207A	Q9NSI2	230 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	KCNK6	Q9Y257	313 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	ZNF510	Q9Y2H8	683 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	IGLV9-49	A0A0B4J1Y8	123 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	C2orf92	A0A1B0GVN3	265 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	MAGEB16	A2A368	324 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	PRAC2	D3DTV9	90 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	ACSL4	O60488	711 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	STAM2	O75886	525 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	SLC4A1	P02730	911 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	NGFR	P08138	427 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	FRMD6-AS1	P0C7T7	363 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	CCNA2	P20248	432 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	CA6	P23280	308 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	ALDH1B1	P30837	517 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	ATXN3	P54252	364 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	GFPT1	Q06210	699 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	CETN1	Q12798	172 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	DMP1	Q13316	513 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	GAMT	Q14353	236 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	GPR33	Q49SQ1	333 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	NEK5	Q6P3R8	708 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	SIGLEC15	Q6ZMC9	328 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	TOM1L2	Q6ZVM7	507 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	CPEB2	Q7Z5Q1	589 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	PRUNE1	Q86TP1	453 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	CCDC60	Q8IWA6	550 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	TDH	Q8IZJ6	230 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	PRSS35	Q8N3Z0	413 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	LMNTD1	Q8N9Z9	388 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	CNNM3	Q8NE01	707 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	NEK11	Q8NG66	645 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	OR52E1	Q8NGJ3	308 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	FAM46B	Q96A09	425 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	TMEM186	Q96B77	213 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	CFAP36	Q96G28	342 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	ZNF560	Q96MR9	790 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	NAP1L3	Q99457	506 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	PKP2	Q99959	881 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	SLC39A8	Q9C0K1	460 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	SHARPIN	Q9H0F6	387 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	EVA1A	Q9H8M9	152 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	SYTL2	Q9HCH5	934 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	CD93	Q9NPY3	652 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	HPF1	Q9NWY4	346 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	AGTPBP1	Q9UPW5	1226 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	ARID2	Q68CP9	1835 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	TMEM129	A0AVI4	362 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	ANTXRL	A6NF34	631 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	ATP6V0E1	O15342	81 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	PRDM1	O75626	825 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	LIF	P15018	202 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	RABIF	P47224	123 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	SMS	P52788	366 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	GCNT1	Q02742	428 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	TSTA3	Q13630	321 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	MAPK11	Q15759	364 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	ZC2HC1C	Q53FD0	456 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	XKR6	Q5GH73	641 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	TTC27	Q6P3X3	843 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	CTR9	Q6PD62	1173 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	LIN28B	Q6ZN17	250 aa	Known RBP eCLIP	4.61	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	MARK2	Q7KZI7	788 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	TMEM126B	Q8IUX1	230 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	NAGS	Q8N159	534 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	KLHDC1	Q8N7A1	406 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	TAF4B	Q92750	862 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	DTD2	Q96FN9	168 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	RBM41	Q96IZ5	413 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	DUX5	Q96PT3	197 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	CDCA3	Q99618	268 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	DDX50	Q9BQ39	737 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SENP1-208	ENST00000551592	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67

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