RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000547701.5

CTDSP2-203, Transcript of CTD small phosphatase 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDSP2, Length 988 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDSP2-203ENST00000547701 SLC25A18Q9H1K4 315 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 CAB39LQ9H9S4 337 aa22.19■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 HMX2A2RU54 273 aa22.18■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 MED26O95402 600 aa22.18■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 FAM87AP0C7U9 286 aa22.18■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 NFKB2Q00653 900 aa22.18■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 C19orf57Q0VDD7 668 aa22.18■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 KCNAB2Q13303 367 aa22.18■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 MLIPQ5VWP3 458 aa22.18■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 MED25Q71SY5 747 aa22.18■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 RAB43Q86YS6 212 aa22.18■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 CNPY4Q8N129 248 aa22.18■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP22.18■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 IFT81Q8WYA0 676 aa22.18■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 ISL2Q96A47 359 aa22.18■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 SH2B3Q9UQQ2 575 aa22.18■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa22.18■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 NUP210LQ5VU65 1888 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP22.17■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 FAM155BO75949 473 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 IPO13O94829 963 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 GUCA1CO95843 209 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 IGHEP01854 428 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 GRK3P35626 688 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 CCR8P51685 355 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 NKG7Q16617 165 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 PDPRQ8NCN5 879 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 SLC44A1Q8WWI5 657 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 PYCR2Q96C36 320 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 SPSB2Q99619 263 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 PELI2Q9HAT8 420 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 ZNF304Q9HCX3 659 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 MLXIPLQ9NP71 852 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 COPG2Q9UBF2 871 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 KCNE2Q9Y6J6 123 aa22.17■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 CEACAM4O75871 244 aa22.16■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 UMODP07911 640 aa22.16■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 ABHD2P08910 425 aa22.16■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 FOLR3P41439 243 aa22.16■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 DSG2Q14126 1118 aa22.16■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 NDUFA9Q16795 377 aa22.16■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 TCTN3Q6NUS6 607 aa22.16■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 ADCK2Q7Z695 626 aa22.16■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 ISCA2Q86U28 154 aa22.16■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 THOC6Q86W42 341 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 CAMKVQ8NCB2 501 aa22.16■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 RHEBL1Q8TAI7 183 aa22.16■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 SLC5A11Q8WWX8 675 aa22.16■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 NEIL2Q969S2 332 aa22.16■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 CAPS2Q9BXY5 557 aa22.16■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 TGIF2Q9GZN2 237 aa22.16■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 NMRAL1Q9HBL8 299 aa22.16■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 GPRC5BQ9NZH0 403 aa22.16■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 ZNF180Q9UJW8 692 aa22.16■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 ZNF462Q96JM2 2506 aa22.15■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 TRBC2A0A5B9 178 aa22.15■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 RFPL1O75677 317 aa22.15■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 EIF2S1P05198 315 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 CDH1P12830 882 aa22.15■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 AHRP35869 848 aa22.15■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 SOX8P57073 446 aa22.15■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 PWP1Q13610 501 aa22.15■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 HKDC1Q2TB90 917 aa22.15■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 SULT1C3Q6IMI6 304 aa22.15■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 GPSM1Q86YR5 675 aa22.15■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 MFSD9Q8NBP5 474 aa22.15■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 STAG3L4Q8TBR4 150 aa22.15■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 SLC22A14Q9Y267 594 aa22.15■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 ACOT9Q9Y305 439 aa22.15■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP22.15■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa22.15■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 SLC22A7Q9Y694 548 aa22.15■■□□□ 1.14
CTDSP2-203ENST00000547701 A0A087X1B8 175 aa22.14■■□□□ 1.13
CTDSP2-203ENST00000547701 B8ZZF3 427 aa22.14■■□□□ 1.13
CTDSP2-203ENST00000547701 H0YIG0 161 aa22.14■■□□□ 1.13
CTDSP2-203ENST00000547701 PCDH17O14917 1159 aa22.14■■□□□ 1.13
CTDSP2-203ENST00000547701 FOXS1O43638 330 aa22.14■■□□□ 1.13
CTDSP2-203ENST00000547701 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
CTDSP2-203ENST00000547701 CYC1P08574 325 aa22.14■■□□□ 1.13
CTDSP2-203ENST00000547701 LTA4HP09960 611 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
CTDSP2-203ENST00000547701 MMP11P24347 488 aa22.14■■□□□ 1.13
CTDSP2-203ENST00000547701 CNTFP26441 200 aa22.14■■□□□ 1.13
CTDSP2-203ENST00000547701 MAGEA12P43365 314 aa22.14■■□□□ 1.13
CTDSP2-203ENST00000547701 SERPINB9P50453 376 aa22.14■■□□□ 1.13
CTDSP2-203ENST00000547701 RRADP55042 308 aa22.14■■□□□ 1.13
CTDSP2-203ENST00000547701 PCDH1Q08174 1060 aa22.14■■□□□ 1.13
CTDSP2-203ENST00000547701 E2F2Q14209 437 aa22.14■■□□□ 1.13
CTDSP2-203ENST00000547701 CSHL1Q14406 222 aa22.14■■□□□ 1.13
CTDSP2-203ENST00000547701 SLC9A5Q14940 896 aa22.14■■□□□ 1.13
CTDSP2-203ENST00000547701 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP22.14■■□□□ 1.137e-7■■□□□ 14.4
CTDSP2-203ENST00000547701 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
CTDSP2-203ENST00000547701 FRA10AC1Q70Z53 315 aa22.14■■□□□ 1.13
CTDSP2-203ENST00000547701 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
CTDSP2-203ENST00000547701 SEC16BQ96JE7 1060 aa22.14■■□□□ 1.13
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