RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546248.5

TRDN-205, Transcript of triadin, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene TRDN, Length 1,179 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDN-205ENST00000546248 USP13Q92995 863 aaPredicted RBP5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 RILPQ96NA2 401 aa5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 TSNARE1Q96NA8 513 aa5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 SLC46A1Q96NT5 459 aa5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 BIRC8Q96P09 236 aa5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 BTBD10Q9BSF8 475 aa5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 C17orf80Q9BSJ5 609 aa5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 WWP1Q9H0M0 922 aa5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 FAM96AQ9H5X1 160 aa5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 COG4Q9H9E3 785 aa5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 POPDC3Q9HBV1 291 aa5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 BPIFA1Q9NP55 256 aa5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 ASAH2Q9NR71 780 aa5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 IL17CQ9P0M4 197 aa5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 KCNE5Q9UJ90 142 aa5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 IKZF3Q9UKT9 509 aa5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 CRYL1Q9Y2S2 319 aa5.33□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 SCN5AQ14524 2016 aa5.32□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 MSANTD3-TMEFF1A0A0A6YYJ0 341 aa5.32□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 CXorf51AA0A1B0GTR3 108 aa5.32□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 TYW5A2RUC4 315 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 POM121BA6NF01 834 aa5.32□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 H3BMM5 538 aa5.32□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 STX7O15400 261 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 ZBTB14O43829 449 aa5.32□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 OR1I1O60431 355 aa5.32□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 NDUFS3O75489 264 aa5.32□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 CSPG5O95196 566 aa5.32□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 SLC4A1P02730 911 aa5.32□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 ENO1P06733 434 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 RHOP08100 348 aa5.32□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 ALPIP09923 528 aa5.32□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 SRCP12931 536 aa5.32□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 PKMP14618 531 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 MYOGP15173 224 aa5.32□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 CTPS1P17812 591 aa5.32□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 AOC1P19801 751 aa5.32□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 IMPDH1P20839 514 aa5.32□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 CD9P21926 228 aa5.32□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 SP100P23497 879 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 HLA-FP30511 346 aa5.32□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 CTNNB1P35222 781 aa5.32□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 HNF1BP35680 557 aa5.32□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 CPA2P48052 419 aa5.32□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 RPL14P50914 215 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 STC1P52823 247 aa5.32□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 AP1S1P61966 158 aa5.32□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 UBE3AQ05086 875 aa5.32□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 BCL2L1Q07817 233 aa5.32□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 PRKAA1Q13131 559 aa5.32□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 CDH18Q13634 790 aa5.32□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 GEN1Q17RS7 908 aa5.32□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 FAM83EQ2M2I3 478 aa5.32□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 MYLK3Q32MK0 819 aa5.32□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 ZRANB3Q5FWF4 1079 aa5.32□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 CTSL3PQ5NE16 218 aa5.32□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 ARMC12Q5T9G4 340 aa5.32□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 FAM219BQ5XKK7 198 aa5.32□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 RETSATQ6NUM9 610 aa5.32□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 AFTPHQ6ULP2 937 aa5.32□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 RTL10Q7L3V2 364 aa5.32□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 GPR149Q86SP6 731 aa5.32□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 LIX1LQ8IVB5 337 aa5.32□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 ELMOD1Q8N336 334 aa5.32□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 CPSF7Q8N684 471 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 OR56A3Q8NH54 315 aa5.32□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 MAGEC3Q8TD91 643 aa5.32□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 TMEM125Q96AQ2 219 aa5.32□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 PTERQ96BW5 349 aa5.32□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 ZNF707Q96C28 371 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 BOD1Q96IK1 185 aa5.32□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 CNDP1Q96KN2 507 aa5.32□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 LRRC3BQ96PB8 259 aa5.32□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 OR52B2Q96RD2 323 aa5.32□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 ATOH8Q96SQ7 321 aa5.32□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 ADGRE3Q9BY15 652 aa5.32□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 SHCBP1LQ9BZQ2 653 aa5.32□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 TM6SF2Q9BZW4 377 aa5.32□□□□□ -1.56
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TRDN-205ENST00000546248 ZNF700Q9H0M5 742 aa5.32□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 P2RY12Q9H244 342 aa5.32□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP5.32□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 ZNF385DQ9H6B1 395 aa5.32□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 WDR55Q9H6Y2 383 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 MAGEE1Q9HCI5 957 aa5.32□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 NCKIPSDQ9NZQ3 722 aa5.32□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 HACD3Q9P035 362 aa5.32□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 TAGLN3Q9UI15 199 aa5.32□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 SLCO3A1Q9UIG8 710 aa5.32□□□□□ -1.56
TRDN-205ENST00000546248 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP5.32□□□□□ -1.56
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