RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000536710.1

PRKDC-208, Transcript of protein kinase, DNA-activated, catalytic subunit, human

TSL 4

Gene PRKDC, Length 554 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRKDC-208	ENST00000536710	MID1IP1	Q9NPA3	183 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	SIX2	Q9NPC8	291 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	INTS9	Q9NV88	658 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	TMOD3	Q9NYL9	352 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	SLC12A6	Q9UHW9	1150 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	NSG2	Q9Y328	171 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	KLK4	Q9Y5K2	254 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710		A0A0A6YYC8	382 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	IGHV4-61	A0A0C4DH41	118 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	SMIM1	B2RUZ4	78 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710		I3L1I5	382 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710		O00370	1275 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	PNP	P00491	289 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	IGHV4-59	P01825	116 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	THEGL	P0DJG4	465 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	P4HA1	P13674	534 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	ITGA3	P26006	1051 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	IER3	P46695	156 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	DNA2	P51530	1060 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	DLX5	P56178	289 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	KCNJ10	P78508	379 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	ABR	Q12979	859 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	GPR33	Q49SQ1	333 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	GTDC1	Q4AE62	458 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	UGT3A1	Q6NUS8	523 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	CEACAM20	Q6UY09	585 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	PIGZ	Q86VD9	579 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	SIAH3	Q8IW03	269 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	OR7A2P	Q8NGA2	310 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	OR4C3	Q8NH37	302 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	SUSD6	Q92537	303 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	ATP6V0A1	Q93050	837 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	SNRNP40	Q96DI7	357 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	SENP5	Q96HI0	755 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	PANX3	Q96QZ0	392 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	ZNF559	Q9BR84	538 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	MMP28	Q9H239	520 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	SPG21	Q9NZD8	308 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	NPIPA3	F8WFD2	350 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	EXTL3	O43909	919 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	ATP1B1	P05026	303 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	CASP3	P42574	277 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	MAGEB1	P43366	347 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	OR3A1	P47881	315 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	KHK	P50053	298 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	KIAA1024L	P59773	190 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	MYL7	Q01449	175 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	CETN1	Q12798	172 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	NPRL3	Q12980	569 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	P2RY6	Q15077	328 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	ZRSR1	Q15695	479 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	MAPK11	Q15759	364 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	PM20D1	Q6GTS8	502 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	KIRREL3	Q8IZU9	778 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	NIPA2	Q8N8Q9	360 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	AMER3	Q8N944	861 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	OR10V1	Q8NGI7	309 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	PIK3R3	Q92569	461 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	TSSK2	Q96PF2	358 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	C17orf62	Q9BQA9	187 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	OSBPL8	Q9BZF1	889 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	RPF1	Q9H9Y2	349 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	OR6C2	Q9NZP2	312 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	AKAP7	Q9P0M2	348 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	MAN1B1	Q9UKM7	699 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	GRID1	Q9ULK0	1009 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	NCKAP1	Q9Y2A7	1128 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	COLEC10	Q9Y6Z7	277 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	IL16	Q14005	1332 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	STK36	Q9NRP7	1315 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	SNURFL	B1AK76	121 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710		H3BMM5	538 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	BMPR1B	O00238	502 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	GLRA3	O75311	464 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	TRMU	O75648	421 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	CDK2AP2	O75956	126 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	AKAP3	O75969	853 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	MT-ND3	P03897	115 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	GP1BB	P13224	206 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	STMN1	P16949	149 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	GOT1	P17174	413 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	VCL	P18206	1134 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	DUT	P33316	252 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	GLIPR1	P48060	266 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	ARF5	P84085	180 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	CBX3	Q13185	183 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	KIAA1644	Q3SXP7	199 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	ZNF542P	Q5EBM4	170 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	PRAMEF8	Q5VWM4	474 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	ALKBH5	Q6P6C2	394 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	TMEM207	Q6UWW9	146 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PRKDC-208	ENST00000536710	GPR141	Q7Z602	305 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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