RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533069.1

PKP3-209, Transcript of plakophilin 3, humanhuman

TSL 2

Gene PKP3, Length 590 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3-209ENST00000533069 TRIM54Q9BYV2 358 aa15.9■□□□□ 0.14
PKP3-209ENST00000533069 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa15.9■□□□□ 0.14
PKP3-209ENST00000533069 PSAT1Q9Y617 370 aa15.9■□□□□ 0.14
PKP3-209ENST00000533069 BSNQ9UPA5 3926 aa15.89■□□□□ 0.14
PKP3-209ENST00000533069 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa15.89■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 CEACAM4O75871 244 aa15.89■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP15.89■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 SSTR1P30872 391 aa15.89■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 CASRP41180 1078 aa15.89■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 CCL11P51671 97 aa15.89■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 PGDP52209 483 aa15.89■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 GARNL3Q5VVW2 1013 aa15.89■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 AGTRAPQ6RW13 159 aa15.89■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 ZC3HC1Q86WB0 502 aaKnown RBP15.89■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 CSNK1A1LQ8N752 337 aa15.89■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 ATL1Q8WXF7 558 aa15.89■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 MVB12AQ96EY5 273 aa15.89■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa15.89■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 OR2A5Q96R48 311 aa15.89■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 MLXIPLQ9NP71 852 aa15.89■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 ABCF3Q9NUQ8 709 aa15.89■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 IKBKGQ9Y6K9 419 aa15.89■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa15.88■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa15.88■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 GOLGA6L10A6NI86 522 aa15.88■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 MAP2K7O14733 419 aa15.88■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP15.88■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 UMODP07911 640 aa15.88■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 ATXN8OSP0DMR3 200 aa15.88■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 ZNF37AP17032 561 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 NKG7Q16617 165 aa15.88■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 PHKG1Q16816 387 aa15.88■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 COX15Q7KZN9 410 aa15.88■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 TAOK1Q7L7X3 1001 aa15.88■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 FBF1Q8TES7 1133 aa15.88■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 VPS39Q96JC1 886 aa15.88■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 CABS1Q96KC9 395 aa15.88■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 C10orf90Q96M02 699 aa15.88■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 SPSB2Q99619 263 aa15.88■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 SGPP1Q9BX95 441 aa15.88■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 EPB41L4BQ9H329 900 aa15.88■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 RHOJQ9H4E5 214 aa15.88■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 ZNF304Q9HCX3 659 aa15.88■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 TMEM184CQ9NVA4 438 aa15.88■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP15.88■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 ARL15Q9NXU5 204 aa15.88■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 TXNDC16Q9P2K2 825 aa15.88■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 CDC14AQ9UNH5 594 aa15.88■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP15.88■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 PLAAQ9Y263 795 aa15.88■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 FAM159BA6NKW6 160 aa15.87■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 H7BY64 318 aa15.87■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 HAT1O14929 419 aa15.87■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 KLHL41O60662 606 aa15.87■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 CDH16O75309 829 aa15.87■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 NR1D1P20393 614 aa15.87■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 MMP11P24347 488 aa15.87■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 CNTFP26441 200 aa15.87■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 OR1D4P47884 311 aa15.87■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 NAE1Q13564 534 aa15.87■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 DCAF10Q5QP82 559 aa15.87■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 LGSNQ5TDP6 509 aa15.87■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 LCTLQ6UWM7 567 aa15.87■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa15.87■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 C17orf64Q86WR6 236 aa15.87■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 TDRPQ86YL5 185 aa15.87■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 HPS6Q86YV9 775 aa15.87■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa15.87■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 TEX19Q8NA77 164 aa15.87■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 CLEC1AQ8NC01 280 aa15.87■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 COL26A1Q96A83 441 aa15.87■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 THAP11Q96EK4 314 aa15.87■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 VPS50Q96JG6 964 aa15.87■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 PRAP1Q96NZ9 151 aa15.87■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 HAUS8Q9BT25 410 aa15.87■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 MCMBPQ9BTE3 642 aa15.87■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 POPDC3Q9HBV1 291 aa15.87■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 P4HTMQ9NXG6 502 aa15.87■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 CTSFQ9UBX1 484 aa15.87■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP15.87■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 RUVBL1Q9Y265 456 aaKnown RBP15.87■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa15.87■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa15.86■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 VSTM2BA6NLU5 285 aa15.86■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 K7EM74 188 aa15.86■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 MED26O95402 600 aa15.86■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 SAT1P21673 171 aa15.86■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 FBLP22087 321 aaKnown RBP15.86■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 SERPINB9P50453 376 aa15.86■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 OCA2Q04671 838 aa15.86■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 TLE1Q04724 770 aa15.86■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 DSG2Q14126 1118 aa15.86■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 HKDC1Q2TB90 917 aa15.86■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa15.86■□□□□ 0.13
PKP3-209ENST00000533069 CAPN12Q6ZSI9 719 aa15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms