RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516539.1

RNU6-1256P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1256, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1256P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1256P-201ENST00000516539 IKBKGQ9Y6K9 419 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 U3KQV3 271 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 UBE4BO95155 1302 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 FAM205AQ6ZU69 1335 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 SMCHD1A6NHR9 2005 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 A0A1W2PPI3 338 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 ANKRD61A6NGH8 418 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 SLC15A5A6NIM6 579 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 KPNA7A9QM74 516 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 C2CD4DB7Z1M9 353 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 H0YIG0 161 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 CLDN3O15551 220 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 SYNGR3O43761 229 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 SMPD2O60906 423 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 HMMRO75330 724 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 CLN5O75503 358 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 PRKRAO75569 313 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 AKR7A3O95154 331 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 OR6A2O95222 327 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 IFNB1P01574 187 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 APOHP02749 345 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 SFTPBP07988 381 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 SERPINF2P08697 491 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 GP1BBP13224 206 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 KRT5P13647 590 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 HLA-DOBP13765 273 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 ARRB2P32121 409 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 NSFP46459 744 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 NR2C2P49116 596 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 NUMBP49757 651 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 HNRNPFP52597 415 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 CLDN17P56750 224 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 KRTAP10-2P60368 255 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 IRX4P78413 519 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 DLG1Q12959 904 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 TRAF3Q13114 568 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 SCGB2A2Q13296 93 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 SNTA1Q13424 505 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 NFATC4Q14934 902 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 KIR2DS3Q14952 304 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 ITPRIPL2Q3MIP1 535 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 SLC35D3Q5M8T2 416 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 IRAK1BP1Q5VVH5 260 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 RAET1GQ6H3X3 334 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 UGT3A1Q6NUS8 523 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 IRGCQ6NXR0 463 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 SYCE2Q6PIF2 218 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 CORO6Q6QEF8 472 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 ARSKQ6UWY0 536 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 SIGLEC15Q6ZMC9 328 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 IL17RELQ6ZVW7 336 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 MCM10Q7L590 875 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 PRUNE1Q86TP1 453 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 TMEM139Q8IV31 216 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 THEM5Q8N1Q8 247 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 TMEM99Q8N816 258 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 NRACQ8N912 160 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 DENND6BQ8NEG7 585 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 OR2T12Q8NG77 320 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 OR1J1Q8NGS3 322 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 OR52N5Q8NH56 324 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 FBXO30Q8TB52 745 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 PHLDA1Q8WV24 401 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 RFT1Q96AA3 541 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 PHF21BQ96EK2 531 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 ADGRG7Q96K78 797 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 RTP3Q9BQQ7 232 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 ACPTQ9BZG2 426 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 TRPV6Q9H1D0 765 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 ZDHHC6Q9H6R6 413 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 TLE6Q9H808 572 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 RPF1Q9H9Y2 349 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 EBF2Q9HAK2 575 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 RAB9BQ9NP90 201 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 KCNMB3Q9NPA1 279 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 SLC35D1Q9NTN3 355 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 EXOC1Q9NV70 894 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 DONSONQ9NYP3 566 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 ANKMY1Q9P2S6 941 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 C11orf21Q9P2W6 132 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 XPO7Q9UIA9 1087 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 KCNS2Q9ULS6 477 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 SYNJ2BP-COX16A0A087WUM0 186 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 MACROD2A1Z1Q3 448 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 CTAGE9A4FU28 777 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 C5orf60A6NFR6 353 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 ANKDD1BA6NHY2 528 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 C4orf47A7E2U8 309 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 ZNF587BE7ETH6 402 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 M0R296 226 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 TULP2O00295 520 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 PPEF2O14830 753 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 ANGPT2O15123 496 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 XPNPEP2O43895 674 aa2.98□□□□□ -1.93
RNU6-1256P-201ENST00000516539 PIGNO95427 931 aa2.98□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 59.3 ms