RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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SH3BP2-218ENST00000511185 HIST1H2AJQ99878 128 aa17.81■□□□□ 0.44
SH3BP2-218ENST00000511185 H2AFJQ9BTM1 129 aa17.81■□□□□ 0.44
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SH3BP2-218ENST00000511185 CDC42EP4Q9H3Q1 356 aaKnown RBP17.78■□□□□ 0.44
SH3BP2-218ENST00000511185 HMX2A2RU54 273 aa17.77■□□□□ 0.44
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SH3BP2-218ENST00000511185 SLC35E2BP0CK96 405 aa17.77■□□□□ 0.44
SH3BP2-218ENST00000511185 STMN1P16949 149 aa17.77■□□□□ 0.44
SH3BP2-218ENST00000511185 IL1RNP18510 177 aa17.77■□□□□ 0.44
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SH3BP2-218ENST00000511185 EMP3P54852 163 aa17.77■□□□□ 0.44
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