RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000508652.5

TMA16-205, Transcript of translation machinery associated 16 homolog, human

TSL 2

Gene TMA16, Length 1,195 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMA16-205	ENST00000508652	CGB2	Q6NT52	195 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	TMEM71	Q6P5X7	295 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	FAM92B	Q6ZTR7	304 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	SPATA21	Q7Z572	469 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	PAQR7	Q86WK9	346 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	LAS2	Q8IYD9	372 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	CARF	Q8N187	725 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	ZNF740	Q8NDX6	193 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	RFWD2	Q8NHY2	731 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	SELENOM	Q8WWX9	145 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	PPM1M	Q96MI6	270 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	MAP3K3	Q99759	626 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	NUF2	Q9BZD4	464 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	KLHL14	Q9P2G3	628 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	APOBEC2	Q9Y235	224 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	BTRC	Q9Y297	605 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	TP53BP1	Q12888	1972 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	ARID1B	Q8NFD5	2236 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652		A0A0G2JND7	137 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	FEZF1	A0PJY2	475 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	OR2A25	A4D2G3	310 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	ANKDD1B	A6NHY2	528 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	SLC9B1P1	A6NJY1	282 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	ZNF195	O14628	629 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	HAT1	O14929	419 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	PIP5K1B	O14986	540 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	GDF9	O60383	454 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	SNX3	O60493	162 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	DIAPH2	O60879	1101 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	VPS4B	O75351	444 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	SKAP2	O75563	359 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	RASSF9	O75901	435 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	CPNE6	O95741	557 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	PDYN	P01213	254 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	C9	P02748	559 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	GP1BA	P07359	652 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	PVR	P15151	417 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	EZR	P15311	586 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	ALOX15	P16050	662 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	MAG	P20916	626 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	SERPINB1	P30740	379 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	PIK3CB	P42338	1070 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	IDH3A	P50213	366 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	NEK2	P51955	445 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	ARFIP2	P53365	341 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	GFER	P55789	205 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	RPS15A	P62244	130 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	NHLH1	Q02575	133 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	CFHR1	Q03591	330 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	ABRAXAS2	Q15018	415 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	TCHHL1	Q5QJ38	904 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	CACHD1	Q5VU97	1274 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	FCRL6	Q6DN72	434 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	FBXO42	Q6P3S6	717 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	EPGN	Q6UW88	154 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	SCIMP	Q6UWF3	145 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	PIGW	Q7Z7B1	504 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	GBP7	Q8N8V2	638 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	TTL	Q8NG68	377 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	BAHD1	Q8TBE0	780 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	WDR20	Q8TBZ3	569 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	BCAS4	Q8TDM0	211 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	USP7	Q93009	1102 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	THAP11	Q96EK4	314 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	C19orf60	Q96EN9	201 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	TCTN2	Q96GX1	697 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	TRAPPC9	Q96Q05	1148 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	KLHL25	Q9H0H3	589 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	RHBG	Q9H310	441 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	MEAF6	Q9HAF1	191 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	FARSB	Q9NSD9	589 aa	Known RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	RIC8B	Q9NVN3	520 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	NMRK1	Q9NWW6	199 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	TSC22D4	Q9Y3Q8	395 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	MUC6	Q6W4X9	2439 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	SERTM1	A2A2V5	107 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	FOXE1	O00358	373 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	NDUFAB1	O14561	156 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	RGS14	O43566	566 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	KIF1C	O43896	1103 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	LCMT2	O60294	686 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	CBFA2T3	O75081	653 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	ZBTB11	O95625	1053 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	ST6GAL1	P15907	406 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	GSTM2	P28161	218 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	AHR	P35869	848 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	SCTR	P47872	440 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	ARL4D	P49703	201 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	HTR6	P50406	440 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	INHBC	P55103	352 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	DDX39B	Q13838	428 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	IMPG1	Q17R60	797 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	VWA5B1	Q5TIE3	1220 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	GKAP1	Q5VSY0	366 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	RNF165	Q6ZSG1	346 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	ACAD11	Q709F0	780 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	ASCL5	Q7RTU5	278 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	MAVS	Q7Z434	540 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	TRIM46	Q7Z4K8	759 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TMA16-205	ENST00000508652	PLD3	Q8IV08	490 aa		13.61	□□□□□ -0.23

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