RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497511.5

SKAP2-209, Transcript of src kinase associated phosphoprotein 2, human

TSL 4

Gene SKAP2, Length 585 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SKAP2-209	ENST00000497511	HIBCH	Q6NVY1	386 aa	Predicted RBP	10.31	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	NAPRT	Q6XQN6	538 aa		10.31	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	MEX3B	Q6ZN04	569 aa	Known RBP	10.31	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	CFAP61	Q8NHU2	1237 aa		10.31	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	ASB11	Q8WXH4	323 aa		10.31	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	IQCD	Q96DY2	449 aa		10.31	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	C14orf79	Q96F83	325 aa		10.31	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	DNAJC1	Q96KC8	554 aa	Known RBP	10.31	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	QKI	Q96PU8	341 aa	Known RBP eCLIP	10.31	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	GBA3	Q9H227	469 aa		10.31	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	MCCC2	Q9HCC0	563 aa		10.31	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	LUC7L	Q9NQ29	371 aa	Known RBP	10.31	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	RIC8B	Q9NVN3	520 aa		10.31	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	CIDEB	Q9UHD4	219 aa		10.31	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	TEKT2	Q9UIF3	430 aa		10.31	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC39A10	Q9ULF5	831 aa		10.31	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	HYOU1	Q9Y4L1	999 aa		10.31	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511		U3KQE9	123 aa		10.31	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	MED13L	Q71F56	2210 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	CCDC88C	Q9P219	2028 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	IGLV3-16	A0A075B6K0	115 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	HYKK	A2RU49	373 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	OR5H15	A6NDH6	313 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	VSTM2B	A6NLU5	285 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	HACD1	B0YJ81	288 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511		F8W8V4	182 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	AKR1B10	O60218	316 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	STK10	O94804	968 aa	Known RBP	10.3	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	ONECUT2	O95948	504 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	RPN2	P04844	631 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	OR56A5	P0C7T3	313 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	PRSS56	P0CW18	603 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	COX6A1	P12074	109 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	CD9	P21926	228 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	ACADL	P28330	430 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	PKLR	P30613	574 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	CDKN2B	P42772	138 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC1A1	P43005	524 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	KIR3DL1	P43629	444 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	ART1	P52961	327 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	CACNG1	Q06432	222 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	SLC18A3	Q16572	532 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF658B	Q4V348	819 aa	Predicted RBP	10.3	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	WASHC2D	Q5SRD0	308 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	PRMT9	Q6P2P2	845 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	FIGLA	Q6QHK4	219 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	RANBP10	Q6VN20	620 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	REC114	Q7Z4M0	266 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	RHOT2	Q8IXI1	618 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	CABS1	Q96KC9	395 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	TBL1Y	Q9BQ87	522 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	BPIFA3	Q9BQP9	254 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	IMPACT	Q9P2X3	320 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	ADGRE2	Q9UHX3	823 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	CAPN11	Q9UMQ6	739 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	UCHL5	Q9Y5K5	329 aa	Known RBP eCLIP	10.3	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511		A8MUI8	341 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	IDS	B3KWA1	339 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	GOLGA6L22	H0YM25	854 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	PRPF4	O43172	522 aa	Known RBP eCLIP	10.29	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	HEXB	P07686	556 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	TPBGL	P0DKB5	382 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	ABO	P16442	354 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	CTNNA2	P26232	953 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	PSMB4	P28070	264 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	RBL1	P28749	1068 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	SPARCL1	Q14515	664 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	DNAJC21	Q5F1R6	531 aa	Known RBP	10.29	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	ZNF766	Q5HY98	468 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	ATG9B	Q674R7	924 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	TTC23L	Q6PF05	361 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	NEK10	Q6ZWH5	1172 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	MFSD4A	Q8N468	514 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	RAB42	Q8N4Z0	105 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	LMNTD1	Q8N9Z9	388 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	CA5BP1	Q8WTZ4	195 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	PSMF1	Q92530	271 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	IL17F	Q96PD4	163 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	TTC1	Q99614	292 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	C10orf88	Q9H8K7	445 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	STMN3	Q9NZ72	180 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	TRPC4	Q9UBN4	977 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	CDC14A	Q9UNH5	594 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	CORIN	Q9Y5Q5	1042 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	PCM1	Q15154	2024 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	PCNX1	Q96RV3	2341 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	DOCK10	Q96BY6	2186 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	TRBV5-4	A0A0C4DH59	114 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511		A0A0J9YVX5	310 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	RASGRF2	O14827	1237 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	TTI1	O43156	1089 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	SRPX2	O60687	465 aa	Predicted RBP	10.28	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	CELA2A	P08217	269 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	ANXA5	P08758	320 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	ITGAM	P11215	1152 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	ICAM2	P13598	275 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	CD99	P14209	185 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	COMT	P21964	271 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	VAMP1	P23763	118 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SKAP2-209	ENST00000497511	ADRA1A	P35348	466 aa		10.28	□□□□□ -0.76

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