RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483938.1

LPP-215, Transcript of LIM domain containing preferred translocation partner in lipoma, humanhuman

TSL 3

Gene LPP, Length 368 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPP-215ENST00000483938 ZMYND12Q9H0C1 365 aa3.07□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP3.07□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 RAB9BQ9NP90 201 aa3.07□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP3.07□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 CSAG2Q9Y5P2 127 aa3.07□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 POMT1Q9Y6A1 747 aa3.07□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 HTR3EA5X5Y0 456 aa3.06□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 C17orf105B2RV13 164 aa3.06□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 SNX3O60493 162 aa3.06□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 SELENOFO60613 162 aa3.06□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 GLRA3O75311 464 aa3.06□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 MOCS3O95396 460 aa3.06□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 ATP1B1P05026 303 aa3.06□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 LHCGRP22888 699 aa3.06□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 CAPZA1P52907 286 aa3.06□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 MFAP3P55082 362 aa3.06□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 CSNK2BP67870 215 aa3.06□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 KLC1Q07866 573 aa3.06□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 TEAD2Q15562 447 aa3.06□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 UGCGQ16739 394 aa3.06□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa3.06□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 PDLIM3Q53GG5 364 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 C20orf194Q5TEA3 1177 aa3.06□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 LYSMD4Q5XG99 296 aa3.06□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 OR4C11Q6IEV9 310 aa3.06□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 CYB5D1Q6P9G0 228 aa3.06□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP3.06□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 ENPP7Q6UWV6 458 aa3.06□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 NHLRC1Q6VVB1 395 aa3.06□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 LEKR1Q6ZMV7 388 aa3.06□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 Q6ZRP5 223 aa3.06□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 NRARPQ7Z6K4 114 aa3.06□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 METTL23Q86XA0 190 aa3.06□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 MARVELD2Q8N4S9 558 aa3.06□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 TMEM178AQ8NBL3 297 aa3.06□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP3.06□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 AZIN2Q96A70 460 aa3.06□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 FAM218AQ96MZ4 157 aa3.06□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 AGAP3Q96P47 875 aa3.06□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 PRRG4Q9BZD6 226 aa3.06□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 PCNX3Q9H6A9 2034 aa3.06□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 MAN2C1Q9NTJ4 1040 aa3.06□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 MRGBPQ9NV56 204 aa3.06□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 TXNDC16Q9P2K2 825 aa3.06□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 EPHA6Q9UF33 1036 aa3.06□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 GRID1Q9ULK0 1009 aa3.06□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 ANGPTL3Q9Y5C1 460 aa3.06□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 R4GN57 208 aa3.06□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 A0A1W2PR80 420 aa3.05□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 SNURFLB1AK76 121 aa3.05□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 ZNF195O14628 629 aa3.05□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 KLF11O14901 512 aa3.05□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 SLC7A4O43246 635 aa3.05□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 CDK2AP2O75956 126 aa3.05□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 SEC24AO95486 1093 aa3.05□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa3.05□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 F3P13726 295 aa3.05□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 PSMA3P25788 255 aa3.05□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 SHC1P29353 583 aa3.05□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 KRTAP12-2P59991 146 aa3.05□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 BFSP1Q12934 665 aa3.05□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 RIGQ13278 110 aa3.05□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 HECTD3Q5T447 861 aa3.05□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 LCE3AQ5TA76 89 aa3.05□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 SHEQ5VZ18 495 aa3.05□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 NOTUMQ6P988 496 aa3.05□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 MOXD1Q6UVY6 613 aa3.05□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 FAM9BQ8IZU0 186 aa3.05□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 NDUFAF2Q8N183 169 aa3.05□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 OR13C3Q8NGS6 347 aa3.05□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 SAP25Q8TEE9 199 aa3.05□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 GATAD1Q8WUU5 269 aa3.05□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 DEPDC1BQ8WUY9 529 aa3.05□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 SEPT1Q8WYJ6 367 aa3.05□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 PIK3R3Q92569 461 aa3.05□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 EXOC4Q96A65 974 aa3.05□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 PYCR2Q96C36 320 aa3.05□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 SPATA17Q96L03 361 aa3.05□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 SPAG5Q96R06 1193 aa3.05□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 ADPGKQ9BRR6 497 aa3.05□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 INPP5KQ9BT40 448 aa3.05□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 ACTL8Q9H568 366 aa3.05□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP3.05□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 OR6C2Q9NZP2 312 aa3.05□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 SNX7Q9UNH6 387 aa3.05□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 KLK4Q9Y5K2 254 aa3.05□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 ARHGEF37A1IGU5 675 aa3.04□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 GLTPD2A6NH11 291 aa3.04□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 PRSS46E5RG02 174 aa3.04□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 F8VVB4 439 aa3.04□□□□□ -1.92
LPP-215ENST00000483938 F8VWA3 439 aa3.04□□□□□ -1.92
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