RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460160.5

HOXB3-202, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,525 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-202ENST00000460160 PLTPP55058 493 aa22.53■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 KCNC4Q03721 635 aa22.53■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 TRADDQ15628 312 aa22.53■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 LCTLQ6UWM7 567 aa22.53■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 VN1R4Q7Z5H5 301 aa22.53■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 OR56A3Q8NH54 315 aa22.53■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 STT3BQ8TCJ2 826 aa22.53■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 VPS39Q96JC1 886 aa22.53■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 TRIM54Q9BYV2 358 aa22.53■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF282Q9UDV7 671 aaPredicted RBP22.53■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 CDC14AQ9UNH5 594 aa22.53■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa22.52■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa22.52■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 TXNDC9O14530 226 aa22.52■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 STATHP02808 62 aa22.52■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
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HOXB3-202ENST00000460160 NPPBP16860 134 aa22.52■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 OCA2Q04671 838 aa22.52■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 KLC1Q07866 573 aa22.52■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 DSG2Q14126 1118 aa22.52■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 PPP1R3AQ16821 1122 aa22.52■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 KIRREL2Q6UWL6 708 aa22.52■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 CEP97Q8IW35 865 aa22.52■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 GALNT16Q8N428 558 aa22.52■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 FBXO25Q8TCJ0 367 aa22.52■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 PYCR2Q96C36 320 aa22.52■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 FBXL8Q96CD0 374 aa22.52■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 RAB17Q9H0T7 212 aa22.52■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 CLMPQ9H6B4 373 aa22.52■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 FBXL4Q9UKA2 621 aa22.52■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.2
HOXB3-202ENST00000460160 TCRBV9S1A1TA0A576 114 aa22.52■■□□□ 1.19
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HOXB3-202ENST00000460160 FOXS1O43638 330 aa22.52■■□□□ 1.19
HOXB3-202ENST00000460160 GUCA1CO95843 209 aa22.52■■□□□ 1.19
HOXB3-202ENST00000460160 CDH1P12830 882 aa22.52■■□□□ 1.19
HOXB3-202ENST00000460160 ZDHHC24Q6UX98 284 aa22.52■■□□□ 1.19
HOXB3-202ENST00000460160 PRSS58Q8IYP2 241 aa22.52■■□□□ 1.19
HOXB3-202ENST00000460160 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.19
HOXB3-202ENST00000460160 AMER3Q8N944 861 aa22.52■■□□□ 1.19
HOXB3-202ENST00000460160 C16orf45Q96MC5 204 aaPredicted RBP22.52■■□□□ 1.19
HOXB3-202ENST00000460160 OR4K3Q96R72 315 aa22.52■■□□□ 1.19
HOXB3-202ENST00000460160 PHACTR1Q9C0D0 580 aa22.52■■□□□ 1.19
HOXB3-202ENST00000460160 DRC3Q9H069 523 aa22.52■■□□□ 1.19
HOXB3-202ENST00000460160 SEMA3GQ9NS98 782 aa22.52■■□□□ 1.19
HOXB3-202ENST00000460160 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP22.52■■□□□ 1.19
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HOXB3-202ENST00000460160 C1QAP02745 245 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXB3-202ENST00000460160 SLC26A3P40879 764 aa22.51■■□□□ 1.19
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HOXB3-202ENST00000460160 CAV1Q03135 178 aa22.51■■□□□ 1.19
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HOXB3-202ENST00000460160 CYS1Q717R9 158 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXB3-202ENST00000460160 ANKRD49Q8WVL7 239 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXB3-202ENST00000460160 ATL1Q8WXF7 558 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXB3-202ENST00000460160 ANKRD7Q92527 254 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXB3-202ENST00000460160 MIEF2Q96C03 454 aa22.51■■□□□ 1.19
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HOXB3-202ENST00000460160 HAUS8Q9BT25 410 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXB3-202ENST00000460160 CRB3Q9BUF7 120 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXB3-202ENST00000460160 TRPC4Q9UBN4 977 aa22.51■■□□□ 1.19
HOXB3-202ENST00000460160 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP22.51■■□□□ 1.19
HOXB3-202ENST00000460160 SHANK1Q9Y566 2161 aa22.5■■□□□ 1.19
HOXB3-202ENST00000460160 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
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HOXB3-202ENST00000460160 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa22.5■■□□□ 1.19
HOXB3-202ENST00000460160 I3L1I5 382 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
HOXB3-202ENST00000460160 FFAR3O14843 346 aa22.5■■□□□ 1.19
HOXB3-202ENST00000460160 GPR42O15529 346 aa22.5■■□□□ 1.19
HOXB3-202ENST00000460160 BCL6P41182 706 aa22.5■■□□□ 1.19
HOXB3-202ENST00000460160 FOXK1P85037 733 aa22.5■■□□□ 1.19
HOXB3-202ENST00000460160 FAM53BQ14153 422 aa22.5■■□□□ 1.19
HOXB3-202ENST00000460160 IGFBP7Q16270 282 aa22.5■■□□□ 1.19
HOXB3-202ENST00000460160 RBBP7Q16576 425 aa22.5■■□□□ 1.19
HOXB3-202ENST00000460160 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa22.5■■□□□ 1.19
HOXB3-202ENST00000460160 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa22.5■■□□□ 1.19
HOXB3-202ENST00000460160 ABHD11Q8NFV4 315 aa22.5■■□□□ 1.19
HOXB3-202ENST00000460160 THAP11Q96EK4 314 aa22.5■■□□□ 1.19
HOXB3-202ENST00000460160 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP22.5■■□□□ 1.19
HOXB3-202ENST00000460160 POPDC3Q9HBV1 291 aa22.5■■□□□ 1.19
HOXB3-202ENST00000460160 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa22.5■■□□□ 1.19
HOXB3-202ENST00000460160 FAM159BA6NKW6 160 aa22.49■■□□□ 1.19
HOXB3-202ENST00000460160 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP22.49■■□□□ 1.19
HOXB3-202ENST00000460160 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
HOXB3-202ENST00000460160 ALOX12BO75342 701 aa22.49■■□□□ 1.19
HOXB3-202ENST00000460160 GSTA2P09210 222 aa22.49■■□□□ 1.19
HOXB3-202ENST00000460160 MLLT10P55197 1068 aa22.49■■□□□ 1.19
HOXB3-202ENST00000460160 POU4F1Q01851 419 aa22.49■■□□□ 1.19
HOXB3-202ENST00000460160 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
HOXB3-202ENST00000460160 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP22.49■■□□□ 1.19
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