RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455609.1

C9orf41-AS1-201, C9orf41 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf41-AS1, Length 719 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NPEPPSL1A6NEC2 478 aa14.81□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TXNDC9O14530 226 aa14.81□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SOCS6O14544 535 aa14.81□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FOXS1O43638 330 aa14.81□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GUCA1CO95843 209 aa14.81□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CDH1P12830 882 aa14.81□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KCNC4Q03721 635 aa14.81□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 OCA2Q04671 838 aa14.81□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KLC1Q07866 573 aa14.81□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DSG2Q14126 1118 aa14.81□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TRADDQ15628 312 aa14.81□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PPP1R3AQ16821 1122 aa14.81□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 VN1R4Q7Z5H5 301 aa14.81□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GALNT16Q8N428 558 aa14.81□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NKAPQ8N5F7 415 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 OR56A3Q8NH54 315 aa14.81□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FBXO25Q8TCJ0 367 aa14.81□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NACC2Q96BF6 587 aa14.81□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MIEF2Q96C03 454 aa14.81□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FBXL8Q96CD0 374 aa14.81□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CRB3Q9BUF7 120 aa14.81□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DRC3Q9H069 523 aa14.81□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CLMPQ9H6B4 373 aa14.81□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SEMA3GQ9NS98 782 aa14.81□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FBXL4Q9UKA2 621 aa14.81□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa14.81□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa14.8□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KCNE1BA0A087WTH5 132 aa14.8□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 A0A0A6YYC8 382 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FEZF1A0PJY2 475 aa14.8□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 I3L1I5 382 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CDC7O00311 574 aa14.8□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FFAR3O14843 346 aa14.8□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GPR42O15529 346 aa14.8□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP14.8□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ALOX12BO75342 701 aa14.8□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZGLP1P0C6A0 271 aa14.8□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NPPBP16860 134 aa14.8□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 BCL6P41182 706 aa14.8□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GPX6P59796 221 aa14.8□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CAV1Q03135 178 aa14.8□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RBBP7Q16576 425 aa14.8□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NADK2Q4G0N4 442 aa14.8□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 VWA2Q5GFL6 755 aa14.8□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KIRREL2Q6UWL6 708 aa14.8□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZDHHC24Q6UX98 284 aa14.8□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 C3orf62Q6ZUJ4 267 aa14.8□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CCDC25Q86WR0 208 aa14.8□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CEP97Q8IW35 865 aa14.8□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 AMER3Q8N944 861 aa14.8□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ANKRD49Q8WVL7 239 aa14.8□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ATL1Q8WXF7 558 aa14.8□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CDKL2Q92772 493 aa14.8□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MMABQ96EY8 250 aaPredicted RBP14.8□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 OR4K3Q96R72 315 aa14.8□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MESP1Q9BRJ9 268 aa14.8□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HAUS8Q9BT25 410 aa14.8□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 YIPF2Q9BWQ6 316 aa14.8□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PHACTR1Q9C0D0 580 aa14.8□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TRPC4Q9UBN4 977 aa14.8□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP14.8□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LCMT2O60294 686 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 C1QAP02745 245 aa14.79□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ANXA5P08758 320 aa14.79□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SLC26A3P40879 764 aa14.79□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MLLT10P55197 1068 aa14.79□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SLC7A5Q01650 507 aa14.79□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FAM53BQ14153 422 aa14.79□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MYBPC3Q14896 1274 aa14.79□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 IGFBP7Q16270 282 aa14.79□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NDUFA9Q16795 377 aa14.79□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa14.79□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LAPTM4BQ86VI4 370 aa14.79□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ANKRD7Q92527 254 aa14.79□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 THAP11Q96EK4 314 aa14.79□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CPNE1Q99829 537 aa14.79□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MACROD1Q9BQ69 325 aa14.79□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CAB39LQ9H9S4 337 aa14.79□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 POPDC3Q9HBV1 291 aa14.79□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GPAMQ9HCL2 828 aa14.79□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ATP13A2Q9NQ11 1180 aa14.79□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TXNDC16Q9P2K2 825 aa14.79□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 C3orf18Q9UK00 162 aa14.79□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP14.79□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MYO18BQ8IUG5 2567 aa14.79□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ESYT3A0FGR9 886 aa14.78□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FAM159BA6NKW6 160 aa14.78□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DPM1O60762 260 aa14.78□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 URI1O94763 535 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GSTA2P09210 222 aa14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 158.3 ms