RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
PRAME-210ENST00000442481 ZNF800Q2TB10 664 aaPredicted RBP eCLIP11.16□□□□□ -0.622e-8■□□□□ 10
PRAME-210ENST00000442481 KLHL38Q2WGJ6 581 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-210ENST00000442481 DEFB110Q30KQ9 67 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-210ENST00000442481 TCTE1Q5JU00 501 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-210ENST00000442481 ISLR2Q6UXK2 745 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-210ENST00000442481 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP11.16□□□□□ -0.62
PRAME-210ENST00000442481 RELL1Q8IUW5 271 aa11.16□□□□□ -0.62
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PRAME-210ENST00000442481 GPATCH11Q8N954 259 aa11.16□□□□□ -0.62
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PRAME-210ENST00000442481 SLX1AQ9BQ83 275 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-210ENST00000442481 SLC6A20Q9NP91 592 aa11.16□□□□□ -0.62
PRAME-210ENST00000442481 SEMA3GQ9NS98 782 aa11.16□□□□□ -0.62
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PRAME-210ENST00000442481 C1orf105O95561 183 aa11.15□□□□□ -0.62
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PRAME-210ENST00000442481 TPBGLP0DKB5 382 aa11.15□□□□□ -0.62
PRAME-210ENST00000442481 FDXRP22570 491 aa11.15□□□□□ -0.62
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PRAME-210ENST00000442481 RAB28P51157 221 aa11.15□□□□□ -0.62
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PRAME-210ENST00000442481 GRM7Q14831 915 aa11.15□□□□□ -0.62
PRAME-210ENST00000442481 SLC9A5Q14940 896 aa11.15□□□□□ -0.62
PRAME-210ENST00000442481 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
PRAME-210ENST00000442481 RBBP7Q16576 425 aa11.15□□□□□ -0.62
PRAME-210ENST00000442481 CCSMST1Q4G0I0 132 aa11.15□□□□□ -0.62
PRAME-210ENST00000442481 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
PRAME-210ENST00000442481 ZNF549Q6P9A3 640 aa11.15□□□□□ -0.62
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PRAME-210ENST00000442481 OVCH1Q7RTY7 1134 aa11.15□□□□□ -0.62
PRAME-210ENST00000442481 FJX1Q86VR8 437 aa11.15□□□□□ -0.62
PRAME-210ENST00000442481 FAM20CQ8IXL6 584 aa11.15□□□□□ -0.62
PRAME-210ENST00000442481 PARP9Q8IXQ6 854 aa11.15□□□□□ -0.62
PRAME-210ENST00000442481 CPNE9Q8IYJ1 553 aa11.15□□□□□ -0.62
PRAME-210ENST00000442481 TTC29Q8NA56 475 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
PRAME-210ENST00000442481 C2CD4AQ8NCU7 369 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
PRAME-210ENST00000442481 GIMAP7Q8NHV1 300 aa11.15□□□□□ -0.62
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PRAME-210ENST00000442481 KCNJ9Q92806 393 aa11.15□□□□□ -0.62
PRAME-210ENST00000442481 RAD51AP1Q96B01 352 aa11.15□□□□□ -0.62
PRAME-210ENST00000442481 OR2A14Q96R47 310 aa11.15□□□□□ -0.62
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PRAME-210ENST00000442481 FAM60AQ9NP50 221 aa11.15□□□□□ -0.62
PRAME-210ENST00000442481 ABCF3Q9NUQ8 709 aa11.15□□□□□ -0.62
PRAME-210ENST00000442481 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
PRAME-210ENST00000442481 ZFATQ9P243 1243 aa11.15□□□□□ -0.62
PRAME-210ENST00000442481 KLHL20Q9Y2M5 609 aa11.15□□□□□ -0.62
PRAME-210ENST00000442481 COMMD10Q9Y6G5 202 aa11.15□□□□□ -0.62
PRAME-210ENST00000442481 ZGRF1Q86YA3 2104 aa11.15□□□□□ -0.62
PRAME-210ENST00000442481 FER1L5A0AVI2 2057 aa11.15□□□□□ -0.63
PRAME-210ENST00000442481 F8P00451 2351 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-210ENST00000442481 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
PRAME-210ENST00000442481 H3BMH7 237 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-210ENST00000442481 RASGRF2O14827 1237 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-210ENST00000442481 JRKO75564 520 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-210ENST00000442481 FKBP9O95302 570 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-210ENST00000442481 ONECUT2O95948 504 aa11.14□□□□□ -0.63
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PRAME-210ENST00000442481 SAT1P21673 171 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-210ENST00000442481 CD9P21926 228 aa11.14□□□□□ -0.63
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PRAME-210ENST00000442481 ARG2P78540 354 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-210ENST00000442481 RBPJQ06330 500 aa11.14□□□□□ -0.63
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PRAME-210ENST00000442481 CASP8Q14790 479 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-210ENST00000442481 SF1Q15637 639 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
PRAME-210ENST00000442481 FAM214AQ32MH5 1076 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-210ENST00000442481 RBM20Q5T481 1227 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
PRAME-210ENST00000442481 RPTNQ6XPR3 784 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-210ENST00000442481 TTLL10Q6ZVT0 673 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-210ENST00000442481 DNAJC22Q8N4W6 341 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-210ENST00000442481 CD200R1Q8TD46 325 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-210ENST00000442481 RELTQ969Z4 430 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-210ENST00000442481 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
PRAME-210ENST00000442481 RAB11FIP5Q9BXF6 653 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-210ENST00000442481 EPB41L4BQ9H329 900 aa11.14□□□□□ -0.63
PRAME-210ENST00000442481 ZBTB20Q9HC78 741 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
PRAME-210ENST00000442481 EURLQ9NYK6 297 aa11.14□□□□□ -0.63
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