RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000440835.6

PTPRR-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRR, Length 2,818 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-204ENST00000440835 PAK5Q9P286 719 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRR-204ENST00000440835 SLC24A2Q9UI40 661 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRR-204ENST00000440835 TCFL5Q9UL49 500 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRR-204ENST00000440835 SHOC2Q9UQ13 582 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRR-204ENST00000440835 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
PTPRR-204ENST00000440835 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRR-204ENST00000440835 NAV2Q8IVL1 2488 aa5.81□□□□□ -1.48
PTPRR-204ENST00000440835 HECTD1Q9ULT8 2610 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRR-204ENST00000440835 KCNK1O00180 336 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRR-204ENST00000440835 MEN1O00255 615 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRR-204ENST00000440835 PCDH17O14917 1159 aa5.8□□□□□ -1.48
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PTPRR-204ENST00000440835 FURINP09958 794 aa5.8□□□□□ -1.48
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PTPRR-204ENST00000440835 C6orf183Q5T699 404 aa5.8□□□□□ -1.48
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PTPRR-204ENST00000440835 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa5.8□□□□□ -1.48
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PTPRR-204ENST00000440835 INAQ16352 499 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRR-204ENST00000440835 LRRC36Q1X8D7 754 aa5.8□□□□□ -1.48
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PTPRR-204ENST00000440835 RNF111Q6ZNA4 994 aa5.8□□□□□ -1.48
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PTPRR-204ENST00000440835 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa5.8□□□□□ -1.48
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PTPRR-204ENST00000440835 PCDHGB4Q9UN71 923 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRR-204ENST00000440835 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRR-204ENST00000440835 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRR-204ENST00000440835 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
PTPRR-204ENST00000440835 SH3PXD2BA1X283 911 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRR-204ENST00000440835 CCDC160A6NGH7 325 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRR-204ENST00000440835 OR52A4PA6NMU1 304 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRR-204ENST00000440835 E7EQ34 232 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRR-204ENST00000440835 AGRPO00253 132 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRR-204ENST00000440835 PEX12O00623 359 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRR-204ENST00000440835 PSMD3O43242 534 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRR-204ENST00000440835 SPAG7O75391 227 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRR-204ENST00000440835 BAG2O95816 211 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRR-204ENST00000440835 GNLYP22749 145 aa5.8□□□□□ -1.48
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