RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425660.5

ACTB-204, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene ACTB, Length 1,845 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-204ENST00000425660 NT5DC2Q9H857 520 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 ZNF624Q9P2J8 865 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 L3MBTL1Q9Y468 752 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 PCDHB11Q9Y5F2 797 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 PCDHA9Q9Y5H5 950 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 TNFP01375 233 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 THEGLP0DJG4 465 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 PRPS1L1P21108 318 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 PSMB5P28074 263 aa14.62□□□□□ -0.07
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ACTB-204ENST00000425660 DGKQP52824 942 aa14.62□□□□□ -0.07
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ACTB-204ENST00000425660 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
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ACTB-204ENST00000425660 FZD2Q14332 565 aa14.62□□□□□ -0.07
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ACTB-204ENST00000425660 SPANXN4Q5MJ08 99 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 ICE2Q659A1 982 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 SLC30A9Q6PML9 568 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 SLC2A7Q6PXP3 512 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 VN1R5Q7Z5H4 357 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 KIAA2013Q8IYS2 634 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 NUDT8Q8WV74 236 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 TSSK3Q96PN8 268 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 AIF1LQ9BQI0 150 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 OR6C2Q9NZP2 312 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 SLAMF8Q9P0V8 285 aa14.62□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 LRP4O75096 1905 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 METTL12A8MUP2 240 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 H0Y3Z8 333 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 NME4O00746 187 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 HSD17B1P14061 328 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 CD27P26842 260 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 SERPINB1P30740 379 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 PHEXP78562 749 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 REEP5Q00765 189 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 TRAP1Q12931 704 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 MTAPQ13126 283 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 FLOT2Q14254 428 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 PCM1Q15154 2024 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 DPY19L1Q2PZI1 675 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 ARPINQ7Z6K5 226 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 C1orf52Q8N6N3 182 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 CLHC1Q8NHS4 586 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 GTF2H4Q92759 462 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 TMEM125Q96AQ2 219 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 EGLN2Q96KS0 407 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 XKR8Q9H6D3 395 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 IL1RL2Q9HB29 575 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 CMTM6Q9NX76 183 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 BCAP29Q9UHQ4 241 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa14.61□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 MYO1DO94832 1006 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 SHMT2P34897 504 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 SLC19A1P41440 591 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 ABATP80404 500 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 MAPKAPK3Q16644 382 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 ARMCX6Q7L4S7 300 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 DHDDSQ86SQ9 333 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 DCP2Q8IU60 420 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 PHACTR4Q8IZ21 702 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 ANKRD53Q8N9V6 530 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 DNAJB8Q8NHS0 232 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 ZFPM2Q8WW38 1151 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 THEGQ9P2T0 379 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 KLF15Q9UIH9 416 aa14.6□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 H7BY64 318 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 TBX6O95947 436 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.074e-28■■■□□ 16.6
ACTB-204ENST00000425660 MSX2P35548 267 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 GCKP35557 465 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 ASMTP46597 345 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 AP2B1P63010 937 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 PHC1P78364 1004 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 CSNK1G2P78368 415 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 PWP1Q13610 501 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 CCDC6Q16204 474 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 C6orf10Q5SRN2 563 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 NANOGP8Q6NSW7 305 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 IYDQ6PHW0 289 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 PARGQ86W56 976 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 AMIGO1Q86WK6 493 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 SYT12Q8IV01 421 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.072e-7■■□□□ 14.5
ACTB-204ENST00000425660 METTL4Q8N3J2 472 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 FAM156AQ8NDB6 213 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.071e-323■■□□□ 12.2
ACTB-204ENST00000425660 STARD8Q92502 1023 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 KLHDC7BQ96G42 594 aa14.59□□□□□ -0.07
ACTB-204ENST00000425660 SLC6A18Q96N87 628 aa14.59□□□□□ -0.07
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