RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000424082.6

RALGPS1-208, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RALGPS1, Length 2,362 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-208ENST00000424082 DNMT3LQ9UJW3 386 aa17.76■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa17.76■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 SCN5AQ14524 2016 aa17.76■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 PDZK1P1A8MUH7 402 aa17.75■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 WDR47O94967 919 aa17.75■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 MFN2O95140 757 aa17.75■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 DNTTP04053 509 aa17.75■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 SEMG1P04279 462 aa17.75■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 DGKAP23743 735 aa17.75■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 HTR3AP46098 478 aa17.75■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 CLDN8P56748 225 aa17.75■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 FAHD1Q6P587 224 aa17.75■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 CERS6Q6ZMG9 384 aa17.75■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 UBQLNLQ8IYU4 475 aa17.75■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 CEP295NLQ96MC4 621 aa17.75■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 DEFB118Q96PH6 123 aa17.75■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 CEP44Q9C0F1 390 aa17.75■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 RNF38Q9H0F5 515 aa17.75■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 OR51E2Q9H255 320 aa17.75■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 MKLN1Q9UL63 735 aa17.75■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 SNX6Q9UNH7 406 aa17.75■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 FCF1Q9Y324 198 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa17.75■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa17.75■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 RFXANKO14593 260 aa17.75■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 ATF6P18850 670 aa17.75■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 EPORP19235 508 aa17.75■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 P3H2Q8IVL5 708 aa17.75■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP17.75■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa17.75■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 SYN3O14994 580 aa17.74■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 STK16O75716 305 aa17.74■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 CLDN9O95484 217 aa17.74■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 VIPP01282 170 aa17.74■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 ETV6P41212 452 aa17.74■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC11A1P49279 550 aa17.74■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 CCL23P55773 120 aa17.74■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 NFATC2Q13469 925 aa17.74■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 OR4F3Q6IEY1 312 aa17.74■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 CXorf57Q6NSI4 855 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 RBFAQ8N0V3 343 aa17.74■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 ZBTB2Q8N680 514 aa17.74■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 MYDGFQ969H8 173 aa17.74■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 Q96MT0 163 aa17.74■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 SDHCQ99643 169 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 DDX28Q9NUL7 540 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 MARCH5Q9NX47 278 aa17.74■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 LHX3Q9UBR4 397 aa17.74■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 WBP11Q9Y2W2 641 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 NOTOA8MTQ0 251 aa17.74■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 TNFRSF10AO00220 468 aa17.74■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 SDC1P18827 310 aa17.74■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 CORO1AP31146 461 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 UGT2B15P54855 530 aa17.74■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 CAMK2GQ13555 558 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 TMC5Q6UXY8 1006 aa17.74■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 RNF165Q6ZSG1 346 aa17.74■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa17.74■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 ZNF675Q8TD23 568 aa17.74■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 SELENOMQ8WWX9 145 aa17.74■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 HRASLS5Q96KN8 279 aa17.74■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 SPATA17Q96L03 361 aa17.74■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 CENPOQ9BU64 300 aa17.74■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 A0A1B0GVM2 712 aa17.73■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 SLC38A8A6NNN8 435 aa17.73■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 TLL1O43897 1013 aa17.73■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 FZD6O60353 706 aa17.73■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 FKBP9O95302 570 aa17.73■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 KRT6AP02538 564 aa17.73■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 KRT6BP04259 564 aa17.73■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 CDK1P06493 297 aa17.73■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 IRF1P10914 325 aa17.73■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 KRT6CP48668 564 aa17.73■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 LIMK1P53667 647 aa17.73■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 ARPC4P59998 168 aa17.73■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 RACK1P63244 317 aaKnown RBP17.73■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 TTLL9Q3SXZ7 439 aa17.73■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 SPANXN2Q5MJ10 180 aa17.73■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 GPRC6AQ5T6X5 926 aa17.73■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 GATAD2AQ86YP4 633 aa17.73■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 OR7G1Q8NGA0 311 aa17.73■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 ELMO1Q92556 727 aa17.73■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 GGHQ92820 318 aa17.73■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 TM6SF2Q9BZW4 377 aa17.73■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 REEP1Q9H902 201 aa17.73■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 IL26Q9NPH9 171 aa17.73■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa17.73■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 PCDH10Q9P2E7 1040 aa17.73■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa17.73■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
RALGPS1-208ENST00000424082 OR6C75A6NL08 312 aa17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.9 ms