RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418161.1

CCDC13-AS1-201, CCDC13 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CCDC13-AS1, Length 2,049 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 ADCK2Q7Z695 626 aa9.39□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 TMPRSS11BQ86T26 416 aa9.39□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 SLC22A9Q8IVM8 553 aa9.39□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 PPP4R1Q8TF05 950 aa9.39□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 NEIL2Q969S2 332 aa9.39□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 DPH7Q9BTV6 452 aa9.39□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 DNAJC11Q9NVH1 559 aa9.39□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 TAGLN3Q9UI15 199 aa9.39□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 MID2Q9UJV3 735 aa9.39□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 PCDHGA1Q9Y5H4 931 aa9.39□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 TNPO3Q9Y5L0 923 aaKnown RBP9.39□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 KCNE2Q9Y6J6 123 aa9.39□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 IGKV1-8A0A0C4DH67 115 aa9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 TLCD2A6NGC4 264 aa9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 SLC9B1P1A6NJY1 282 aa9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 B2RBV5 119 aa9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 E7EQ34 232 aa9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 H7BY64 318 aa9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 K7EPI3 171 aa9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 STX16O14662 325 aa9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 RPSAP08865 295 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 CDH1P12830 882 aa9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 GRIA3P42263 894 aa9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 IDH3AP50213 366 aa9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 PDX1P52945 283 aa9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 NFKB2Q00653 900 aa9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 E2F1Q01094 437 aa9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 MEF2AQ02078 507 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 PRDX1Q06830 199 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 CDC16Q13042 620 aa9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 UBAP2LQ14157 1087 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 TBCCQ15814 346 aa9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 ZNF678Q5SXM1 525 aa9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 CATSPEREQ5SY80 951 aa9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 HES3Q5TGS1 186 aa9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 LIPMQ5VYY2 423 aa9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 RBM44Q6ZP01 1051 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 C17orf64Q86WR6 236 aa9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 MYLK4Q86YV6 388 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 OR4D9Q8NGE8 314 aa9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 UBTD2Q8WUN7 234 aa9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 WDR60Q8WVS4 1066 aa9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 CCDC126Q96EE4 140 aa9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 CCDC74BQ96LY2 380 aa9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 PRAP1Q96NZ9 151 aa9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 RTKNQ9BST9 563 aa9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 RAB33BQ9H082 229 aa9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 SLC6A20Q9NP91 592 aa9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 SOHLH2Q9NX45 425 aa9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 EPHA6Q9UF33 1036 aa9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 PCTPQ9UKL6 214 aa9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 DYRK1BQ9Y463 629 aa9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 A0A0J9YY10 115 aa9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 FAM149AA5PLN7 773 aa9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 PPP6CO00743 305 aa9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 TRIM13O60858 407 aa9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 C9P02748 559 aa9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 RPS17P08708 135 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 THRAP10827 490 aa9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 EPB42P16452 691 aa9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 EPORP19235 508 aa9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 IMPDH1P20839 514 aa9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 CMPK1P30085 196 aa9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 PGM1P36871 562 aa9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 CCR10P46092 362 aa9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 SQSTM1Q13501 440 aa9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 GTF2H2Q13888 395 aa9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 KCNAB1Q14722 419 aa9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 UNC50Q53HI1 259 aa9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 CFAP157Q5JU67 520 aa9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 FAM219BQ5XKK7 198 aa9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 LCTLQ6UWM7 567 aa9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 PLD3Q8IV08 490 aa9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 SLITRK4Q8IW52 837 aa9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 OR52B6Q8NGF0 335 aa9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 TRPC4APQ8TEL6 797 aa9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 SLC5A11Q8WWX8 675 aa9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 RILPQ96NA2 401 aa9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 CDK15Q96Q40 435 aa9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 HAUS8Q9BT25 410 aa9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 PCBD2Q9H0N5 130 aa9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 DCLRE1BQ9H816 532 aa9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 YY1AP1Q9H869 796 aa9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 NOL11Q9H8H0 719 aaKnown RBP9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 IPPKQ9H8X2 491 aa9.38□□□□□ -0.91
CCDC13-AS1-201ENST00000418161 ZBTB26Q9HCK0 441 aa9.38□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.9 ms