RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 SLC22A9Q8IVM8 553 aa6.4□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 C10orf107Q8IVU9 208 aa6.4□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 CEP97Q8IW35 865 aa6.4□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 ULK2Q8IYT8 1036 aa6.4□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 ACVR1CQ8NER5 493 aa6.4□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 KCTD4Q8WVF5 259 aa6.4□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 HMGB4Q8WW32 186 aa6.4□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 PIH1D2Q8WWB5 315 aa6.4□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 SKA1Q96BD8 255 aa6.4□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 ERP27Q96DN0 273 aa6.4□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 UBXN10Q96LJ8 280 aa6.4□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 NSMCE3Q96MG7 304 aa6.4□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 GPHA2Q96T91 129 aa6.4□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 NDNQ99608 321 aa6.4□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 TTC1Q99614 292 aa6.4□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 OLFM1Q99784 485 aa6.4□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 GPR63Q9BZJ6 419 aa6.4□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 SYTL2Q9HCH5 934 aa6.4□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 CD93Q9NPY3 652 aa6.4□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 ABCF3Q9NUQ8 709 aa6.4□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 OXSMQ9NWU1 459 aa6.4□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 PLK2Q9NYY3 685 aa6.4□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 IL17CQ9P0M4 197 aa6.4□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 HAO1Q9UJM8 370 aa6.4□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 APPL1Q9UKG1 709 aa6.4□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 CLEC4EQ9ULY5 219 aa6.4□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 TMCO1Q9UM00 188 aa6.4□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 PPIL1Q9Y3C6 166 aa6.4□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 WNT6Q9Y6F9 365 aa6.4□□□□□ -1.38
CCL20-202ENST00000409189 TMEM131Q92545 1883 aa6.4□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 MYOFQ9NZM1 2061 aa6.4□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 TRBV5-4A0A0C4DH59 114 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 A0A0G2JND7 137 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 C1orf232A0A0U1RR37 186 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 CLEC18AA5D8T8 446 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 CFAP73A6NFT4 308 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 OR51F1A6NGY5 319 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 ZNF891A8MT65 544 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 TARM1B6A8C7 271 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 SLCO1B7G3V0H7 640 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 K7ERQ8 282 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 CCL22O00626 93 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 BRINP1O60477 761 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 VPS26AO75436 327 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 NDUFS3O75489 264 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 ATP5HO75947 161 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 POP4O95707 220 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 HSPA4LO95757 839 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 MYCLP1P12525 358 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 POLR2EP19388 210 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 ATP5F1P24539 256 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 OPRD1P41143 372 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 EIF2DP41214 584 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 DPP6P42658 865 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 SLC1A6P48664 564 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 MASP1P48740 699 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 NUMBP49757 651 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 STK19P49842 368 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 ARFIP2P53365 341 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 DCDC1P59894 354 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 ABCE1P61221 599 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 SLC25A3Q00325 362 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 PRKAA1Q13131 559 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 ITGA9Q13797 1035 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 RCN2Q14257 317 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 SEMA3AQ14563 771 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 DHCR24Q15392 516 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 GALNTL6Q49A17 601 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 GPR33Q49SQ1 333 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 PREPLQ4J6C6 727 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 CLEC18BQ6UXF7 455 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 SNX20Q7Z614 316 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 MRGPRGQ86SM5 289 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 CAMK1DQ8IU85 385 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 RBFAQ8N0V3 343 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 FSTL5Q8N475 847 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 RYBPQ8N488 228 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 CPA6Q8N4T0 437 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 AFAP1L2Q8N4X5 818 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 PAF1Q8N7H5 531 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 EXD3Q8N9H8 876 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 IL17RCQ8NAC3 791 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 CLEC18CQ8NCF0 446 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 OR5AN1Q8NGI8 311 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 OR6K2Q8NGY2 324 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 RHEBL1Q8TAI7 183 aa6.39□□□□□ -1.39
CCL20-202ENST00000409189 DTX3LQ8TDB6 740 aa6.39□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.5 ms