RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409024.3

POLR1A-202, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 560 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-202ENST00000409024 SPDL1Q96EA4 605 aa9.44□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 PDXPQ96GD0 296 aa9.44□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 MARK4Q96L34 752 aa9.44□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 THTPAQ9BU02 230 aa9.44□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 SARGQ9BW04 601 aa9.44□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM168Q9H0V1 697 aa9.44□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 DUSP15Q9H1R2 295 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 PRDM8Q9NQV8 689 aa9.44□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 FARSBQ9NSD9 589 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM184CQ9NVA4 438 aa9.44□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 C2orf42Q9NWW7 574 aa9.44□□□□□ -0.9
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POLR1A-202ENST00000409024 AHSPQ9NZD4 102 aa9.44□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 ANKMY1Q9P2S6 941 aa9.44□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 TBC1D29Q9UFV1 150 aa9.44□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 GMEB2Q9UKD1 530 aa9.44□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 FBXO4Q9UKT5 387 aa9.44□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 AP3M1Q9Y2T2 418 aa9.44□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 ASPMQ8IZT6 3477 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 FRYQ5TBA9 3013 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 A0A088AWK7 358 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 A0A1W2PPV9 198 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 PIPSLA2A3N6 862 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 CCDC154A6NI56 674 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 K7ESF4 209 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 MRASO14807 208 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 ANKRD28O15084 1053 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 LAMTOR5O43504 91 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 SEMA3DO95025 777 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 CSF2P04141 144 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 G6PDP11413 515 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 CTSEP14091 401 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 CMPK1P30085 196 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 RPL3P39023 403 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 ASMTP46597 345 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 MTTPP55157 894 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 RPL38P63173 70 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 SLC25A3Q00325 362 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 REEP5Q00765 189 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 RELAQ04206 551 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 LRRC74AQ0VAA2 488 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 TBL3Q12788 808 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 EIF2B5Q13144 721 aaKnown RBP9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 FZD2Q14332 565 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 SLBPQ14493 270 aaKnown RBP eCLIP9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 KIR2DS3Q14952 304 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 SGO1Q5FBB7 561 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 WDR45BQ5MNZ6 344 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 TPRG1LQ5T0D9 272 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 ICE2Q659A1 982 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 REP15Q6BDI9 236 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 TMIGD1Q6UXZ0 262 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 BNC2Q6ZN30 1099 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 GK5Q6ZS86 529 aa9.43□□□□□ -0.9
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POLR1A-202ENST00000409024 ARPINQ7Z6K5 226 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 AMIGO1Q86WK6 493 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 NRROSQ86YC3 692 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 ULK2Q8IYT8 1036 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 PHACTR4Q8IZ21 702 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 DEFB107AQ8IZN7 70 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 SLC22A18ASQ8N1D0 253 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 FBXW8Q8N3Y1 598 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 OR52E1Q8NGJ3 308 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 CHTF18Q8WVB6 975 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 TESCQ96BS2 214 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 C11orf24Q96F05 449 aaPredicted RBP9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 TPSD1Q9BZJ3 242 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 DPY30Q9C005 99 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 WDR41Q9HAD4 459 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 SLC52A3Q9NQ40 469 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 AASDHPPTQ9NRN7 309 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 CROTQ9UKG9 612 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 SNX7Q9UNH6 387 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 CA5BQ9Y2D0 317 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa9.43□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 TRBC2A0A5B9 178 aa9.42□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 ANKDD1BA6NHY2 528 aa9.42□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 MEI4A8MW99 385 aa9.42□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 TLR4O00206 839 aa9.42□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 FBP2O00757 339 aa9.42□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 VILLO15195 856 aa9.42□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 MAP3K13O43283 966 aa9.42□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 DNAJA2O60884 412 aa9.42□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 PROS1P07225 676 aa9.42□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 BCKDHAP12694 445 aa9.42□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 CDH1P12830 882 aa9.42□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 NME1P15531 152 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 DDX5P17844 614 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 PRPS1L1P21108 318 aa9.42□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 VARSP26640 1264 aaKnown RBP9.42□□□□□ -0.9
POLR1A-202ENST00000409024 GRK3P35626 688 aa9.42□□□□□ -0.9
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