RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000404162.2

HOXD12-201, Transcript of homeobox D12, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD12, Length 841 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-201ENST00000404162 P2RX6O15547 441 aa18.17■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 SUN1O94901 812 aa18.17■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 PTGS2P35354 604 aa18.17■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 MYBPHQ13203 477 aa18.17■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 CEBPEQ15744 281 aa18.17■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 PARP6Q2NL67 630 aa18.17■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 MINDY4Q4G0A6 757 aa18.17■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 MFSD4BQ5TF39 518 aa18.17■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 SUSD1Q6UWL2 747 aa18.17■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF534Q76KX8 674 aa18.17■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 ANKRD37Q7Z713 158 aa18.17■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 LDB1Q86U70 411 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 OR8K1Q8NGG5 319 aa18.17■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 M1APQ8TC57 530 aa18.17■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 LRRC40Q9H9A6 602 aa18.17■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 KCNJ16Q9NPI9 418 aa18.17■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 GNPTGQ9UJJ9 305 aa18.17■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 SOWAHDA6NJG2 315 aa18.16■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 ZWINTO95229 277 aa18.16■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 CTNNA2P26232 953 aa18.16■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 TMEM211Q6ICI0 200 aa18.16■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 LUZP1Q86V48 1076 aa18.16■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC71Q8IV32 467 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 RPRMLQ8N4K4 120 aa18.16■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 HORMAD2Q8N7B1 307 aa18.16■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 OR9A4Q8NGU2 314 aa18.16■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP18.16■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 DNAJC7Q99615 494 aa18.16■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 OLFM1Q99784 485 aa18.16■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 CDCP1Q9H5V8 836 aa18.16■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 MRPS30Q9NP92 439 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 MMP25Q9NPA2 562 aa18.16■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP18.16■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 IFNKQ9P0W0 207 aa18.16■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 NME2P1O60361 137 aa18.15■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 NME2P22392 152 aa18.15■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 FAM53BQ14153 422 aa18.15■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 NAA25Q14CX7 972 aa18.15■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 TMED2Q15363 201 aa18.15■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 AFTPHQ6ULP2 937 aa18.15■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF227Q86WZ6 799 aa18.15■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 OR4L1Q8NH43 312 aa18.15■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 CCDC42Q96M95 316 aa18.15■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF778Q96MU6 729 aa18.15■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP18.15■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 SPATA7Q9P0W8 599 aa18.15■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa18.15■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa18.14■□□□□ 0.5
HOXD12-201ENST00000404162 PJA2O43164 708 aa18.14■□□□□ 0.49
HOXD12-201ENST00000404162 PHF2O75151 1096 aa18.14■□□□□ 0.49
HOXD12-201ENST00000404162 SLC25A12O75746 678 aa18.14■□□□□ 0.49
HOXD12-201ENST00000404162 STATHP02808 62 aa18.14■□□□□ 0.49
HOXD12-201ENST00000404162 FOSL1P15407 271 aa18.14■□□□□ 0.49
HOXD12-201ENST00000404162 AVPR1BP47901 424 aa18.14■□□□□ 0.49
HOXD12-201ENST00000404162 LTBQ06643 244 aa18.14■□□□□ 0.49
HOXD12-201ENST00000404162 EXT1Q16394 746 aa18.14■□□□□ 0.49
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF425Q6IV72 752 aa18.14■□□□□ 0.49
HOXD12-201ENST00000404162 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
HOXD12-201ENST00000404162 PRSS41Q7RTY9 318 aa18.14■□□□□ 0.49
HOXD12-201ENST00000404162 PLD3Q8IV08 490 aa18.14■□□□□ 0.49
HOXD12-201ENST00000404162 OR52K1Q8NGK4 314 aa18.14■□□□□ 0.49
HOXD12-201ENST00000404162 GSDMBQ8TAX9 411 aa18.14■□□□□ 0.49
HOXD12-201ENST00000404162 RND1Q92730 232 aa18.14■□□□□ 0.49
HOXD12-201ENST00000404162 RERGQ96A58 199 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
HOXD12-201ENST00000404162 ZNF358Q9NW07 568 aa18.14■□□□□ 0.49
HOXD12-201ENST00000404162 PCYOX1Q9UHG3 505 aa18.14■□□□□ 0.49
HOXD12-201ENST00000404162 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP18.14■□□□□ 0.49
HOXD12-201ENST00000404162 H0YIG0 161 aa18.13■□□□□ 0.49
HOXD12-201ENST00000404162 KLK8O60259 260 aa18.13■□□□□ 0.49
HOXD12-201ENST00000404162 CCNFP41002 786 aa18.13■□□□□ 0.49
HOXD12-201ENST00000404162 AGTR2P50052 363 aa18.13■□□□□ 0.49
HOXD12-201ENST00000404162 HADHBP55084 474 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
HOXD12-201ENST00000404162 COPS2P61201 443 aa18.13■□□□□ 0.49
HOXD12-201ENST00000404162 TPM4P67936 248 aa18.13■□□□□ 0.49
HOXD12-201ENST00000404162 FASTKD1Q53R41 847 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
HOXD12-201ENST00000404162 TSTD2Q5T7W7 516 aa18.13■□□□□ 0.49
HOXD12-201ENST00000404162 PTRHD1Q6GMV3 140 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
HOXD12-201ENST00000404162 Q71RC1 249 aaPredicted RBP18.13■□□□□ 0.49
HOXD12-201ENST00000404162 SLC5A8Q8N695 610 aa18.13■□□□□ 0.49
HOXD12-201ENST00000404162 OR6P1Q8NGX9 317 aa18.13■□□□□ 0.49
HOXD12-201ENST00000404162 OR51Q1Q8NH59 317 aa18.13■□□□□ 0.49
HOXD12-201ENST00000404162 OSBPL8Q9BZF1 889 aa18.13■□□□□ 0.49
HOXD12-201ENST00000404162 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP18.13■□□□□ 0.49
HOXD12-201ENST00000404162 INTUQ9ULD6 942 aa18.13■□□□□ 0.49
HOXD12-201ENST00000404162 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP18.13■□□□□ 0.49
HOXD12-201ENST00000404162 MRFAP1Q9Y605 127 aa18.13■□□□□ 0.49
HOXD12-201ENST00000404162 ABCA4P78363 2273 aa18.12■□□□□ 0.49
HOXD12-201ENST00000404162 TXNDC9O14530 226 aa18.12■□□□□ 0.49
HOXD12-201ENST00000404162 PRMT5O14744 637 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
HOXD12-201ENST00000404162 NDC80O14777 642 aa18.12■□□□□ 0.49
HOXD12-201ENST00000404162 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP18.12■□□□□ 0.49
HOXD12-201ENST00000404162 MBD3O95983 291 aa18.12■□□□□ 0.49
HOXD12-201ENST00000404162 CYC1P08574 325 aa18.12■□□□□ 0.49
HOXD12-201ENST00000404162 ERGP11308 486 aa18.12■□□□□ 0.49
HOXD12-201ENST00000404162 TPP2P29144 1249 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
HOXD12-201ENST00000404162 RPA3P35244 121 aaPredicted RBP18.12■□□□□ 0.49
HOXD12-201ENST00000404162 RFC3P40938 356 aa18.12■□□□□ 0.49
HOXD12-201ENST00000404162 XCR1P46094 333 aa18.12■□□□□ 0.49
HOXD12-201ENST00000404162 ADAM8P78325 824 aa18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 85.2 ms