RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000378546.8

FAAP20-202, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAAP20, Length 729 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-202ENST00000378546 MBOAT1Q6ZNC8 495 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-202ENST00000378546 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-202ENST00000378546 LRRC56Q8IYG6 542 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-202ENST00000378546 ATG10Q9H0Y0 220 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-202ENST00000378546 PARVBQ9HBI1 364 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-202ENST00000378546 MKKSQ9NPJ1 570 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-202ENST00000378546 ASF1BQ9NVP2 202 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-202ENST00000378546 PDE10AQ9Y233 779 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-202ENST00000378546 DOCK10Q96BY6 2186 aa24.22■■□□□ 1.47
FAAP20-202ENST00000378546 IGLV3-12A0A075B6K2 115 aa24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-202ENST00000378546 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-202ENST00000378546 IDSB3KWA1 339 aa24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-202ENST00000378546 HRH2P25021 359 aa24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-202ENST00000378546 ELK3P41970 407 aa24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-202ENST00000378546 RPS15AP62244 130 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-202ENST00000378546 RELAQ04206 551 aa24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-202ENST00000378546 EEF1A2Q05639 463 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-202ENST00000378546 NR6A1Q15406 480 aa24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-202ENST00000378546 AGTRAPQ6RW13 159 aa24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-202ENST00000378546 IGDCC3Q8IVU1 814 aa24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-202ENST00000378546 CNTN4Q8IWV2 1026 aa24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-202ENST00000378546 PRR7Q8TB68 274 aa24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-202ENST00000378546 PPP4R1Q8TF05 950 aa24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-202ENST00000378546 MESP1Q9BRJ9 268 aa24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-202ENST00000378546 TMEM184CQ9NVA4 438 aa24.21■■□□□ 1.47
FAAP20-202ENST00000378546 ESPL1Q14674 2120 aa24.2■■□□□ 1.47
FAAP20-202ENST00000378546 CYSRT1A8MQ03 144 aa24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-202ENST00000378546 AHSGP02765 367 aa24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-202ENST00000378546 GABRB3P28472 473 aa24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-202ENST00000378546 IL2P60568 153 aa24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-202ENST00000378546 MFSD4BQ5TF39 518 aa24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-202ENST00000378546 LINC00696Q6ZRV3 163 aa24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-202ENST00000378546 Q6ZS92 163 aa24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-202ENST00000378546 LAPTM4BQ86VI4 370 aa24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-202ENST00000378546 C17orf64Q86WR6 236 aa24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-202ENST00000378546 AMER3Q8N944 861 aa24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-202ENST00000378546 PWWP2AQ96N64 755 aa24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-202ENST00000378546 NAPGQ99747 312 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-202ENST00000378546 TRIM51Q9BSJ1 452 aa24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-202ENST00000378546 TRIM31Q9BZY9 425 aa24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-202ENST00000378546 CSAG2Q9Y5P2 127 aa24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-202ENST00000378546 COPG1Q9Y678 874 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
FAAP20-202ENST00000378546 SLC16A5O15375 505 aa24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-202ENST00000378546 CCND1P24385 295 aa24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-202ENST00000378546 GRK3P35626 688 aa24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-202ENST00000378546 SLC26A3P40879 764 aa24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-202ENST00000378546 ARL4CP56559 192 aa24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-202ENST00000378546 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-202ENST00000378546 NAE1Q13564 534 aa24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-202ENST00000378546 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-202ENST00000378546 SYT16Q17RD7 645 aa24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-202ENST00000378546 EIF2S3LQ2VIR3 472 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-202ENST00000378546 ISLR2Q6UXK2 745 aa24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-202ENST00000378546 CUZD1Q86UP6 607 aa24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-202ENST00000378546 KBTBD2Q8IY47 623 aa24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-202ENST00000378546 DNAJB14Q8TBM8 379 aa24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-202ENST00000378546 TRIM54Q9BYV2 358 aa24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-202ENST00000378546 ARL15Q9NXU5 204 aa24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-202ENST00000378546 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-202ENST00000378546 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-202ENST00000378546 SAR1BQ9Y6B6 198 aa24.19■■□□□ 1.46
FAAP20-202ENST00000378546 FOXS1O43638 330 aa24.18■■□□□ 1.46
FAAP20-202ENST00000378546 GP1BBP13224 206 aa24.18■■□□□ 1.46
FAAP20-202ENST00000378546 PAFAH1B1P43034 410 aa24.18■■□□□ 1.46
FAAP20-202ENST00000378546 ITGA8P53708 1063 aa24.18■■□□□ 1.46
FAAP20-202ENST00000378546 TIAL1Q01085 375 aaKnown RBP eCLIP24.18■■□□□ 1.46
FAAP20-202ENST00000378546 Q0VFX4 171 aa24.18■■□□□ 1.46
FAAP20-202ENST00000378546 FAM53BQ14153 422 aa24.18■■□□□ 1.46
FAAP20-202ENST00000378546 PHKG1Q16816 387 aa24.18■■□□□ 1.46
FAAP20-202ENST00000378546 TEDDM1Q5T9Z0 273 aa24.18■■□□□ 1.46
FAAP20-202ENST00000378546 HECTD2Q5U5R9 776 aa24.18■■□□□ 1.46
FAAP20-202ENST00000378546 FAM45BPQ6NSW5 357 aa24.18■■□□□ 1.46
FAAP20-202ENST00000378546 NDUFAF7Q7L592 441 aa24.18■■□□□ 1.46
FAAP20-202ENST00000378546 OR9A4Q8NGU2 314 aa24.18■■□□□ 1.46
FAAP20-202ENST00000378546 ZCCHC10Q8TBK6 192 aa24.18■■□□□ 1.46
FAAP20-202ENST00000378546 FAM45AQ8TCE6 357 aa24.18■■□□□ 1.46
FAAP20-202ENST00000378546 SNF8Q96H20 258 aa24.18■■□□□ 1.46
FAAP20-202ENST00000378546 AGPAT4Q9NRZ5 378 aa24.18■■□□□ 1.46
FAAP20-202ENST00000378546 MKL2Q9ULH7 1088 aa24.18■■□□□ 1.46
FAAP20-202ENST00000378546 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP24.18■■□□□ 1.46
FAAP20-202ENST00000378546 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
FAAP20-202ENST00000378546 TTI1O43156 1089 aa24.17■■□□□ 1.46
FAAP20-202ENST00000378546 COX6A1P12074 109 aa24.17■■□□□ 1.46
FAAP20-202ENST00000378546 IVDP26440 423 aa24.17■■□□□ 1.46
FAAP20-202ENST00000378546 CDC16Q13042 620 aa24.17■■□□□ 1.46
FAAP20-202ENST00000378546 ATG9BQ674R7 924 aa24.17■■□□□ 1.46
FAAP20-202ENST00000378546 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
FAAP20-202ENST00000378546 HIBCHQ6NVY1 386 aaPredicted RBP24.17■■□□□ 1.46
FAAP20-202ENST00000378546 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
FAAP20-202ENST00000378546 GALNT7Q86SF2 657 aa24.17■■□□□ 1.46
FAAP20-202ENST00000378546 CREG2Q8IUH2 290 aa24.17■■□□□ 1.46
FAAP20-202ENST00000378546 ANKMY2Q8IV38 441 aa24.17■■□□□ 1.46
FAAP20-202ENST00000378546 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
FAAP20-202ENST00000378546 CAMKVQ8NCB2 501 aa24.17■■□□□ 1.46
FAAP20-202ENST00000378546 SSC4DQ8WTU2 575 aa24.17■■□□□ 1.46
FAAP20-202ENST00000378546 LRRC39Q96DD0 335 aa24.17■■□□□ 1.46
FAAP20-202ENST00000378546 RIC8BQ9NVN3 520 aa24.17■■□□□ 1.46
FAAP20-202ENST00000378546 ZFATQ9P243 1243 aa24.17■■□□□ 1.46
FAAP20-202ENST00000378546 SH2B3Q9UQQ2 575 aa24.17■■□□□ 1.46
FAAP20-202ENST00000378546 FEZF1A0PJY2 475 aa24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.1 ms