RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 ARHGEF37A1IGU5 675 aa3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 HTR3EA5X5Y0 456 aa3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 MAGEC1O60732 1142 aa3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 NXPH2O95156 264 aa3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 DUS4LO95620 317 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM58BPP0C7Q3 252 aa3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 PRKAR1AP10644 381 aa3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 EPORP19235 508 aa3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 SFTPDP35247 375 aa3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 CETN2P41208 172 aa3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 SOX3P41225 446 aa3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 PRKCIP41743 596 aa3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 XGP55808 180 aa3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 SULT2A1Q06520 285 aa3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 EFTUD2Q15029 972 aaKnown RBP eCLIP3.32□□□□□ -1.886e-15■■□□□ 13.3
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RABGGTB-202ENST00000370826 SHEQ5VZ18 495 aa3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 FAM166AQ6J272 317 aa3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 CAVIN1Q6NZI2 390 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 GLRX5Q86SX6 157 aa3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 LRTM2Q8N967 370 aa3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 OR6S1Q8NH40 331 aa3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 ST6GALNAC6Q969X2 333 aa3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 BTBD9Q96Q07 612 aa3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 KRT12Q99456 494 aa3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 INPP5KQ9BT40 448 aa3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 PI4K2AQ9BTU6 479 aa3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 EGLN3Q9H6Z9 239 aa3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 PHPT1Q9NRX4 125 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 ELF5Q9UKW6 265 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 ARID2Q68CP9 1835 aa3.32□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa3.31□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 TRAV34A0A0B4J273 112 aa3.31□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa3.31□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 MTMR11A4FU01 709 aa3.31□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 F8VVB4 439 aa3.31□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 F8VWA3 439 aa3.31□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 FCGR3BO75015 233 aa3.31□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 SIX3O95343 332 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 SERPINB2P05120 415 aa3.31□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 CD59P13987 128 aa3.31□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 LBPP18428 481 aa3.31□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 PSMB4P28070 264 aa3.31□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 DUTP33316 252 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 MMP12P39900 470 aa3.31□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 HILS1P60008 231 aa3.31□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 GUCY2DQ02846 1103 aa3.31□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 SGCGQ13326 291 aa3.31□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM132DQ14C87 1099 aa3.31□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 NOTUMQ6P988 496 aa3.31□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 CYB5D1Q6P9G0 228 aa3.31□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 FCRLAQ7L513 359 aa3.31□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 TIGD4Q8IY51 512 aa3.31□□□□□ -1.88
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RABGGTB-202ENST00000370826 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 CCDC63Q8NA47 563 aa3.31□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 SLCO2A1Q92959 643 aa3.31□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 MOCOSQ96EN8 888 aa3.31□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 INTS14Q96SY0 518 aa3.31□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 SYT11Q9BT88 431 aa3.31□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 DGCR6LQ9BY27 220 aa3.31□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 NYXQ9GZU5 481 aa3.31□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 LMAN1LQ9HAT1 526 aa3.31□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 PANK4Q9NVE7 773 aa3.31□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 C5orf52A6NGY3 159 aa3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 WDR46O15213 610 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 FLRT2O43155 660 aa3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 PPIP5K2O43314 1243 aa3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 PGLSO95336 258 aa3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 IGHEP01854 428 aa3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 VIMP08670 466 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 DPEP1P16444 411 aa3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 HLA-FP30511 346 aa3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 TIA1P31483 386 aaKnown RBP eCLIP3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 OR3A2P47893 321 aa3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 CDH18Q13634 790 aa3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 MTF1Q14872 753 aa3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 E2F5Q15329 346 aa3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 TAB1Q15750 504 aa3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 CDO1Q16878 200 aa3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 SPOUT1Q5T280 376 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 ARMC3Q5W041 872 aa3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 BSPRYQ5W0U4 402 aa3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 OR4C11Q6IEV9 310 aa3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 TTC27Q6P3X3 843 aa3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 FUT10Q6P4F1 479 aa3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 SHQ1Q6PI26 577 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 BTNL8Q6UX41 500 aa3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 SLC24A5Q71RS6 500 aa3.3□□□□□ -1.88
RABGGTB-202ENST00000370826 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
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